More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1989 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1989  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 216 aa  419  1e-116  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4216  transcriptional regulator, TetR family  28.92 
 
 		 215 aa  75.5  0.0000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1457  transcription regulator, TetR family  35.9 
 
 		 195 aa  66.2  0.0000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000222834  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1580  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 195 aa  66.2  0.0000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000739015  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1327  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 191 aa  65.5  0.0000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00385081  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2460  transcriptional regulator, TetR family  43.3 
 
 		 214 aa  65.5  0.0000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.953634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5175  putative transcriptional regulator, TetR family  37.96 
 
 		 205 aa  63.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0125916  hitchhiker  0.00846982 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5563  transcriptional regulator, TetR family  34.69 
 
 		 246 aa  63.2  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.811394 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0455  TetR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 224 aa  62.8  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  0.106872 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2165  putative transcriptional regulator, TetR family  48.61 
 
 		 215 aa  62  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.367605  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0267  transcriptional regulator, TetR family  36.8 
 
 		 217 aa  62  0.000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.173198  hitchhiker  0.00351225 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1677  transcriptional regulator, TetR family  61.7 
 
 		 257 aa  61.6  0.000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.981661 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2372  transcriptional regulator, TetR family  39.33 
 
 		 236 aa  60.5  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1420  transcriptional regulator, TetR family  41.98 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4583  putative transcriptional regulator, TetR family  42.22 
 
 		 200 aa  60.8  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal  0.302497 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0350  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 194 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.378963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2237  transcriptional regulator, TetR family  30.06 
 
 		 214 aa  58.9  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00985462  hitchhiker  0.00000967235 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4194  TetR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7123  TetR family transcriptional regulator  50.85 
 
 		 200 aa  57.4  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0102  transcriptional regulator, TetR family  30.91 
 
 		 192 aa  57.4  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.351493 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0103  transcriptional regulator, TetR family  27.87 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0203  regulatory protein TetR  42.67 
 
 		 186 aa  57.8  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.041689  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2293  TetR family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 204 aa  57.8  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0989  TetR family transcriptional regulator  40.22 
 
 		 199 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1157  TetR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 215 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225528  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3684  TetR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 202 aa  57  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06680  transcriptional regulator  28.73 
 
 		 200 aa  57  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4596  TetR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 204 aa  57  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3111  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2044  transcriptional regulator, TetR family  36.94 
 
 		 217 aa  57  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0384  TetR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 191 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1711  putative transcriptional regulator, TetR family  31.76 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.195446 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6254  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170118  normal  0.0153866 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6941  transcriptional regulator, TetR family  43.94 
 
 		 221 aa  56.2  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12528  TetR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0275989 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8103  transcriptional regulator, TetR family  43.94 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2883  transcriptional regulator, TetR family  34.53 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.256454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  41.38 
 
 		 218 aa  55.1  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1438  transcriptional regulator, TetR family  33.97 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.716565  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1149  transcriptional regulator, TetR family protein  42.59 
 
 		 226 aa  55.1  0.0000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01892  transcription regulator protein  33.73 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00576188  normal  0.449964 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0550  TetR family transcriptional regulator  50.88 
 
 		 229 aa  55.1  0.0000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.345828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0855  TetR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.179371  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0022  transcriptional regulator, TetR family  43.75 
 
 		 224 aa  55.1  0.0000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27670  transcriptional regulator  39.24 
 
 		 254 aa  54.3  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.208365 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13530  transcriptional regulator, TetR family  52.27 
 
 		 186 aa  54.3  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00114254  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3846  transcriptional regulator, TetR family  28.9 
 
 		 206 aa  54.7  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.213396  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4296  transcriptional regulator, TetR family  32.65 
 
 		 212 aa  54.3  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4006  transcriptional regulator, TetR family  46.43 
 
 		 202 aa  54.7  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3184  TetR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 207 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.13539  normal  0.42811 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1372  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027491 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1759  transcriptional regulator, TetR family  37.93 
 
 		 217 aa  53.9  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30260  transcriptional regulator  41.67 
 
 		 400 aa  53.9  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.473296 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3722  TetR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 202 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.869277  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4245  regulatory protein, TetR  38.14 
 
 		 221 aa  53.5  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933468  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3795  TetR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 202 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.796114  normal  0.124585 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3734  TetR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 202 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0165853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0059  TetR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 197 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.227701 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2460  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 201 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.315446  normal  0.37249 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1571  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 207 aa  53.5  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2071  TetR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 206 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.51999  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1027  transcriptional regulator, TetR family  39.47 
 
 		 201 aa  53.1  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1317  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 206 aa  53.1  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.237455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1297  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 206 aa  53.1  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00583227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2341  TetR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 206 aa  53.5  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.554096 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1156  TetR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 192 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00478832  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3836  transcriptional regulator, TetR family  37.66 
 
 		 192 aa  53.1  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.410307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3333  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 201 aa  53.1  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4397  transcriptional regulator, TetR family  28.82 
 
 		 209 aa  53.1  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5173  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 194 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.319514 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3845  transcriptional regulator, TetR family  43.33 
 
 		 209 aa  52.8  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00359694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0974  regulatory protein, TetR  37.65 
 
 		 205 aa  52.8  0.000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1247  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 206 aa  52.8  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2116  transcriptional regulator, TetR family  31.71 
 
 		 192 aa  52.8  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1039  TetR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 201 aa  52.8  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.747573 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2856  TetR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 194 aa  52.8  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.661308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1326  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 205 aa  52.8  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.892925  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1909  transcriptional regulator, TetR family  25.38 
 
 		 197 aa  52.8  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3877  TetR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 223 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.208498 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0274  transcriptional regulator, TetR family  45.31 
 
 		 192 aa  52.4  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.160629  normal  0.0104752 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4429  TetR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 197 aa  52.4  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.679698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4244  TetR family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 212 aa  52.4  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.950938  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5054  putative transcriptional regulator, TetR family  37.35 
 
 		 201 aa  52.4  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.613298 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0686  TetR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 197 aa  52.4  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.863349  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0699  TetR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 197 aa  52.4  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.682068  normal  0.380548 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0679  TetR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 197 aa  52.4  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.192454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1965  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 206 aa  52  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0526053  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3656  TetR family transcriptional regulator  34 
 
 		 207 aa  52  0.000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.311417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3545  transcriptional regulator, TetR family  37.66 
 
 		 192 aa  52  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0994  transcriptional regulator, TetR family  32.67 
 
 		 271 aa  52  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0665  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 195 aa  52  0.000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1291  transcriptional regulator, TetR family  46.3 
 
 		 190 aa  52  0.000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.170651  normal  0.326718 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0868  transcriptional regulator, TetR family  38.18 
 
 		 222 aa  52  0.000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000486929  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3896  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 202 aa  52  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673039  normal  0.0314346 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 223 aa  51.6  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2634  TetR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 209 aa  51.6  0.000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.001775  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0334  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 226 aa  51.6  0.000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.202617  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4265  TetR/AcrR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 228 aa  51.6  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.752062  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0257  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 183 aa  51.2  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.115958 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>