179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11192 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_11192  transcriptional regulator  100 
 
 		 201 aa  402  1e-111  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2574  TetR family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 213 aa  107  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5908  TetR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 200 aa  100  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.889059 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0867  transcriptional regulator, TetR family  37.76 
 
 		 202 aa  99  4e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3530  regulatory protein TetR  33.33 
 
 		 235 aa  97.1  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.898869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0706  TetR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 383 aa  94.4  9e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3757  transcriptional regulator, TetR family  32.8 
 
 		 206 aa  92  5e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0306386  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7472  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 228 aa  91.7  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4740  transcriptional regulator, TetR family  34.43 
 
 		 196 aa  89.7  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.609223  normal  0.406356 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2727  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 192 aa  85.5  5e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109313 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3260  TetR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 213 aa  82  0.000000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.122521  normal  0.297775 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3111  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 203 aa  82  0.000000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3998  transcriptional regulator, TetR family  37.16 
 
 		 245 aa  82  0.000000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000456955  normal  0.178314 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8134  hypothetical protein  32.26 
 
 		 203 aa  79.7  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.290445  normal  0.176944 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3021  TetR family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 210 aa  80.1  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14850  transcriptional regulator  31.11 
 
 		 224 aa  79.3  0.00000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3441  TetR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 215 aa  79.3  0.00000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3683  TetR family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 193 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.14289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0873  transcriptional regulator, TetR family  31.77 
 
 		 215 aa  77  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00991598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2037  transcriptional regulator, TetR family  31.22 
 
 		 234 aa  76.3  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2677  transcriptional regulator, TetR family  33 
 
 		 206 aa  75.1  0.0000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0882789  normal  0.108498 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0521  regulatory protein TetR  37.04 
 
 		 188 aa  73.2  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.368507  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3813  transcriptional regulator, TetR family  30.15 
 
 		 222 aa  73.2  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0327168  normal  0.449726 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28220  transcriptional regulator  39.26 
 
 		 195 aa  72  0.000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0388  transcriptional regulator, TetR family  27.42 
 
 		 204 aa  71.6  0.000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.654621 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1030  transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 		 204 aa  71.6  0.000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.468417  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3528  transcriptional regulator, TetR family  34.92 
 
 		 192 aa  71.2  0.000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.069513  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3176  transcriptional regulator, TetR family  26.86 
 
 		 193 aa  70.5  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00199059 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4754  transcriptional regulator, TetR family  31.31 
 
 		 216 aa  70.5  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00853884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11588  regulatory protein  27.98 
 
 		 202 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.8751e-36  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1929  transcriptional regulator, TetR family  32.02 
 
 		 214 aa  69.3  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.609447 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1434  transcriptional regulator, TetR family  28.74 
 
 		 185 aa  68.6  0.00000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3333  transcriptional regulator, TetR family  28.96 
 
 		 211 aa  67.4  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.618946 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3311  putative transcriptional regulator, TetR family  32.4 
 
 		 192 aa  67.4  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2430  TetR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 189 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2475  TetR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 189 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0409  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 214 aa  67.8  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0061  transcriptional regulator, TetR family  32.61 
 
 		 224 aa  67  0.0000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1023  regulatory protein TetR  54.1 
 
 		 196 aa  66.6  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.932216  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1616  transcriptional regulator, TetR family  30.22 
 
 		 224 aa  65.9  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.86283 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8534  transcriptional regulator, TetR family  31.07 
 
 		 206 aa  64.3  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.027806  hitchhiker  0.00115544 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4818  transcriptional regulator, TetR family  27.53 
 
 		 208 aa  63.2  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.945526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1370  transcriptional regulator, TetR family  27.61 
 
 		 199 aa  63.2  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2758  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 231 aa  62.4  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3148  TetR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 231 aa  62  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.647957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1697  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 230 aa  61.6  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1763  TetR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 287 aa  61.6  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000686866 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1387  transcriptional regulator, TetR family  34.75 
 
 		 213 aa  60.8  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3006  TetR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 194 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313875  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0630  transcriptional regulator  25.52 
 
 		 209 aa  60.8  0.00000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.397184  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0096  transcriptional regulator  27.84 
 
 		 197 aa  61.2  0.00000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00130454  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3052  TetR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 194 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3021  TetR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 194 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49231  normal  0.167388 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1685  transcriptional regulator  28.8 
 
 		 197 aa  59.7  0.00000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2963  TetR family transcriptional regulator  25.28 
 
 		 189 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.412295 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20410  transcriptional regulator, tetR family  29.12 
 
 		 222 aa  59.3  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.539092  normal  0.887832 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0164  TetR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 208 aa  59.3  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24200  transcriptional regulator, tetR family  28.87 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.130166  normal  0.0410828 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1592  regulatory protein TetR  24.87 
 
 		 193 aa  58.9  0.00000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2593  putative transcriptional regulator, TetR family  32.09 
 
 		 205 aa  58.5  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0854341 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1275  transcriptional regulator, TetR family  29.14 
 
 		 214 aa  58.2  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4993  transcriptional regulator, TetR family  30.16 
 
 		 202 aa  57.8  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.309228 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1684  regulatory protein TetR  29.34 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.817144  normal  0.172233 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3287  TetR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 195 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.443656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0893  regulatory protein TetR  25.97 
 
 		 194 aa  57  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2948  TetR family transcriptional regulator  25.28 
 
 		 191 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2992  TetR family transcriptional regulator  25.28 
 
 		 191 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.385096  normal  0.373192 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1961  TetR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 187 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.797544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1531  TetR family transcriptional regulator  31.77 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2623  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0845142 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3506  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  0.0873465 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2332  regulatory protein, TetR  30.2 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000899921 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5089  putative transcriptional regulator, TetR family  24.86 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4073  putative transcriptional regulator, TetR family  28.4 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.134392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05420  transcriptional regulator, tetR family  32.31 
 
 		 188 aa  55.8  0.0000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5564  transcriptional regulator, TetR family  28.96 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5902  TetR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 213 aa  55.1  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4219  transcriptional regulator, TetR family  28.35 
 
 		 202 aa  55.1  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2696  transcriptional regulator, TetR family  31.28 
 
 		 186 aa  55.1  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000528624  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2851  TetR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.313937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1561  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 200 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.478798  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1585  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 200 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4384  TetR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 208 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3771  transcriptional regulator, TetR family  26.95 
 
 		 223 aa  53.9  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5159  transcriptional regulator, TetR family  31.41 
 
 		 202 aa  53.5  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3270  transcriptional regulator, TetR family  36.92 
 
 		 199 aa  53.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2827  transcriptional regulator, TetR family  28.87 
 
 		 186 aa  52.8  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.05215  normal  0.803833 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1467  hypothetical protein  28.03 
 
 		 213 aa  52.4  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.165444  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2394  transcriptional regulator, TetR family  27.59 
 
 		 188 aa  52  0.000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.469906  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2482  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 230 aa  51.6  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4685  transcriptional regulator, TetR family  39.08 
 
 		 205 aa  51.6  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.421028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4502  putative transcriptional regulator, TetR family  30.63 
 
 		 249 aa  50.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.789852 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2281  transcriptional regulator, TetR family  31.41 
 
 		 215 aa  50.1  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7464  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 200 aa  50.1  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0288781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1870  TetR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 200 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.524009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4603  regulatory protein TetR  31.69 
 
 		 211 aa  50.1  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204139  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1237  transcriptional regulator, TetR family  40.79 
 
 		 219 aa  49.7  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.689055  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1252  TetR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 202 aa  49.7  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0581191  normal  0.11609 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1975  transcriptional regulator, TetR family  25.27 
 
 		 199 aa  48.9  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382484  normal  0.828211 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4620  transcriptional regulator, TetR family  30.94 
 
 		 194 aa  48.9  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.732833  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>