63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_0096 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008528  OEOE_0096  transcriptional regulator  100 
 
 		 197 aa  398  9.999999999999999e-111  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00130454  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0630  transcriptional regulator  29.44 
 
 		 209 aa  93.6  2e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.397184  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2681  regulatory protein TetR  33 
 
 		 200 aa  91.3  7e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.111338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1023  regulatory protein TetR  31.44 
 
 		 196 aa  80.9  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.932216  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3260  TetR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 213 aa  80.9  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.122521  normal  0.297775 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3757  transcriptional regulator, TetR family  31.98 
 
 		 206 aa  76.6  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0306386  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0388  transcriptional regulator, TetR family  28.64 
 
 		 204 aa  75.5  0.0000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.654621 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0873  transcriptional regulator, TetR family  31.28 
 
 		 215 aa  73.2  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00991598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0867  transcriptional regulator, TetR family  29.21 
 
 		 202 aa  72.8  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28220  transcriptional regulator  29.44 
 
 		 195 aa  67.8  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0409  TetR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 214 aa  62  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8534  transcriptional regulator, TetR family  31.34 
 
 		 206 aa  61.2  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.027806  hitchhiker  0.00115544 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5902  TetR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 213 aa  61.2  0.000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0521  regulatory protein TetR  29.74 
 
 		 188 aa  60.5  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.368507  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11192  transcriptional regulator  27.84 
 
 		 201 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1592  regulatory protein TetR  25.89 
 
 		 193 aa  60.5  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0164  TetR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 208 aa  59.7  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1685  transcriptional regulator  29.29 
 
 		 197 aa  58.5  0.00000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2727  TetR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 192 aa  58.2  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109313 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2677  transcriptional regulator, TetR family  27.46 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0882789  normal  0.108498 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2574  TetR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1030  transcriptional regulator, TetR family  26.15 
 
 		 204 aa  54.3  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.468417  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3683  TetR family transcriptional regulator  25.25 
 
 		 193 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.14289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3176  transcriptional regulator, TetR family  28.27 
 
 		 193 aa  54.3  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00199059 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1929  transcriptional regulator, TetR family  27.89 
 
 		 214 aa  52  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.609447 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3311  putative transcriptional regulator, TetR family  27.32 
 
 		 192 aa  51.6  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8134  hypothetical protein  34.07 
 
 		 203 aa  51.2  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.290445  normal  0.176944 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0893  regulatory protein TetR  27.04 
 
 		 194 aa  50.1  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3333  transcriptional regulator, TetR family  27.13 
 
 		 211 aa  50.1  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.618946 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11588  regulatory protein  28.65 
 
 		 202 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.8751e-36  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5564  transcriptional regulator, TetR family  27.39 
 
 		 201 aa  48.9  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0061  transcriptional regulator, TetR family  26.2 
 
 		 224 aa  47.8  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3021  TetR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 210 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3441  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 215 aa  47.8  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0011  transcriptional regulator, putative  29.41 
 
 		 179 aa  46.6  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3530  regulatory protein TetR  25.37 
 
 		 235 aa  47  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.898869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4740  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 196 aa  47  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.609223  normal  0.406356 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1961  TetR family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 187 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.797544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3813  transcriptional regulator, TetR family  32.56 
 
 		 222 aa  46.2  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0327168  normal  0.449726 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14850  transcriptional regulator  26.37 
 
 		 224 aa  45.8  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2758  TetR family transcriptional regulator  24.48 
 
 		 231 aa  45.8  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2697  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 200 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.312459  normal  0.0316845 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2652  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 200 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2682  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 200 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0327111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2482  transcriptional regulator, TetR family  28.04 
 
 		 230 aa  45.1  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1616  transcriptional regulator, TetR family  28.42 
 
 		 224 aa  44.7  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.86283 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0706  TetR family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 383 aa  44.3  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3528  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 192 aa  44.3  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.069513  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2475  TetR family transcriptional regulator  46.81 
 
 		 189 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2430  TetR family transcriptional regulator  46.81 
 
 		 189 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2281  transcriptional regulator, TetR family  32.97 
 
 		 215 aa  43.9  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4754  transcriptional regulator, TetR family  29.02 
 
 		 216 aa  43.1  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00853884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0710  transcriptional regulator, TetR family  35.38 
 
 		 248 aa  42.4  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2374  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 191 aa  42.4  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0778  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 199 aa  42.7  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.308556  normal  0.547023 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2283  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 173 aa  42.7  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000000171234  hitchhiker  0.000491617 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3008  putative transcriptional regulator, TetR family  42.5 
 
 		 203 aa  42  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4620  transcriptional regulator, TetR family  25.35 
 
 		 194 aa  42.4  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.732833  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2232  transcriptional regulator, TetR family  34.48 
 
 		 201 aa  41.6  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.731324  hitchhiker  0.00520971 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24200  transcriptional regulator, tetR family  24.85 
 
 		 204 aa  41.6  0.008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.130166  normal  0.0410828 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2827  transcriptional regulator, TetR family  35.19 
 
 		 186 aa  41.2  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.05215  normal  0.803833 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2394  transcriptional regulator, TetR family  27.17 
 
 		 188 aa  41.2  0.01  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.469906  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4384  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 208 aa  41.2  0.01  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>