More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5770 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5770  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 201 aa  396  1e-109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.805337 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5207  TetR family transcriptional regulator  42.41 
 
 		 216 aa  141  6e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5295  TetR family transcriptional regulator  42.41 
 
 		 216 aa  141  6e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.334601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5587  TetR family transcriptional regulator  42.41 
 
 		 216 aa  141  6e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.214408 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5223  TetR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 197 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.325156 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3063  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 192 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.857011  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3303  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 191 aa  130  9e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.916403  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2652  TetR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 200 aa  119  3e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2697  TetR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 200 aa  119  3e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.312459  normal  0.0316845 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2682  TetR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 200 aa  119  3e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0327111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5159  transcriptional regulator, TetR family  37.93 
 
 		 202 aa  111  8.000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2232  transcriptional regulator, TetR family  35.96 
 
 		 201 aa  108  5e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.731324  hitchhiker  0.00520971 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0884  TetR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 237 aa  108  5e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.214434 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5089  putative transcriptional regulator, TetR family  33.87 
 
 		 210 aa  106  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4359  transcriptional regulator, TetR family  32.45 
 
 		 205 aa  105  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1975  transcriptional regulator, TetR family  33 
 
 		 199 aa  103  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382484  normal  0.828211 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2623  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 209 aa  100  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0845142 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3683  TetR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 193 aa  99.4  4e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.14289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2332  regulatory protein, TetR  36.27 
 
 		 204 aa  97.4  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000899921 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1535  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 192 aa  95.9  4e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1478  TetR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 217 aa  95.1  5e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5908  TetR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 200 aa  94.4  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.889059 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4818  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 208 aa  93.2  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.945526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1553  TetR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 212 aa  92  6e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.260138 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3818  transcriptional regulator, TetR family  32.22 
 
 		 212 aa  88.6  6e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.104466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12090  transcriptional regulator, tetR family  35.91 
 
 		 182 aa  87.8  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0075  transcriptional regulator, TetR family  31.84 
 
 		 194 aa  86.7  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2727  TetR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 192 aa  86.3  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109313 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1528  transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 		 194 aa  84  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.680556  normal  0.906011 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1030  transcriptional regulator, TetR family  33.15 
 
 		 204 aa  83.6  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.468417  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0706  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 383 aa  82.8  0.000000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4219  transcriptional regulator, TetR family  29.69 
 
 		 202 aa  82.8  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3063  regulatory protein TetR  35.06 
 
 		 191 aa  81.3  0.000000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2959  transcriptional regulator, TetR family  35.06 
 
 		 200 aa  81.3  0.000000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2402  transcriptional regulator, TetR family  29.74 
 
 		 204 aa  81.3  0.000000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0845  transcriptional regulator, TetR family  29.78 
 
 		 200 aa  80.1  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4073  putative transcriptional regulator, TetR family  31.84 
 
 		 208 aa  78.2  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.134392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1763  TetR family transcriptional regulator  32.72 
 
 		 287 aa  77.8  0.00000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000686866 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3923  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 214 aa  75.9  0.0000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4433  putative transcriptional regulator, TetR family  32.82 
 
 		 199 aa  75.9  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.304497  hitchhiker  0.00999637 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20410  transcriptional regulator, tetR family  29.47 
 
 		 222 aa  75.1  0.0000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.539092  normal  0.887832 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1616  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 224 aa  73.2  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.86283 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3111  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 203 aa  73.2  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0278  transcriptional regulator, TetR family  31.11 
 
 		 206 aa  73.2  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.72994  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3333  transcriptional regulator, TetR family  33.53 
 
 		 211 aa  71.6  0.000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.618946 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3720  transcriptional regulator, TetR family  31.02 
 
 		 225 aa  71.2  0.000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2555  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 205 aa  70.9  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3176  transcriptional regulator, TetR family  28.72 
 
 		 193 aa  70.9  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00199059 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1684  regulatory protein TetR  29.03 
 
 		 211 aa  70.9  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.817144  normal  0.172233 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0061  transcriptional regulator, TetR family  27.43 
 
 		 224 aa  70.1  0.00000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3270  transcriptional regulator, TetR family  27.53 
 
 		 199 aa  70.1  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2430  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 189 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2475  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 189 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1533  regulatory protein TetR  30.34 
 
 		 203 aa  69.7  0.00000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.987298  normal  0.249923 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1687  regulatory protein, TetR  28.77 
 
 		 266 aa  69.7  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1697  transcriptional regulator, TetR family  27.17 
 
 		 230 aa  68.6  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3363  transcriptional regulator, TetR family  28.89 
 
 		 199 aa  68.2  0.00000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3260  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 213 aa  67.4  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.122521  normal  0.297775 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4255  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 216 aa  67.4  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.323719 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4993  transcriptional regulator, TetR family  29.59 
 
 		 202 aa  66.6  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.309228 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1045  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 226 aa  66.6  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2593  putative transcriptional regulator, TetR family  29.69 
 
 		 205 aa  65.9  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0854341 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4515  transcriptional regulator, TetR family  30.18 
 
 		 191 aa  65.9  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2221  transcriptional regulator, TetR family  29.94 
 
 		 206 aa  65.5  0.0000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5564  transcriptional regulator, TetR family  30.54 
 
 		 201 aa  65.5  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3506  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 195 aa  65.5  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  0.0873465 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2454  TetR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 185 aa  65.1  0.0000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7526  putative transcriptional regulator, TetR family  28.74 
 
 		 204 aa  65.1  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3714  transcriptional regulator, TetR family  33.57 
 
 		 178 aa  64.7  0.0000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.530873  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2037  transcriptional regulator, TetR family  28.21 
 
 		 234 aa  64.3  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3441  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 215 aa  63.9  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3148  TetR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 231 aa  63.2  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.647957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3036  TetR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 196 aa  63.5  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5008  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 201 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3953  TetR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 232 aa  63.9  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396138  normal  0.024229 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1370  transcriptional regulator, TetR family  27.93 
 
 		 199 aa  63.5  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2029  TetR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 220 aa  63.2  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1515  putative transcriptional regulator, TetR family  34.91 
 
 		 219 aa  63.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254086  hitchhiker  0.00363064 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0893  regulatory protein TetR  29.59 
 
 		 194 aa  62.8  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2574  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 213 aa  63.2  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3225  TetR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 213 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.314279  normal  0.210871 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1252  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 202 aa  62.4  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0581191  normal  0.11609 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1669  TetR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 235 aa  62  0.000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3998  transcriptional regulator, TetR family  27.15 
 
 		 245 aa  62  0.000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000456955  normal  0.178314 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3021  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 194 aa  62  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49231  normal  0.167388 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0778  TetR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 199 aa  61.6  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.308556  normal  0.547023 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2758  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 231 aa  60.8  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4883  TetR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 187 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00152311 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14850  transcriptional regulator  26.78 
 
 		 224 aa  60.5  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1838  transcriptional regulator, TetR family  28.4 
 
 		 221 aa  60.1  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.834516  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2385  transcriptional regulator, TetR family  30.91 
 
 		 176 aa  60.5  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000106592  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2436  TetR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 243 aa  60.1  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.747053 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6035  transcriptional regulator, TetR family  27.37 
 
 		 203 aa  59.7  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7472  transcriptional regulator, TetR family  28.4 
 
 		 228 aa  59.7  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0737  transcriptional regulator, TetR family  31.14 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6626  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3006  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 194 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313875  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3052  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 194 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2599  TetR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 233 aa  58.5  0.00000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.87329  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0648  transcriptional regulator, TetR family  27.06 
 
 		 247 aa  58.2  0.00000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0672593 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>