More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_4306 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_4306  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 202 aa  417  1e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.651969  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6667  TetR family transcriptional regulator  63.32 
 
 		 217 aa  258  4e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.33995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5419  TetR family transcriptional regulator  63.59 
 
 		 211 aa  256  1e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.752491  normal  0.799332 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5823  TetR family transcriptional regulator  62.31 
 
 		 217 aa  256  2e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6188  TetR family transcriptional regulator  62.31 
 
 		 217 aa  256  2e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.301672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1709  transcriptional regulator, TetR family  58.5 
 
 		 203 aa  251  4.0000000000000004e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.922562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7734  TetR family transcriptional regulator  59.3 
 
 		 217 aa  251  7e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3324  regulatory protein, TetR  58.91 
 
 		 204 aa  250  9.000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0882884 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1885  transcriptional regulator, TetR family  61.31 
 
 		 204 aa  245  4e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.393011  normal  0.0927704 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2650  TetR family transcriptional regulator  60.31 
 
 		 195 aa  241  3.9999999999999997e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6158  TetR family transcriptional regulator  59.3 
 
 		 212 aa  241  3.9999999999999997e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.488727  normal  0.104212 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3549  transcriptional regulator AefR  58.88 
 
 		 200 aa  241  5e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.695719  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1222  TetR family transcriptional regulator  59.39 
 
 		 204 aa  237  1e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0109  TetR family transcriptional regulator  56.12 
 
 		 207 aa  227  1e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5760  TetR family transcriptional regulator  62.37 
 
 		 208 aa  221  4.9999999999999996e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.327742  normal  0.559912 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1924  TetR family transcriptional regulator  53.3 
 
 		 210 aa  221  7e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.343626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6005  TetR family transcriptional regulator  61.86 
 
 		 208 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.695496  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1358  TetR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 202 aa  159  2e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0297  TetR family transcriptional regulator  38.5 
 
 		 203 aa  136  2e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0292  TetR family transcriptional regulator  39.79 
 
 		 203 aa  136  2e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000945067 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0299  TetR family transcriptional regulator  34.2 
 
 		 202 aa  134  8e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0292  TetR family transcriptional regulator  39.27 
 
 		 203 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000414466 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0450  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 201 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3727  TetR family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 203 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000227076 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3865  transcriptional regulator, TetR family protein  35.5 
 
 		 205 aa  125  6e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02663  transcriptional regulator  36.78 
 
 		 204 aa  122  3e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0806616  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06672  hypothetical protein  34.18 
 
 		 198 aa  122  5e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1346  TetR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 209 aa  110  1.0000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0792  TetR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 212 aa  105  4e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0736  TetR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 198 aa  99  4e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0035  putative transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 		 202 aa  90.1  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3113  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 214 aa  84.7  7e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.527228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2329  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 221 aa  84.7  7e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4516  transcriptional regulator, TetR family  31.31 
 
 		 207 aa  84.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4487  transcriptional regulator, TetR family  31.31 
 
 		 207 aa  84.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3451  TetR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 216 aa  84.3  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.6413 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3576  TetR-like virulence regulator  34.31 
 
 		 207 aa  81.6  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4478  transcriptional regulator, TetR family  32.16 
 
 		 211 aa  82  0.000000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1544  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 219 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0097  transcriptional regulator, TetR family  35.32 
 
 		 215 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.56928  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3341  transcriptional regulator, TetR family  36.31 
 
 		 226 aa  79.7  0.00000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2292  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 208 aa  79  0.00000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02619  transcriptional regulator  31.6 
 
 		 217 aa  78.2  0.00000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012669  Bcav_0542  transcriptional regulator, TetR family  32.24 
 
 		 210 aa  77.4  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.669667 
 
 
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NC_013947  Snas_5925  transcriptional regulator, TetR family  33.02 
 
 		 211 aa  75.9  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007413  Ava_0602  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 205 aa  75.9  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.5525  normal  0.406937 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1142  TetR family transcriptional regulator  30.35 
 
 		 210 aa  75.1  0.0000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.282615  normal  0.594609 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  38.71 
 
 		 222 aa  74.7  0.0000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5999  transcriptional regulator, TetR family  30.99 
 
 		 215 aa  73.6  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3129  transcriptional regulator, TetR family  29.07 
 
 		 191 aa  73.2  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2293  TetR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 204 aa  73.2  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3352  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 211 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6912  TetR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 236 aa  72  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.830717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3347  regulatory protein, TetR  31.1 
 
 		 205 aa  71.6  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235212  normal  0.0210246 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2113  transcriptional regulator, TetR family  29.5 
 
 		 207 aa  71.6  0.000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.918403  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0056  transcriptional regulator, TetR family  31.07 
 
 		 198 aa  71.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01892  transcription regulator protein  30.43 
 
 		 207 aa  70.5  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00576188  normal  0.449964 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0050  TetR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 210 aa  70.5  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1553  regulatory protein, TetR  27.94 
 
 		 234 aa  70.5  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2624  TetR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 214 aa  70.5  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.373378  normal  0.716878 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2089  transcriptional regulator, TetR family  31.94 
 
 		 220 aa  69.7  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0021127  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8267  putative transcriptional regulator, TetR family  35.4 
 
 		 209 aa  69.7  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 256 aa  69.3  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0533  TetR family transcriptional regulator  29 
 
 		 208 aa  68.9  0.00000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0518509 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1019  TetR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 200 aa  68.9  0.00000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8304  transcriptional regulator, TetR family  28.35 
 
 		 223 aa  68.6  0.00000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.505381  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4190  transcriptional regulator, TetR family  34.48 
 
 		 200 aa  68.2  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.378174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4680  transcriptional regulator, TetR family  39.32 
 
 		 236 aa  68.2  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4150  transcriptional regulator, TetR family  34.48 
 
 		 200 aa  68.2  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1119  TetR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 213 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3410  TetR family transcriptional regulator  26.2 
 
 		 196 aa  66.2  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000655293  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2963  TetR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 189 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.412295 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2432  transcriptional regulator, TetR family  29.9 
 
 		 220 aa  65.9  0.0000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0652024 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 244 aa  65.9  0.0000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1187  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 221 aa  65.5  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.49367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1059  TetR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 211 aa  65.5  0.0000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6189  TetR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 210 aa  65.5  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304814  normal  0.805788 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2740  TetR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 257 aa  65.1  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.933804 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1128  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  31.03 
 
 		 227 aa  65.1  0.0000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000181094 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0737  transcriptional regulator, TetR family  32.24 
 
 		 209 aa  65.1  0.0000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  33.12 
 
 		 218 aa  65.1  0.0000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1461  putative transcriptional regulator  29.06 
 
 		 212 aa  64.7  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1600  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 201 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0652187  normal  0.362821 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26580  transcriptional regulator, TetR family  25.63 
 
 		 205 aa  64.7  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0994293 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3407  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 218 aa  64.3  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0155576  normal  0.84746 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2948  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 191 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2992  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 191 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.385096  normal  0.373192 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0833  TetR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 190 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4044  TetR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 214 aa  63.9  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4208  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 213 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.826614 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3317  TetR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 214 aa  63.9  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.305506  n/a   
 
 
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NC_013947  Snas_5077  transcriptional regulator, TetR family  35.62 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007958  RPD_3815  regulatory protein, TetR  28.9 
 
 		 252 aa  63.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00651597  normal  1 
 
 
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NC_010338  Caul_3185  TetR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 208 aa  63.9  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal  1 
 
 
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NC_002947  PP_1515  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 213 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013205  Aaci_0092  transcriptional regulator, TetR family  30.34 
 
 		 207 aa  62.8  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00302716  n/a   
 
 
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NC_007778  RPB_1979  TetR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 216 aa  62.8  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28862  normal  1 
 
 
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NC_007925  RPC_2179  TetR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 218 aa  62.8  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.905523 
 
 
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NC_008463  PA14_16790  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297454  normal  1 
 
 
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NC_011004  Rpal_3721  transcriptional regulator, TetR family  28.16 
 
 		 260 aa  62.8  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249433  n/a   
 
 
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