236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_1685 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008528  OEOE_1685  transcriptional regulator  100 
 
 		 197 aa  393  1e-108  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0873  transcriptional regulator, TetR family  39.57 
 
 		 215 aa  142  3e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00991598  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3260  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 213 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.122521  normal  0.297775 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3757  transcriptional regulator, TetR family  35.18 
 
 		 206 aa  113  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0306386  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0388  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 204 aa  108  5e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.654621 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28220  transcriptional regulator  34.39 
 
 		 195 aa  100  1e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0409  TetR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 214 aa  98.2  7e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8534  transcriptional regulator, TetR family  32.82 
 
 		 206 aa  95.9  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.027806  hitchhiker  0.00115544 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0521  regulatory protein TetR  36.04 
 
 		 188 aa  89.7  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.368507  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5902  TetR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 213 aa  88.2  7e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2574  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 213 aa  88.2  7e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11588  regulatory protein  33.14 
 
 		 202 aa  87.4  1e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.8751e-36  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2677  transcriptional regulator, TetR family  32.98 
 
 		 206 aa  87  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0882789  normal  0.108498 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0867  transcriptional regulator, TetR family  31.96 
 
 		 202 aa  84.3  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4740  transcriptional regulator, TetR family  29.74 
 
 		 196 aa  82.8  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.609223  normal  0.406356 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0164  TetR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 208 aa  81.3  0.000000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7472  transcriptional regulator, TetR family  29.08 
 
 		 228 aa  79  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3021  TetR family transcriptional regulator  31.32 
 
 		 210 aa  78.6  0.00000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2037  transcriptional regulator, TetR family  27.1 
 
 		 234 aa  77.4  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3683  TetR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 193 aa  75.5  0.0000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.14289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1023  regulatory protein TetR  27.78 
 
 		 196 aa  74.7  0.0000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.932216  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8134  hypothetical protein  27.51 
 
 		 203 aa  72.8  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.290445  normal  0.176944 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2221  transcriptional regulator, TetR family  29.75 
 
 		 206 aa  72  0.000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14850  transcriptional regulator  29.89 
 
 		 224 aa  71.2  0.000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1975  transcriptional regulator, TetR family  27.51 
 
 		 199 aa  71.2  0.000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382484  normal  0.828211 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2758  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 231 aa  71.2  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3530  regulatory protein TetR  26.37 
 
 		 235 aa  71.2  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.898869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0884  TetR family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 237 aa  69.7  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.214434 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3441  TetR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 215 aa  70.1  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4006  transcriptional regulator, TetR family  33.9 
 
 		 193 aa  69.7  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.685052  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2681  regulatory protein TetR  26.47 
 
 		 200 aa  69.7  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.111338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1592  regulatory protein TetR  28.88 
 
 		 193 aa  69.3  0.00000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0326  Transcriptional regulator protein  24.23 
 
 		 217 aa  69.3  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1387  transcriptional regulator, TetR family  30.41 
 
 		 213 aa  68.6  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0706  TetR family transcriptional regulator  30.35 
 
 		 383 aa  68.2  0.00000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2332  regulatory protein, TetR  41.3 
 
 		 204 aa  68.2  0.00000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000899921 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1616  transcriptional regulator, TetR family  29.47 
 
 		 224 aa  67  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.86283 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0096  transcriptional regulator  28.57 
 
 		 197 aa  66.6  0.0000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00130454  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2482  transcriptional regulator, TetR family  32.47 
 
 		 230 aa  67  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5615  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 200 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000827938  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1434  transcriptional regulator, TetR family  38.27 
 
 		 185 aa  65.5  0.0000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5979  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 200 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000443748  hitchhiker  0.000881636 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0893  regulatory protein TetR  24.35 
 
 		 194 aa  65.5  0.0000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4073  putative transcriptional regulator, TetR family  32.17 
 
 		 208 aa  65.5  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.134392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2394  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 188 aa  65.1  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.469906  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0075  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 194 aa  63.9  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5908  TetR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 200 aa  63.9  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.889059 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2555  TetR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 205 aa  63.9  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7464  TetR family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 200 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0288781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0630  transcriptional regulator  25.5 
 
 		 209 aa  63.5  0.000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.397184  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1275  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 214 aa  63.9  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3111  transcriptional regulator, TetR family  26.73 
 
 		 203 aa  63.9  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0278  transcriptional regulator, TetR family  30.56 
 
 		 206 aa  63.5  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.72994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3311  putative transcriptional regulator, TetR family  28.02 
 
 		 192 aa  62.8  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1474  TetR family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 188 aa  62.8  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3813  transcriptional regulator, TetR family  38.64 
 
 		 222 aa  62.4  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0327168  normal  0.449726 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3303  TetR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 191 aa  62  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.916403  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3176  transcriptional regulator, TetR family  26.88 
 
 		 193 aa  62.4  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00199059 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2623  TetR family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 209 aa  62  0.000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0845142 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1478  TetR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 217 aa  62  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4515  transcriptional regulator, TetR family  28.11 
 
 		 191 aa  61.6  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11192  transcriptional regulator  28.8 
 
 		 201 aa  61.6  0.000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3063  TetR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 192 aa  61.2  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.857011  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4433  putative transcriptional regulator, TetR family  37.04 
 
 		 199 aa  60.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.304497  hitchhiker  0.00999637 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3148  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 231 aa  59.7  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.647957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1030  transcriptional regulator, TetR family  26.9 
 
 		 204 aa  59.7  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.468417  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1528  transcriptional regulator, TetR family  37.76 
 
 		 194 aa  58.9  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.680556  normal  0.906011 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2652  TetR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 200 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2697  TetR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 200 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.312459  normal  0.0316845 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2682  TetR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 200 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0327111  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1929  transcriptional regulator, TetR family  26.63 
 
 		 214 aa  58.5  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.609447 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2727  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 192 aa  58.2  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109313 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0364  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 209 aa  58.2  0.00000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2281  transcriptional regulator, TetR family  42.5 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1870  TetR family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 200 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.524009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4496  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0468943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3528  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 192 aa  57.8  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.069513  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4219  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 202 aa  57  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4851  TetR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188922 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5564  transcriptional regulator, TetR family  32.64 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1561  TetR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 200 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.478798  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4620  transcriptional regulator, TetR family  29.58 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.732833  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1585  TetR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 200 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1531  TetR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 200 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4603  regulatory protein TetR  29.56 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204139  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2792  transcriptional regulator, TetR family  28.96 
 
 		 248 aa  55.5  0.0000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.41359  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2593  putative transcriptional regulator, TetR family  37.89 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0854341 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2827  transcriptional regulator, TetR family  25.83 
 
 		 186 aa  55.1  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.05215  normal  0.803833 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2283  TetR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 173 aa  54.7  0.0000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000000171234  hitchhiker  0.000491617 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1370  transcriptional regulator, TetR family  24.35 
 
 		 199 aa  54.7  0.0000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0872  transcriptional regulator, TetR family  31.18 
 
 		 212 aa  54.7  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.83423  normal  0.281851 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4384  TetR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 208 aa  54.7  0.0000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2773  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 191 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.704113  normal  0.8573 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5089  putative transcriptional regulator, TetR family  23.16 
 
 		 210 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1237  transcriptional regulator, TetR family  25.65 
 
 		 219 aa  53.5  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.689055  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3333  transcriptional regulator, TetR family  34.48 
 
 		 211 aa  53.1  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.618946 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1252  TetR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 202 aa  53.5  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0581191  normal  0.11609 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3270  transcriptional regulator, TetR family  27.59 
 
 		 199 aa  53.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1961  TetR family transcriptional regulator  26.86 
 
 		 187 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.797544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3225  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 213 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.314279  normal  0.210871 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>