176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2696 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_2696  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 186 aa  362  2e-99  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000528624  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2037  transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 		 234 aa  65.1  0.0000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5908  TetR family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 200 aa  65.1  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.889059 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2574  TetR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 213 aa  63.2  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1561  TetR family transcriptional regulator  49.35 
 
 		 200 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.478798  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1585  TetR family transcriptional regulator  49.35 
 
 		 200 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1531  TetR family transcriptional regulator  49.35 
 
 		 200 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3176  transcriptional regulator, TetR family  33.88 
 
 		 193 aa  63.2  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00199059 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2948  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 191 aa  61.6  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2992  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 191 aa  61.6  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.385096  normal  0.373192 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0893  regulatory protein TetR  45.71 
 
 		 194 aa  61.6  0.000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1763  TetR family transcriptional regulator  37.28 
 
 		 287 aa  61.2  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000686866 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3111  transcriptional regulator, TetR family  34.83 
 
 		 203 aa  60.8  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1030  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 204 aa  59.7  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.468417  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3441  TetR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 215 aa  59.7  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3311  putative transcriptional regulator, TetR family  38.6 
 
 		 192 aa  60.1  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6035  transcriptional regulator, TetR family  30.12 
 
 		 203 aa  59.7  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2758  TetR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 231 aa  59.7  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1870  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 200 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.524009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7472  transcriptional regulator, TetR family  29.67 
 
 		 228 aa  59.7  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4993  transcriptional regulator, TetR family  45.21 
 
 		 202 aa  58.9  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.309228 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3148  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 231 aa  58.5  0.00000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.647957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2963  TetR family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 189 aa  57.8  0.00000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.412295 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0011  transcriptional regulator, putative  25.3 
 
 		 179 aa  57  0.0000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0326  Transcriptional regulator protein  35.61 
 
 		 217 aa  57.4  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4496  TetR family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0468943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1684  regulatory protein TetR  46.27 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.817144  normal  0.172233 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4515  transcriptional regulator, TetR family  29.29 
 
 		 191 aa  57.4  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1467  hypothetical protein  38.27 
 
 		 213 aa  57  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.165444  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3225  TetR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 213 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.314279  normal  0.210871 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11192  transcriptional regulator  31.4 
 
 		 201 aa  57  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1275  transcriptional regulator, TetR family  48.39 
 
 		 214 aa  57  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4348  transcriptional regulator, TetR family  29.94 
 
 		 198 aa  56.6  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1929  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 214 aa  55.8  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.609447 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3998  transcriptional regulator, TetR family  48.08 
 
 		 245 aa  55.8  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000456955  normal  0.178314 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3270  transcriptional regulator, TetR family  29.32 
 
 		 199 aa  55.8  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1616  transcriptional regulator, TetR family  50.91 
 
 		 224 aa  55.1  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.86283 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3303  TetR family transcriptional regulator  23.91 
 
 		 191 aa  54.7  0.0000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.916403  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4603  regulatory protein TetR  44.16 
 
 		 211 aa  54.7  0.0000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204139  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0706  TetR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 383 aa  53.9  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05420  transcriptional regulator, tetR family  37.8 
 
 		 188 aa  53.9  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3771  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 223 aa  53.9  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2332  regulatory protein, TetR  32.74 
 
 		 204 aa  54.3  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000899921 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13188  TetR family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 208 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.166406 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3530  regulatory protein TetR  30.69 
 
 		 235 aa  54.3  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.898869  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2281  transcriptional regulator, TetR family  37.21 
 
 		 215 aa  53.1  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1975  transcriptional regulator, TetR family  31.95 
 
 		 199 aa  53.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382484  normal  0.828211 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4272  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 191 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5008  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 201 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2555  TetR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 205 aa  53.1  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4740  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 196 aa  52.8  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.609223  normal  0.406356 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0061  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 224 aa  52.8  0.000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3287  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 195 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.443656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4754  transcriptional regulator, TetR family  45.9 
 
 		 216 aa  52  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00853884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0778  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 199 aa  52  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.308556  normal  0.547023 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1237  transcriptional regulator, TetR family  38.27 
 
 		 219 aa  51.6  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.689055  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1697  transcriptional regulator, TetR family  46.03 
 
 		 230 aa  51.6  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2221  transcriptional regulator, TetR family  37.89 
 
 		 206 aa  51.6  0.000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3063  TetR family transcriptional regulator  23.78 
 
 		 192 aa  50.8  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.857011  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3006  TetR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 194 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313875  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3052  TetR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 194 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0884  TetR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 237 aa  50.8  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.214434 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2652  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 200 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5233  TetR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 184 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.494471  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2697  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 200 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.312459  normal  0.0316845 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5321  TetR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 184 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.868815 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2682  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 200 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0327111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3021  TetR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 194 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49231  normal  0.167388 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2593  putative transcriptional regulator, TetR family  30.34 
 
 		 205 aa  49.7  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0854341 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3818  transcriptional regulator, TetR family  30.85 
 
 		 212 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.104466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0736  transcriptional regulator  36 
 
 		 219 aa  49.7  0.00003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0112088  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19730  transcriptional regulator, tetR family  36.84 
 
 		 182 aa  49.3  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.453369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5613  TetR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 184 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.687182  normal  0.405211 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3714  transcriptional regulator, TetR family  47.69 
 
 		 178 aa  48.9  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.530873  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3333  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 211 aa  48.9  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.618946 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14850  transcriptional regulator  45.45 
 
 		 224 aa  48.9  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4219  transcriptional regulator, TetR family  41.82 
 
 		 202 aa  48.9  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5089  putative transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 210 aa  48.9  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0364  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 209 aa  48.9  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4851  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 209 aa  48.9  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188922 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1370  transcriptional regulator, TetR family  42.62 
 
 		 199 aa  48.5  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4073  putative transcriptional regulator, TetR family  46.43 
 
 		 208 aa  48.5  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.134392  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0348  TetR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 198 aa  47.8  0.00008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2374  TetR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 191 aa  48.1  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1252  TetR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 202 aa  47.8  0.00009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0581191  normal  0.11609 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3506  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 195 aa  47.8  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  0.0873465 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4620  transcriptional regulator, TetR family  32.35 
 
 		 194 aa  47.8  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.732833  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4818  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 208 aa  47.4  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.945526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1961  TetR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 187 aa  47  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.797544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8134  hypothetical protein  31.43 
 
 		 203 aa  46.2  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.290445  normal  0.176944 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5207  TetR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 216 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2454  TetR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 185 aa  46.2  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5295  TetR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 216 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.334601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5587  TetR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 216 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.214408 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2827  transcriptional regulator, TetR family  37.14 
 
 		 186 aa  46.2  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.05215  normal  0.803833 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24200  transcriptional regulator, tetR family  32.58 
 
 		 204 aa  45.4  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.130166  normal  0.0410828 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2871  TetR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 213 aa  45.8  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1528  transcriptional regulator, TetR family  37.38 
 
 		 194 aa  45.4  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.680556  normal  0.906011 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0651  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 218 aa  45.4  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0025795  normal  0.249536 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1685  transcriptional regulator  27.66 
 
 		 197 aa  45.4  0.0005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>