More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0059 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_0059  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 197 aa  392  1e-108  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.227701 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0855  TetR family transcriptional regulator  85.28 
 
 		 196 aa  331  4e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.179371  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0686  TetR family transcriptional regulator  78.68 
 
 		 197 aa  312  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.863349  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0679  TetR family transcriptional regulator  78.68 
 
 		 197 aa  312  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.192454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0699  TetR family transcriptional regulator  78.68 
 
 		 197 aa  312  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.682068  normal  0.380548 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3721  transcriptional regulator, TetR family  41.86 
 
 		 200 aa  99.4  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.522362  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1488  TetR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 210 aa  95.9  3e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1490  TetR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 210 aa  95.9  3e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1512  TetR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 210 aa  95.9  3e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0106  transcriptional regulator, TetR family  43.52 
 
 		 227 aa  82.8  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5157  putative transcriptional regulator, TetR family  42.59 
 
 		 233 aa  79.3  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23435  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4373  transcriptional regulator, TetR family  32.81 
 
 		 229 aa  71.2  0.000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.335963  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0727  TetR family transcriptional regulator  31.32 
 
 		 205 aa  68.2  0.00000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.329451 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0733  TetR family transcriptional regulator  31.32 
 
 		 205 aa  68.2  0.00000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0614739  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0747  TetR family transcriptional regulator  31.32 
 
 		 205 aa  68.2  0.00000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.15327 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1317  regulatory protein TetR  35.78 
 
 		 232 aa  65.5  0.0000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1797  transcriptional regulator, TetR family  35.24 
 
 		 197 aa  62.4  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000197435  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4591  regulatory protein, TetR  32.74 
 
 		 200 aa  59.3  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0937227  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1405  TetR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 203 aa  58.5  0.00000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.520137 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0455  TetR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 224 aa  58.2  0.00000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  0.106872 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0118  TetR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 247 aa  56.6  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.211628  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3714  transcriptional regulator, TetR family  39.29 
 
 		 226 aa  56.6  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.576002 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33280  transcriptional regulator  32.19 
 
 		 212 aa  57  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.815894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3024  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 197 aa  57  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0109  TetR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 247 aa  56.6  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  40 
 
 		 230 aa  56.6  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0942  TetR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0072348  normal  0.323203 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1791  regulatory protein, TetR  29.3 
 
 		 246 aa  56.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00350194  normal  0.153158 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4400  regulatory protein TetR  33.66 
 
 		 184 aa  56.2  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4624  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 197 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3416  transcriptional regulator, TetR family  39.29 
 
 		 226 aa  55.8  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3793  regulatory protein TetR  37.7 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0700  TetR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 178 aa  55.8  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2704  TetR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 203 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.187148 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1387  transcriptional regulator, TetR family  35.35 
 
 		 213 aa  54.7  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4086  putative transcriptional regulator, TetR family  28.71 
 
 		 237 aa  54.7  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1580  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 195 aa  54.3  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000739015  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3905  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 194 aa  53.9  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1457  transcription regulator, TetR family  43.4 
 
 		 195 aa  54.3  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000222834  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0303  transcriptional regulator, TetR family  48.33 
 
 		 200 aa  53.9  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00708396  normal  0.627467 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6550  transcriptional regulator, TetR family  32.43 
 
 		 200 aa  53.9  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000000124296  normal  0.0144339 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3669  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 243 aa  54.3  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.433868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  28.64 
 
 		 211 aa  53.9  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1317  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 206 aa  53.9  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.237455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1926  TetR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 224 aa  53.9  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.857726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1297  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 206 aa  53.9  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00583227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6979  transcriptional regulator, TetR family  34.29 
 
 		 220 aa  53.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.941023  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1665  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 223 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117381  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6683  putative transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 188 aa  53.9  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0648274  normal  0.237194 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1247  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 206 aa  53.9  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3360  transcriptional regulator, TetR family  45 
 
 		 194 aa  53.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.372466  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1989  transcriptional regulator, TetR family  37.97 
 
 		 216 aa  53.9  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0472  TetR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 206 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.530719 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6912  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 236 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.830717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3656  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 207 aa  52.8  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.311417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3299  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 204 aa  52.8  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.168419 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2796  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 231 aa  53.1  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.252593 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0018  TetR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 196 aa  52.8  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4191  TetR family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 236 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.513173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3533  transcriptional regulator, TetR family  42.42 
 
 		 211 aa  52.8  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.1353  normal  0.182077 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5600  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 279 aa  53.1  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0144285  hitchhiker  0.006631 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3111  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 210 aa  52.8  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0123  regulatory protein, TetR  28.65 
 
 		 187 aa  52.8  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.156619  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4515  transcriptional regulator, TetR family  47.22 
 
 		 191 aa  53.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3352  TetR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 211 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0987  regulatory protein TetR  31.67 
 
 		 192 aa  53.1  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.383045  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3271  transcriptional regulator, TetR family  34.29 
 
 		 201 aa  52.8  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.377871  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5507  transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 		 219 aa  52.4  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1327  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 204 aa  52.4  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.15266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3587  TetR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 206 aa  52.4  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1372  TetR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 212 aa  52.4  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027491 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2606  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 206 aa  52.4  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.613239  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0499  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 206 aa  52.4  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2581  regulatory protein, TetR  32.71 
 
 		 197 aa  52.4  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.155315 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1327  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 191 aa  52.4  0.000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00385081  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3206  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  52.94 
 
 		 218 aa  52  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2881  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  52.94 
 
 		 218 aa  52  0.000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.531949 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3066  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  52.94 
 
 		 218 aa  52  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.283852  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1775  transcriptional regulator, TetR family  35.38 
 
 		 255 aa  51.6  0.000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0532  TetR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 424 aa  52  0.000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3234  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 228 aa  52  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.20483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3223  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 228 aa  52  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1473  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 187 aa  52  0.000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3285  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 228 aa  52  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.678887  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0041  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 206 aa  51.6  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.218146 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0969  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 195 aa  51.6  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.610377  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5257  transcriptional regulator, TetR family  41.54 
 
 		 194 aa  51.6  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.570583  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2113  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 207 aa  51.6  0.000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.918403  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1571  TetR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 207 aa  51.2  0.000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0429  TetR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 213 aa  51.6  0.000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0148562 
 
 
-
 
NC_003296  RS05643  putative transcription regulator protein  45.1 
 
 		 233 aa  51.2  0.000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6808  TetR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 200 aa  51.2  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1458  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 209 aa  51.2  0.000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121951 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1142  transcriptional regulator, TetR family  45.28 
 
 		 202 aa  51.2  0.000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.180703  normal  0.158777 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6941  transcriptional regulator, TetR family  49.06 
 
 		 221 aa  51.2  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 231 aa  50.8  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0441  TetR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 233 aa  50.8  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5306  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 219 aa  50.8  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.190126 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0995  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 190 aa  50.8  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.713352  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2986  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 216 aa  50.8  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.741715  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>