291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_2652 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2652  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
200 aa  395  1e-109  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2697  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
200 aa  395  1e-109  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.312459  normal  0.0316845 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2682  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
200 aa  395  1e-109  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0327111  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3063  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 
192 aa  129  3e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.857011  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3303  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 
191 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.916403  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5159  transcriptional regulator, TetR family  37.65 
 
 
202 aa  108  4.0000000000000004e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5770  transcriptional regulator, TetR family  33.52 
 
 
201 aa  107  9.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.805337 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4359  transcriptional regulator, TetR family  34.83 
 
 
205 aa  107  9.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1975  transcriptional regulator, TetR family  36.96 
 
 
199 aa  102  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382484  normal  0.828211 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3111  transcriptional regulator, TetR family  36.56 
 
 
203 aa  102  3e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5223  TetR family transcriptional regulator  32.8 
 
 
197 aa  100  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.325156 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4993  transcriptional regulator, TetR family  34.41 
 
 
202 aa  100  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.309228 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3818  transcriptional regulator, TetR family  33.93 
 
 
212 aa  97.8  9e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.104466  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2593  putative transcriptional regulator, TetR family  34.98 
 
 
205 aa  94.7  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0854341 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1697  transcriptional regulator, TetR family  34.36 
 
 
230 aa  93.2  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5089  putative transcriptional regulator, TetR family  32.78 
 
 
210 aa  92.8  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5587  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 
216 aa  92  5e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.214408 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0884  TetR family transcriptional regulator  31.84 
 
 
237 aa  92  5e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.214434 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5207  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 
216 aa  92  5e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1252  TetR family transcriptional regulator  36.27 
 
 
202 aa  92  5e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0581191  normal  0.11609 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5295  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 
216 aa  92  5e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.334601  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1275  transcriptional regulator, TetR family  33.85 
 
 
214 aa  91.7  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4073  putative transcriptional regulator, TetR family  36.05 
 
 
208 aa  90.9  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.134392  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3683  TetR family transcriptional regulator  31.55 
 
 
193 aa  90.1  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.14289  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0893  regulatory protein TetR  35.45 
 
 
194 aa  88.2  8e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2727  TetR family transcriptional regulator  28.88 
 
 
192 aa  85.5  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.109313 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0061  transcriptional regulator, TetR family  31.85 
 
 
224 aa  85.5  5e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0845  transcriptional regulator, TetR family  29.78 
 
 
200 aa  85.1  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1553  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 
212 aa  83.2  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.260138 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2037  transcriptional regulator, TetR family  31.38 
 
 
234 aa  82.4  0.000000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2332  regulatory protein, TetR  32.04 
 
 
204 aa  82  0.000000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000899921 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2232  transcriptional regulator, TetR family  28.49 
 
 
201 aa  80.9  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.731324  hitchhiker  0.00520971 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4818  transcriptional regulator, TetR family  32.02 
 
 
208 aa  80.9  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.945526  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1684  regulatory protein TetR  29.63 
 
 
211 aa  80.9  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.817144  normal  0.172233 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4255  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 
216 aa  79.7  0.00000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.323719 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0706  TetR family transcriptional regulator  30.98 
 
 
383 aa  75.5  0.0000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1030  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 
204 aa  75.1  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.468417  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11588  regulatory protein  30.41 
 
 
202 aa  75.1  0.0000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.8751e-36  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5908  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 
200 aa  74.3  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.889059 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5564  transcriptional regulator, TetR family  29.27 
 
 
201 aa  73.9  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3148  TetR family transcriptional regulator  32.8 
 
 
231 aa  73.9  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.647957  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3270  transcriptional regulator, TetR family  26.32 
 
 
199 aa  73.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3714  transcriptional regulator, TetR family  36.75 
 
 
178 aa  73.6  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.530873  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2623  TetR family transcriptional regulator  28.24 
 
 
209 aa  72.8  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0845142 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2430  TetR family transcriptional regulator  29.45 
 
 
189 aa  72.8  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2475  TetR family transcriptional regulator  29.45 
 
 
189 aa  72.8  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4515  transcriptional regulator, TetR family  27.44 
 
 
191 aa  72.8  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0278  transcriptional regulator, TetR family  32.93 
 
 
206 aa  72  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.72994  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1763  TetR family transcriptional regulator  32.98 
 
 
287 aa  72  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000686866 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0602  transcriptional regulator, TetR family  32.5 
 
 
209 aa  70.9  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3176  transcriptional regulator, TetR family  29.14 
 
 
193 aa  70.5  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00199059 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4339  TetR family transcriptional regulator  30.17 
 
 
207 aa  70.1  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00746452  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3998  transcriptional regulator, TetR family  35.53 
 
 
245 aa  69.7  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000456955  normal  0.178314 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0011  transcriptional regulator, putative  21.2 
 
 
179 aa  69.7  0.00000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7144  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 
188 aa  69.7  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.251131 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2574  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 
213 aa  69.3  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1467  hypothetical protein  29.44 
 
 
213 aa  68.9  0.00000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.165444  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3363  transcriptional regulator, TetR family  28.14 
 
 
199 aa  69.3  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20410  transcriptional regulator, tetR family  26.88 
 
 
222 aa  69.3  0.00000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.539092  normal  0.887832 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2555  TetR family transcriptional regulator  29.79 
 
 
205 aa  68.9  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1929  transcriptional regulator, TetR family  31.71 
 
 
214 aa  68.6  0.00000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.609447 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1478  TetR family transcriptional regulator  27.65 
 
 
217 aa  68.2  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4433  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 
199 aa  68.2  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.304497  hitchhiker  0.00999637 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0075  transcriptional regulator, TetR family  27.98 
 
 
194 aa  68.2  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5008  TetR family transcriptional regulator  32.16 
 
 
201 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2402  transcriptional regulator, TetR family  26.52 
 
 
204 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4603  regulatory protein TetR  29.03 
 
 
211 aa  66.2  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204139  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3771  transcriptional regulator, TetR family  27.86 
 
 
223 aa  66.2  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1533  regulatory protein TetR  30.67 
 
 
203 aa  66.2  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.987298  normal  0.249923 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4219  transcriptional regulator, TetR family  27.37 
 
 
202 aa  66.2  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2670  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 
214 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.545748  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1370  transcriptional regulator, TetR family  31.29 
 
 
199 aa  65.9  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2715  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 
214 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.180608  normal  0.0320009 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3333  transcriptional regulator, TetR family  29.01 
 
 
211 aa  65.9  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.618946 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6626  TetR family transcriptional regulator  29.28 
 
 
210 aa  65.5  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6035  transcriptional regulator, TetR family  27.88 
 
 
203 aa  65.5  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2700  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 
200 aa  65.5  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12090  transcriptional regulator, tetR family  35.1 
 
 
182 aa  65.5  0.0000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3225  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 
213 aa  65.5  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.314279  normal  0.210871 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2221  transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 
206 aa  65.5  0.0000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4006  transcriptional regulator, TetR family  31.94 
 
 
193 aa  65.1  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.685052  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1616  transcriptional regulator, TetR family  31.87 
 
 
224 aa  64.7  0.0000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.86283 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4348  transcriptional regulator, TetR family  24.86 
 
 
198 aa  63.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0038  TetR family transcriptional regulator  51.47 
 
 
191 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0047  TetR family transcriptional regulator  51.47 
 
 
191 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0431132 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0028  TetR family transcriptional regulator  51.47 
 
 
191 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.35435 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3021  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 
210 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3441  TetR family transcriptional regulator  28.98 
 
 
215 aa  63.5  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1535  TetR family transcriptional regulator  32.67 
 
 
192 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3506  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 
195 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  0.0873465 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14850  transcriptional regulator  29.12 
 
 
224 aa  62.8  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0778  TetR family transcriptional regulator  30.22 
 
 
199 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.308556  normal  0.547023 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7472  transcriptional regulator, TetR family  28.93 
 
 
228 aa  62.8  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3063  regulatory protein TetR  32.95 
 
 
191 aa  63.2  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2827  transcriptional regulator, TetR family  32.47 
 
 
186 aa  62.4  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.05215  normal  0.803833 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7526  putative transcriptional regulator, TetR family  34 
 
 
204 aa  62.8  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277737  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1528  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 
194 aa  61.6  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.680556  normal  0.906011 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2758  TetR family transcriptional regulator  29.12 
 
 
231 aa  61.2  0.000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2454  TetR family transcriptional regulator  30.54 
 
 
185 aa  60.1  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2394  transcriptional regulator, TetR family  32.02 
 
 
188 aa  60.5  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.469906  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>