More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1478 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1478  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 217 aa  429  1e-119  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2623  TetR family transcriptional regulator  87.02 
 
 		 209 aa  355  3.9999999999999996e-97  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0845142 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0075  transcriptional regulator, TetR family  40.68 
 
 		 194 aa  132  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2959  transcriptional regulator, TetR family  50.57 
 
 		 200 aa  124  9e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4359  transcriptional regulator, TetR family  43.5 
 
 		 205 aa  124  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3063  regulatory protein TetR  50.91 
 
 		 191 aa  119  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3063  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 192 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.857011  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3363  transcriptional regulator, TetR family  40.21 
 
 		 199 aa  117  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1975  transcriptional regulator, TetR family  42.46 
 
 		 199 aa  114  7.999999999999999e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382484  normal  0.828211 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3303  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 191 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.916403  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0884  TetR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 237 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.214434 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5089  putative transcriptional regulator, TetR family  38.71 
 
 		 210 aa  112  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2402  transcriptional regulator, TetR family  39.67 
 
 		 204 aa  106  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1030  transcriptional regulator, TetR family  35.82 
 
 		 204 aa  104  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.468417  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5159  transcriptional regulator, TetR family  38.3 
 
 		 202 aa  100  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2332  regulatory protein, TetR  42.02 
 
 		 204 aa  99.8  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000899921 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3270  transcriptional regulator, TetR family  31.61 
 
 		 199 aa  98.2  8e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4348  transcriptional regulator, TetR family  34.97 
 
 		 198 aa  97.1  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7472  transcriptional regulator, TetR family  33.93 
 
 		 228 aa  95.9  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4515  transcriptional regulator, TetR family  31.71 
 
 		 191 aa  89.4  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0706  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 383 aa  89.4  4e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4219  transcriptional regulator, TetR family  35.91 
 
 		 202 aa  89.4  4e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0061  transcriptional regulator, TetR family  33.13 
 
 		 224 aa  89  5e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5908  TetR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 200 aa  88.6  6e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.889059 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2593  putative transcriptional regulator, TetR family  38.05 
 
 		 205 aa  87  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0854341 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4818  transcriptional regulator, TetR family  37.71 
 
 		 208 aa  87.4  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.945526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4433  putative transcriptional regulator, TetR family  42.62 
 
 		 199 aa  86.3  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.304497  hitchhiker  0.00999637 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1528  transcriptional regulator, TetR family  37.07 
 
 		 194 aa  84  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.680556  normal  0.906011 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0038  TetR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 191 aa  83.2  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0047  TetR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 191 aa  83.2  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0431132 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0028  TetR family transcriptional regulator  36.65 
 
 		 191 aa  83.6  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.35435 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3287  TetR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 195 aa  82.4  0.000000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.443656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5770  transcriptional regulator, TetR family  33.52 
 
 		 201 aa  82  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.805337 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3818  transcriptional regulator, TetR family  32.76 
 
 		 212 aa  81.6  0.000000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.104466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5564  transcriptional regulator, TetR family  32.43 
 
 		 201 aa  81.3  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0845  transcriptional regulator, TetR family  30.73 
 
 		 200 aa  80.1  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3176  transcriptional regulator, TetR family  32.61 
 
 		 193 aa  80.5  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00199059 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1616  transcriptional regulator, TetR family  33.67 
 
 		 224 aa  79.7  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.86283 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2555  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 205 aa  79.3  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4272  TetR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 191 aa  79.3  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1687  regulatory protein, TetR  34.64 
 
 		 266 aa  79.3  0.00000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14850  transcriptional regulator  35.18 
 
 		 224 aa  79  0.00000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3311  putative transcriptional regulator, TetR family  34.68 
 
 		 192 aa  77.8  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1252  TetR family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 202 aa  77.8  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0581191  normal  0.11609 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3111  transcriptional regulator, TetR family  33.86 
 
 		 203 aa  77.4  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5223  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 197 aa  76.6  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.325156 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3506  TetR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 195 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  0.0873465 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1684  regulatory protein TetR  33.88 
 
 		 211 aa  76.3  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.817144  normal  0.172233 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4754  transcriptional regulator, TetR family  30.57 
 
 		 216 aa  76.3  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00853884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1023  regulatory protein TetR  32.22 
 
 		 196 aa  75.9  0.0000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.932216  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7464  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 200 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0288781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4339  TetR family transcriptional regulator  39.38 
 
 		 207 aa  75.5  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00746452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4073  putative transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 		 208 aa  74.3  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.134392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3813  transcriptional regulator, TetR family  34.18 
 
 		 222 aa  73.6  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0327168  normal  0.449726 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0602  transcriptional regulator, TetR family  33.14 
 
 		 209 aa  73.6  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1556  putative transcriptional regulator, TetR family  36.26 
 
 		 182 aa  73.2  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3006  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 194 aa  73.2  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313875  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3052  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 194 aa  73.2  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3021  TetR family transcriptional regulator  31.89 
 
 		 194 aa  73.2  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49231  normal  0.167388 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0278  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 206 aa  72.4  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.72994  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3260  TetR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 213 aa  72.8  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.122521  normal  0.297775 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2963  TetR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 189 aa  72.4  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.412295 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5615  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 200 aa  71.6  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000827938  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1553  TetR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 212 aa  71.6  0.000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.260138 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5979  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 200 aa  71.6  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000443748  hitchhiker  0.000881636 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3683  TetR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 193 aa  71.6  0.000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.14289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2385  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 176 aa  71.2  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000106592  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3771  transcriptional regulator, TetR family  33.54 
 
 		 223 aa  71.2  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3530  regulatory protein TetR  30.32 
 
 		 235 aa  71.2  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.898869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1370  transcriptional regulator, TetR family  30.93 
 
 		 199 aa  70.9  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2948  TetR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 191 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2992  TetR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 191 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.385096  normal  0.373192 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5902  TetR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 213 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2374  TetR family transcriptional regulator  47.56 
 
 		 191 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6626  TetR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 210 aa  69.7  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2232  transcriptional regulator, TetR family  31.21 
 
 		 201 aa  70.1  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.731324  hitchhiker  0.00520971 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4255  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 216 aa  69.7  0.00000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.323719 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1275  transcriptional regulator, TetR family  32.09 
 
 		 214 aa  68.9  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7526  putative transcriptional regulator, TetR family  32.58 
 
 		 204 aa  68.6  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2652  TetR family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 200 aa  68.2  0.00000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2697  TetR family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 200 aa  68.2  0.00000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.312459  normal  0.0316845 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2682  TetR family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 200 aa  68.2  0.00000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0327111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3036  TetR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 196 aa  68.2  0.00000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0893  regulatory protein TetR  35.48 
 
 		 194 aa  67.8  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1434  transcriptional regulator, TetR family  32.6 
 
 		 185 aa  67  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0872  transcriptional regulator, TetR family  32.93 
 
 		 212 aa  66.6  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.83423  normal  0.281851 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3528  transcriptional regulator, TetR family  33.54 
 
 		 192 aa  66.2  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.069513  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2727  TetR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 192 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109313 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3225  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 213 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.314279  normal  0.210871 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24200  transcriptional regulator, tetR family  31.61 
 
 		 204 aa  65.5  0.0000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.130166  normal  0.0410828 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2454  TetR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 185 aa  65.5  0.0000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2037  transcriptional regulator, TetR family  31.18 
 
 		 234 aa  65.5  0.0000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1387  transcriptional regulator, TetR family  32.1 
 
 		 213 aa  64.7  0.0000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3001  transcriptional regulator, TetR family  32.91 
 
 		 207 aa  64.3  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.145736  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4740  transcriptional regulator, TetR family  32.8 
 
 		 196 aa  64.3  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.609223  normal  0.406356 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3324  transcriptional regulator, TetR family  32.74 
 
 		 225 aa  64.3  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.748824 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20410  transcriptional regulator, tetR family  25.65 
 
 		 222 aa  64.3  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.539092  normal  0.887832 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5207  TetR family transcriptional regulator  30.35 
 
 		 216 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5295  TetR family transcriptional regulator  30.35 
 
 		 216 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.334601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7144  transcriptional regulator, TetR family  31.75 
 
 		 188 aa  64.3  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.251131 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>