More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0299 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



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PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009092  Shew_0299  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
202 aa  410  1e-114  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0450  TetR family transcriptional regulator  61.69 
 
 
201 aa  260  1e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1709  transcriptional regulator, TetR family  43.59 
 
 
203 aa  155  3e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.922562  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5419  TetR family transcriptional regulator  39.38 
 
 
211 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.752491  normal  0.799332 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1885  transcriptional regulator, TetR family  39.38 
 
 
204 aa  150  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.393011  normal  0.0927704 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1358  TetR family transcriptional regulator  40.5 
 
 
202 aa  149  3e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1222  TetR family transcriptional regulator  38.34 
 
 
204 aa  149  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7734  TetR family transcriptional regulator  38.86 
 
 
217 aa  149  4e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2650  TetR family transcriptional regulator  38.86 
 
 
195 aa  147  8e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6667  TetR family transcriptional regulator  38.34 
 
 
217 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.33995  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5823  TetR family transcriptional regulator  37.82 
 
 
217 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3727  TetR family transcriptional regulator  41.87 
 
 
203 aa  143  1e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  unclonable  0.0000227076 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6188  TetR family transcriptional regulator  37.82 
 
 
217 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.301672  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0292  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 
203 aa  142  3e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000945067 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0292  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 
203 aa  142  4e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000414466 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0109  TetR family transcriptional regulator  38.14 
 
 
207 aa  136  2e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4306  TetR family transcriptional regulator  34.2 
 
 
202 aa  134  8e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.651969  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0297  TetR family transcriptional regulator  39.59 
 
 
203 aa  132  5e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3324  regulatory protein, TetR  35.23 
 
 
204 aa  130  9e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0882884 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3865  transcriptional regulator, TetR family protein  36.14 
 
 
205 aa  129  3e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3549  transcriptional regulator AefR  34.2 
 
 
200 aa  128  6e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.695719  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1924  TetR family transcriptional regulator  37.82 
 
 
210 aa  128  6e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.343626  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6158  TetR family transcriptional regulator  37.44 
 
 
212 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.488727  normal  0.104212 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5760  TetR family transcriptional regulator  38.86 
 
 
208 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.327742  normal  0.559912 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6005  TetR family transcriptional regulator  38.34 
 
 
208 aa  124  7e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.695496  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02663  transcriptional regulator  33.17 
 
 
204 aa  120  9.999999999999999e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0806616  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06672  hypothetical protein  32.12 
 
 
198 aa  120  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0792  TetR family transcriptional regulator  36.52 
 
 
212 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0035  putative transcriptional regulator, TetR family  31 
 
 
202 aa  107  1e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0736  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 
198 aa  105  3e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1346  TetR family transcriptional regulator  34.69 
 
 
209 aa  103  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4478  transcriptional regulator, TetR family  29.95 
 
 
211 aa  90.1  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02619  transcriptional regulator  31.79 
 
 
217 aa  89.7  3e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6189  TetR family transcriptional regulator  29.32 
 
 
210 aa  83.2  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304814  normal  0.805788 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  44.07 
 
 
222 aa  80.9  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8103  transcriptional regulator, TetR family  31.65 
 
 
223 aa  76.3  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2113  transcriptional regulator, TetR family  30.85 
 
 
207 aa  75.9  0.0000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.918403  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8267  putative transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 
209 aa  75.5  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3407  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 
218 aa  75.5  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0155576  normal  0.84746 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  33.73 
 
 
218 aa  74.3  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 
213 aa  74.3  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2329  TetR family transcriptional regulator  31.85 
 
 
221 aa  73.6  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1979  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 
216 aa  73.2  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28862  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2179  TetR family transcriptional regulator  30.21 
 
 
218 aa  72  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_003296  RS01892  transcription regulator protein  30.43 
 
 
207 aa  71.2  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00576188  normal  0.449964 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4516  transcriptional regulator, TetR family  27.92 
 
 
207 aa  70.9  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2507  TetR family transcriptional regulator  29.86 
 
 
207 aa  71.2  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.881075  normal  0.842438 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0542  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 
210 aa  70.9  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.669667 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1443  transcriptional regulator, TetR family  30.69 
 
 
204 aa  70.5  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.79888  n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4487  transcriptional regulator, TetR family  27.92 
 
 
207 aa  70.9  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2292  TetR family transcriptional regulator  28.96 
 
 
208 aa  70.1  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6137  TetR family transcriptional regulator  29.86 
 
 
207 aa  70.5  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.150449  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0106  transcriptional regulator  32.28 
 
 
207 aa  68.9  0.00000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5954  transcriptional regulator TetR family  28.64 
 
 
219 aa  68.2  0.00000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2293  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 
204 aa  67.8  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4190  transcriptional regulator, TetR family  36.51 
 
 
200 aa  66.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.378174  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4150  transcriptional regulator, TetR family  36.51 
 
 
200 aa  66.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  29.47 
 
 
244 aa  66.2  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3451  TetR family transcriptional regulator  25.79 
 
 
216 aa  66.2  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.6413 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1019  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 
200 aa  65.9  0.0000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4680  transcriptional regulator, TetR family  30.73 
 
 
236 aa  65.9  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3341  transcriptional regulator, TetR family  31.34 
 
 
226 aa  65.5  0.0000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3827  putative transcriptional regulator  26.4 
 
 
216 aa  65.5  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4062  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 
216 aa  64.7  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44980  TetR family transcriptional regulator  26.29 
 
 
216 aa  64.7  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00902  transcription regulator protein  33.6 
 
 
209 aa  63.9  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.806346  normal  0.603909 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5077  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 
212 aa  63.9  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5086  transcriptional regulator, TetR family  31.98 
 
 
210 aa  63.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.423561  normal  0.0707297 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6001  transcriptional regulator, TetR family  29.19 
 
 
224 aa  64.7  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.903994  normal  0.20153 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4666  TetR family transcriptional regulator  28.43 
 
 
214 aa  64.3  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.441468  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00486  transcriptional regulator, TetR family protein  39.84 
 
 
224 aa  63.2  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3126  TetR family transcriptional regulator  29.33 
 
 
207 aa  63.2  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.333802  hitchhiker  0.00150199 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  26.56 
 
 
230 aa  63.5  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1313  TetR family transcriptional regulator  32.08 
 
 
203 aa  63.5  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4844  transcriptional regulator, TetR family  26.57 
 
 
252 aa  63.9  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4265  TetR/AcrR family transcriptional regulator  27.55 
 
 
228 aa  63.2  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.752062  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3111  TetR family transcriptional regulator  54.39 
 
 
210 aa  63.2  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2309  transcriptional regulator, TetR family  31.29 
 
 
204 aa  62.4  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.601552  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7149  transcriptional regulator, TetR family  26.34 
 
 
224 aa  62.4  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1149  transcriptional regulator, TetR family protein  56.9 
 
 
226 aa  62.4  0.000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0570  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
209 aa  62.8  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1571  TetR family transcriptional regulator  43.82 
 
 
207 aa  62.4  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4471  transcriptional regulator, TetR family  30.37 
 
 
220 aa  62.4  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4585  transcriptional regulator, TetR family  30.89 
 
 
220 aa  62  0.000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.448621  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1824  TetR family transcriptional regulator  27.55 
 
 
224 aa  62  0.000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.87921  normal  0.175095 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0118  TetR family transcriptional regulator  27.18 
 
 
247 aa  62  0.000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.211628  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3698  transcriptional regulator, TetR family  27.04 
 
 
202 aa  62  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0109  TetR family transcriptional regulator  27.18 
 
 
247 aa  62  0.000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0929  TetR family transcriptional regulator  46.38 
 
 
205 aa  61.6  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.99421  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3185  TetR family transcriptional regulator  27.18 
 
 
208 aa  61.2  0.000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4103  regulatory protein TetR  30.37 
 
 
220 aa  61.2  0.000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.557347 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1276  transcriptional regulator, TetR family  27.32 
 
 
214 aa  60.8  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933053  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1553  regulatory protein, TetR  33.03 
 
 
234 aa  60.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2443  transcriptional regulator, TetR family  24.23 
 
 
237 aa  60.5  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0506357 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3179  TetR family transcriptional regulator  24.87 
 
 
228 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.30038  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3347  regulatory protein, TetR  27.93 
 
 
205 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235212  normal  0.0210246 
 
 
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NC_011094  SeSA_A3312  transcriptional regulator UidR  32.26 
 
 
198 aa  60.1  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_007530  GBAA_3654  TetR family transcriptional regulator  43.42 
 
 
197 aa  60.1  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.786622  n/a   
 
 
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NC_009512  Pput_2247  TetR family transcriptional regulator  28.07 
 
 
227 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_011773  BCAH820_3605  transcriptional regulator, TetR family  43.42 
 
 
197 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.02462e-25 
 
 
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