More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2293 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2293  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 204 aa  419  1e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009719  Plav_2292  TetR family transcriptional regulator  48.26 
 
 		 208 aa  189  2e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4478  transcriptional regulator, TetR family  33.5 
 
 		 211 aa  99.8  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4487  transcriptional regulator, TetR family  31.37 
 
 		 207 aa  96.7  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4516  transcriptional regulator, TetR family  31.37 
 
 		 207 aa  96.7  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0542  transcriptional regulator, TetR family  33.69 
 
 		 210 aa  94  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.669667 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 213 aa  85.1  6e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6667  TetR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 217 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.33995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4471  transcriptional regulator, TetR family  32.62 
 
 		 220 aa  82.8  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5823  TetR family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 217 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6188  TetR family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 217 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.301672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4103  regulatory protein TetR  32.62 
 
 		 220 aa  81.6  0.000000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.557347 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4585  transcriptional regulator, TetR family  34.76 
 
 		 220 aa  80.9  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.448621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6562  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 210 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.67895  normal  0.0476005 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 234 aa  79.7  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6768  transcriptional regulator, TetR family  32.78 
 
 		 221 aa  79.3  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3727  TetR family transcriptional regulator  33.84 
 
 		 203 aa  79  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000227076 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7734  TetR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 217 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0292  TetR family transcriptional regulator  32.83 
 
 		 203 aa  78.6  0.00000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000414466 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0292  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 203 aa  77.8  0.00000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000945067 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0297  TetR family transcriptional regulator  33 
 
 		 203 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1222  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 204 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3443  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 212 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.61751 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0792  TetR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 212 aa  77  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3113  TetR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 214 aa  74.7  0.0000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.527228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00486  transcriptional regulator, TetR family protein  32.08 
 
 		 224 aa  74.7  0.0000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007952  Bxe_B2650  TetR family transcriptional regulator  35.5 
 
 		 195 aa  74.7  0.0000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6158  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 212 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.488727  normal  0.104212 
 
 
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NC_010681  Bphyt_1885  transcriptional regulator, TetR family  33.52 
 
 		 204 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.393011  normal  0.0927704 
 
 
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NC_007912  Sde_1924  TetR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 210 aa  73.6  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.343626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4306  TetR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 202 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.651969  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0450  TetR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 201 aa  72.4  0.000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1709  transcriptional regulator, TetR family  32.53 
 
 		 203 aa  72.4  0.000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.922562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8267  putative transcriptional regulator, TetR family  32.51 
 
 		 209 aa  70.9  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  33.15 
 
 		 218 aa  71.2  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
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NC_010002  Daci_3953  TetR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 232 aa  70.1  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396138  normal  0.024229 
 
 
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NC_007794  Saro_1034  TetR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 204 aa  70.5  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1313  transcriptional regulator TetR family  31.02 
 
 		 213 aa  69.7  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5999  transcriptional regulator, TetR family  32.7 
 
 		 215 aa  70.5  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010623  Bphy_5419  TetR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 211 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.752491  normal  0.799332 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1511  TetR family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 225 aa  69.7  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 222 aa  68.9  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4666  TetR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 214 aa  68.9  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.441468  normal  1 
 
 
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NC_013456  VEA_003358  transcriptional regulator  25.5 
 
 		 251 aa  68.9  0.00000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.433364  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1358  TetR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 202 aa  68.6  0.00000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2256  TetR family transcriptional regulator  33.13 
 
 		 207 aa  68.2  0.00000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0681818  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3324  regulatory protein, TetR  27.55 
 
 		 204 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0882884 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0299  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 202 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_003296  RS01892  transcription regulator protein  28.43 
 
 		 207 aa  66.6  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00576188  normal  0.449964 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3549  transcriptional regulator AefR  28.06 
 
 		 200 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.695719  n/a   
 
 
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NC_011004  Rpal_4313  transcriptional regulator, TetR family  30.49 
 
 		 238 aa  66.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5246  TetR family transcriptional regulator  24.31 
 
 		 192 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1138  TetR family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 228 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1019  TetR family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 200 aa  66.6  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05643  putative transcription regulator protein  31.47 
 
 		 233 aa  66.2  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0106  transcriptional regulator  32.87 
 
 		 207 aa  66.2  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1979  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 216 aa  65.9  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28862  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00902  transcription regulator protein  38.1 
 
 		 209 aa  65.9  0.0000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.806346  normal  0.603909 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0109  TetR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 207 aa  65.1  0.0000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3407  TetR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 218 aa  65.1  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0155576  normal  0.84746 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6537  transcriptional regulator, TetR family  37.41 
 
 		 230 aa  64.7  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.563628  normal  0.0265458 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 244 aa  64.7  0.0000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6189  TetR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 210 aa  63.5  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304814  normal  0.805788 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4062  transcriptional regulator, TetR family  29.66 
 
 		 216 aa  63.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3451  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 216 aa  63.5  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.6413 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3185  TetR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 208 aa  63.5  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3669  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 243 aa  63.2  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.433868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0199  transcriptional regulator, TetR family  30.73 
 
 		 202 aa  62.4  0.000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.251087  normal  0.943452 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1312  TetR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.278349  normal  0.387509 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3984  transcriptional regulator, TetR family  32.56 
 
 		 216 aa  62.8  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.765993  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0737  transcriptional regulator, TetR family  28.11 
 
 		 209 aa  62.4  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8100  transcriptional regulator, TetR family  30.39 
 
 		 218 aa  62.8  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.978856  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2925  TetR family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 259 aa  62.4  0.000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2113  transcriptional regulator, TetR family  52.38 
 
 		 207 aa  62  0.000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.918403  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3880  transcriptional regulator, TetR family  30.46 
 
 		 217 aa  62.4  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.133053 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  30.14 
 
 		 226 aa  62  0.000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4680  transcriptional regulator, TetR family  28.31 
 
 		 236 aa  62.4  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1045  TetR family transcriptional regulator  26.99 
 
 		 226 aa  62  0.000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446098  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0118  TetR family transcriptional regulator  25.39 
 
 		 247 aa  62  0.000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.211628  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1869  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 215 aa  62  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0109  TetR family transcriptional regulator  25.39 
 
 		 247 aa  62  0.000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0602  TetR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 205 aa  61.6  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.5525  normal  0.406937 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3129  transcriptional regulator, TetR family  27.71 
 
 		 191 aa  61.6  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1276  transcriptional regulator, TetR family  36.29 
 
 		 214 aa  61.6  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933053  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1601  TetR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5306  TetR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 219 aa  61.2  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.190126 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1421  TetR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 190 aa  60.8  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.216023 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0805  TetR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 204 aa  60.8  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1848  TetR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0533  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 208 aa  61.2  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0518509 
 
 
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NC_008347  Mmar10_2108  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 207 aa  60.8  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1142  TetR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.282615  normal  0.594609 
 
 
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NC_007958  RPD_1791  regulatory protein, TetR  27.87 
 
 		 246 aa  60.5  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00350194  normal  0.153158 
 
 
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NC_011988  Avi_5949  transcriptional regulator TetR family  30.95 
 
 		 250 aa  60.5  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02619  transcriptional regulator  28.21 
 
 		 217 aa  60.5  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010501  PputW619_4103  TetR family transcriptional regulator  24.1 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009439  Pmen_3352  TetR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  1 
 
 
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NC_008751  Dvul_0496  TetR family transcriptional regulator  24.62 
 
 		 202 aa  59.7  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.250936 
 
 
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NC_007492  Pfl01_1078  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011892  Mnod_8304  transcriptional regulator, TetR family  27.55 
 
 		 223 aa  58.9  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.505381  n/a   
 
 
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