More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2758 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2758  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 231 aa  461  1e-129  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3176  transcriptional regulator, TetR family  43.01 
 
 		 193 aa  142  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00199059 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14850  transcriptional regulator  43.01 
 
 		 224 aa  133  1.9999999999999998e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1030  transcriptional regulator, TetR family  39.57 
 
 		 204 aa  130  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.468417  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3311  putative transcriptional regulator, TetR family  44.51 
 
 		 192 aa  129  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2037  transcriptional regulator, TetR family  40.29 
 
 		 234 aa  129  5.0000000000000004e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5908  TetR family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 200 aa  126  3e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.889059 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3813  transcriptional regulator, TetR family  45.88 
 
 		 222 aa  124  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0327168  normal  0.449726 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7472  transcriptional regulator, TetR family  39.06 
 
 		 228 aa  120  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0706  TetR family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 383 aa  117  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1370  transcriptional regulator, TetR family  36.46 
 
 		 199 aa  114  8.999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1616  transcriptional regulator, TetR family  40.72 
 
 		 224 aa  112  5e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.86283 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3441  TetR family transcriptional regulator  36.06 
 
 		 215 aa  112  5e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2574  TetR family transcriptional regulator  38.07 
 
 		 213 aa  106  4e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4754  transcriptional regulator, TetR family  37.97 
 
 		 216 aa  103  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00853884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11588  regulatory protein  35.23 
 
 		 202 aa  100  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.8751e-36  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3063  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 192 aa  97.8  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.857011  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3303  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 191 aa  97.8  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.916403  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2727  TetR family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 192 aa  95.1  8e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109313 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3260  TetR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 213 aa  94  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.122521  normal  0.297775 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3021  TetR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 210 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4219  transcriptional regulator, TetR family  29.47 
 
 		 202 aa  93.6  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4359  transcriptional regulator, TetR family  30.41 
 
 		 205 aa  92.4  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4603  regulatory protein TetR  36 
 
 		 211 aa  91.7  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204139  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1434  transcriptional regulator, TetR family  37.91 
 
 		 185 aa  91.3  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4515  transcriptional regulator, TetR family  38.92 
 
 		 191 aa  89.4  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5089  putative transcriptional regulator, TetR family  31.19 
 
 		 210 aa  89.4  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3683  TetR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 193 aa  89  6e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.14289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3528  transcriptional regulator, TetR family  35.36 
 
 		 192 aa  88.2  9e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.069513  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3270  transcriptional regulator, TetR family  30.56 
 
 		 199 aa  87.8  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1929  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 214 aa  87.4  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.609447 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1275  transcriptional regulator, TetR family  30.2 
 
 		 214 aa  86.3  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3757  transcriptional regulator, TetR family  34.85 
 
 		 206 aa  86.7  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0306386  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0873  transcriptional regulator, TetR family  30.37 
 
 		 215 aa  86.3  4e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00991598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0893  regulatory protein TetR  32.8 
 
 		 194 aa  86.3  4e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4073  putative transcriptional regulator, TetR family  33.54 
 
 		 208 aa  85.5  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.134392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8534  transcriptional regulator, TetR family  30.99 
 
 		 206 aa  83.6  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.027806  hitchhiker  0.00115544 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0845  transcriptional regulator, TetR family  29.73 
 
 		 200 aa  82  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1975  transcriptional regulator, TetR family  33.52 
 
 		 199 aa  81.6  0.000000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382484  normal  0.828211 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3006  TetR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 194 aa  81.6  0.000000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313875  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3052  TetR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 194 aa  81.6  0.000000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1531  TetR family transcriptional regulator  37.57 
 
 		 200 aa  81.3  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4818  transcriptional regulator, TetR family  34.44 
 
 		 208 aa  80.5  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.945526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24200  transcriptional regulator, tetR family  31.84 
 
 		 204 aa  79.7  0.00000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.130166  normal  0.0410828 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1528  transcriptional regulator, TetR family  32.95 
 
 		 194 aa  80.1  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.680556  normal  0.906011 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3021  TetR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 194 aa  79.7  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49231  normal  0.167388 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2959  transcriptional regulator, TetR family  35.63 
 
 		 200 aa  79.3  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1561  TetR family transcriptional regulator  37.02 
 
 		 200 aa  79.7  0.00000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.478798  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8134  hypothetical protein  28.49 
 
 		 203 aa  79.3  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.290445  normal  0.176944 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3111  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 203 aa  79.3  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1585  TetR family transcriptional regulator  37.02 
 
 		 200 aa  79.7  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20410  transcriptional regulator, tetR family  28.5 
 
 		 222 aa  79.3  0.00000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.539092  normal  0.887832 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6035  transcriptional regulator, TetR family  31.32 
 
 		 203 aa  78.6  0.00000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1687  regulatory protein, TetR  35.62 
 
 		 266 aa  78.2  0.00000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4496  TetR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 202 aa  78.2  0.00000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0468943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2555  TetR family transcriptional regulator  31.77 
 
 		 205 aa  77.8  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0061  transcriptional regulator, TetR family  32.6 
 
 		 224 aa  77.4  0.0000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3063  regulatory protein TetR  35.06 
 
 		 191 aa  77.4  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0278  transcriptional regulator, TetR family  30.72 
 
 		 206 aa  76.3  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.72994  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0326  Transcriptional regulator protein  29.79 
 
 		 217 aa  76.3  0.0000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2482  transcriptional regulator, TetR family  36.02 
 
 		 230 aa  75.9  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0075  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 194 aa  75.5  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3818  transcriptional regulator, TetR family  27.33 
 
 		 212 aa  75.5  0.0000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.104466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1684  regulatory protein TetR  33.33 
 
 		 211 aa  75.5  0.0000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.817144  normal  0.172233 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2332  regulatory protein, TetR  30.73 
 
 		 204 aa  75.1  0.0000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000899921 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1870  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 200 aa  75.1  0.0000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.524009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4348  transcriptional regulator, TetR family  29.84 
 
 		 198 aa  74.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1556  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 182 aa  74.7  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3148  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 231 aa  73.6  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.647957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0884  TetR family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 237 aa  73.9  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.214434 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0388  transcriptional regulator, TetR family  30.37 
 
 		 204 aa  73.6  0.000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.654621 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05420  transcriptional regulator, tetR family  35.43 
 
 		 188 aa  73.6  0.000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2012  transcriptional regulator, TetR family  31.13 
 
 		 206 aa  72.8  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.719864  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3333  transcriptional regulator, TetR family  30.11 
 
 		 211 aa  73.2  0.000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.618946 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7526  putative transcriptional regulator, TetR family  29.81 
 
 		 204 aa  72.8  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0521  regulatory protein TetR  32.02 
 
 		 188 aa  72.8  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.368507  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2281  transcriptional regulator, TetR family  29.52 
 
 		 215 aa  72.4  0.000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1553  TetR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 212 aa  72  0.000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.260138 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3036  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 196 aa  72  0.000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1474  TetR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 188 aa  71.6  0.000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5159  transcriptional regulator, TetR family  29.73 
 
 		 202 aa  71.6  0.000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11192  transcriptional regulator  26.7 
 
 		 201 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2623  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 209 aa  71.2  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0845142 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7144  transcriptional regulator, TetR family  32.56 
 
 		 188 aa  71.2  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.251131 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5902  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 213 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0364  TetR family transcriptional regulator  33 
 
 		 209 aa  70.5  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2394  transcriptional regulator, TetR family  33.87 
 
 		 188 aa  70.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.469906  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4685  transcriptional regulator, TetR family  32.4 
 
 		 205 aa  70.9  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.421028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0778  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 199 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.308556  normal  0.547023 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5564  transcriptional regulator, TetR family  27.17 
 
 		 201 aa  70.5  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1685  transcriptional regulator  31.97 
 
 		 197 aa  70.1  0.00000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1237  transcriptional regulator, TetR family  28.78 
 
 		 219 aa  70.1  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.689055  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4851  TetR family transcriptional regulator  32.51 
 
 		 209 aa  69.7  0.00000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188922 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1467  hypothetical protein  31.87 
 
 		 213 aa  69.3  0.00000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.165444  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2652  TetR family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 200 aa  68.9  0.00000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2697  TetR family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 200 aa  68.9  0.00000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.312459  normal  0.0316845 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13188  TetR family transcriptional regulator  36.65 
 
 		 208 aa  68.9  0.00000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.166406 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2682  TetR family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 200 aa  68.9  0.00000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0327111  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3530  regulatory protein TetR  26.5 
 
 		 235 aa  67.8  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.898869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0867  transcriptional regulator, TetR family  34.02 
 
 		 202 aa  67.8  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>