More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_2992 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2948  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 191 aa  379  1e-104  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2992  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 191 aa  379  1e-104  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.385096  normal  0.373192 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2963  TetR family transcriptional regulator  96.81 
 
 		 189 aa  362  2e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.412295 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3506  TetR family transcriptional regulator  63.19 
 
 		 195 aa  218  3e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  0.0873465 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3287  TetR family transcriptional regulator  63.49 
 
 		 195 aa  215  4e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.443656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2454  TetR family transcriptional regulator  46.49 
 
 		 185 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3998  transcriptional regulator, TetR family  37.58 
 
 		 245 aa  86.3  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000456955  normal  0.178314 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3021  TetR family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 194 aa  85.9  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49231  normal  0.167388 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3006  TetR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 194 aa  83.2  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313875  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3052  TetR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 194 aa  83.2  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7472  transcriptional regulator, TetR family  32.39 
 
 		 228 aa  79  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5089  putative transcriptional regulator, TetR family  33.5 
 
 		 210 aa  77.8  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4359  transcriptional regulator, TetR family  33.7 
 
 		 205 aa  76.3  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3148  TetR family transcriptional regulator  35.08 
 
 		 231 aa  76.3  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.647957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3176  transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 		 193 aa  75.9  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00199059 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3111  transcriptional regulator, TetR family  36.51 
 
 		 203 aa  75.5  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1697  transcriptional regulator, TetR family  30.72 
 
 		 230 aa  74.7  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2623  TetR family transcriptional regulator  31.77 
 
 		 209 aa  73.6  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0845142 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3771  transcriptional regulator, TetR family  33.71 
 
 		 223 aa  73.9  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7734  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 217 aa  71.2  0.000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7526  putative transcriptional regulator, TetR family  30.46 
 
 		 204 aa  70.9  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0884  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 237 aa  70.9  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.214434 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4993  transcriptional regulator, TetR family  31.61 
 
 		 202 aa  70.5  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.309228 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1478  TetR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 217 aa  70.5  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1030  transcriptional regulator, TetR family  32.45 
 
 		 204 aa  70.1  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.468417  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1709  transcriptional regulator, TetR family  30.9 
 
 		 203 aa  69.7  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.922562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5908  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 200 aa  70.1  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.889059 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3303  TetR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 191 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.916403  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1222  TetR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 204 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3063  TetR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 192 aa  68.9  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.857011  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5823  TetR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 217 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6188  TetR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 217 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.301672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6667  TetR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 217 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.33995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0830  TetR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 195 aa  68.2  0.00000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1975  transcriptional regulator, TetR family  32.34 
 
 		 199 aa  68.2  0.00000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382484  normal  0.828211 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4073  putative transcriptional regulator, TetR family  33.53 
 
 		 208 aa  67.8  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.134392  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3549  transcriptional regulator AefR  29.03 
 
 		 200 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.695719  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6158  TetR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 212 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.488727  normal  0.104212 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2792  transcriptional regulator, TetR family  32.72 
 
 		 248 aa  66.2  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.41359  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0061  transcriptional regulator, TetR family  35.8 
 
 		 224 aa  67  0.0000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0706  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 383 aa  66.6  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0602  transcriptional regulator, TetR family  30.64 
 
 		 209 aa  66.2  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14850  transcriptional regulator  30.77 
 
 		 224 aa  66.2  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1684  regulatory protein TetR  32.09 
 
 		 211 aa  65.5  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.817144  normal  0.172233 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2332  regulatory protein, TetR  31.98 
 
 		 204 aa  65.9  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000899921 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0778  TetR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 199 aa  65.5  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.308556  normal  0.547023 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0177  TetR family transcriptional regulator  26.75 
 
 		 190 aa  65.1  0.0000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4158  TetR family transcriptional regulator  40.59 
 
 		 205 aa  65.1  0.0000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.000188504  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20410  transcriptional regulator, tetR family  32.4 
 
 		 222 aa  65.1  0.0000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.539092  normal  0.887832 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5419  TetR family transcriptional regulator  33.13 
 
 		 211 aa  64.7  0.0000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.752491  normal  0.799332 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2650  TetR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 195 aa  64.7  0.0000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1763  TetR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 287 aa  64.7  0.0000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000686866 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1885  transcriptional regulator, TetR family  31.98 
 
 		 204 aa  64.3  0.0000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.393011  normal  0.0927704 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4306  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 202 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.651969  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3324  regulatory protein, TetR  28.83 
 
 		 204 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0882884 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3441  TetR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 215 aa  63.5  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4219  transcriptional regulator, TetR family  28.11 
 
 		 202 aa  62.8  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4433  putative transcriptional regulator, TetR family  33.79 
 
 		 199 aa  62.8  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.304497  hitchhiker  0.00999637 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1252  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 202 aa  62.4  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0581191  normal  0.11609 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1531  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 200 aa  61.6  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4339  TetR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 207 aa  61.6  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00746452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5159  transcriptional regulator, TetR family  30.11 
 
 		 202 aa  60.8  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1387  transcriptional regulator, TetR family  52.38 
 
 		 213 aa  60.8  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  40.48 
 
 		 222 aa  60.8  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4620  transcriptional regulator, TetR family  35.26 
 
 		 194 aa  60.5  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.732833  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5564  transcriptional regulator, TetR family  28.9 
 
 		 201 aa  60.5  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0109  TetR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 207 aa  60.5  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3363  transcriptional regulator, TetR family  30.65 
 
 		 199 aa  60.1  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1561  TetR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.478798  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3021  TetR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1585  TetR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3714  transcriptional regulator, TetR family  32.95 
 
 		 178 aa  59.7  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.530873  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2385  transcriptional regulator, TetR family  36.7 
 
 		 176 aa  60.1  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000106592  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1929  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 214 aa  59.3  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.609447 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4313  transcriptional regulator, TetR family  43.04 
 
 		 238 aa  59.3  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2593  putative transcriptional regulator, TetR family  28.66 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0854341 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1687  regulatory protein, TetR  30.52 
 
 		 266 aa  58.9  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4103  TetR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3683  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 193 aa  58.5  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.14289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0075  transcriptional regulator, TetR family  29.88 
 
 		 194 aa  58.5  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1870  TetR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 200 aa  58.5  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.524009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1467  hypothetical protein  49.18 
 
 		 213 aa  58.2  0.00000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.165444  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0091  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 187 aa  58.2  0.00000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0611138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06672  hypothetical protein  26.32 
 
 		 198 aa  58.2  0.00000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3063  regulatory protein TetR  30.77 
 
 		 191 aa  57.8  0.00000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4348  transcriptional regulator, TetR family  26.44 
 
 		 198 aa  57.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5008  TetR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1370  transcriptional regulator, TetR family  33.11 
 
 		 199 aa  57.8  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11192  transcriptional regulator  25.28 
 
 		 201 aa  57  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4818  transcriptional regulator, TetR family  32.29 
 
 		 208 aa  57.4  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.945526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3669  TetR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 243 aa  56.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.433868  normal  1 
 
 
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NC_007958  RPD_1791  regulatory protein, TetR  32.17 
 
 		 246 aa  57  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00350194  normal  0.153158 
 
 
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NC_013510  Tcur_2696  transcriptional regulator, TetR family  39.81 
 
 		 186 aa  57  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000528624  n/a   
 
 
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NC_013160  Cyan8802_4515  transcriptional regulator, TetR family  39.39 
 
 		 191 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_009664  Krad_3324  transcriptional regulator, TetR family  33.71 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.748824 
 
 
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NC_009485  BBta_5306  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.190126 
 
 
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NC_009439  Pmen_3352  TetR family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  1 
 
 
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NC_013757  Gobs_1434  transcriptional regulator, TetR family  30.56 
 
 		 185 aa  56.2  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_2012  transcriptional regulator, TetR family  27.52 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.719864  normal  1 
 
 
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NC_010322  PputGB1_1119  TetR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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