More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2454 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_2454  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 185 aa  375  1e-103  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3287  TetR family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 195 aa  164  9e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.443656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3506  TetR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 195 aa  148  4e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  0.0873465 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2963  TetR family transcriptional regulator  46.49 
 
 		 189 aa  147  8e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.412295 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2948  TetR family transcriptional regulator  46.49 
 
 		 191 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2992  TetR family transcriptional regulator  46.49 
 
 		 191 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.385096  normal  0.373192 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4219  transcriptional regulator, TetR family  33.94 
 
 		 202 aa  88.6  4e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7526  putative transcriptional regulator, TetR family  32.16 
 
 		 204 aa  83.2  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3021  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 194 aa  83.2  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49231  normal  0.167388 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5159  transcriptional regulator, TetR family  34.55 
 
 		 202 aa  79.3  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3998  transcriptional regulator, TetR family  34.21 
 
 		 245 aa  79.3  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000456955  normal  0.178314 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3006  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 194 aa  79  0.00000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313875  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3052  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 194 aa  79  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4993  transcriptional regulator, TetR family  34.56 
 
 		 202 aa  77.8  0.00000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.309228 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20410  transcriptional regulator, tetR family  34.19 
 
 		 222 aa  77.4  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.539092  normal  0.887832 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4074  TetR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 214 aa  77  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4150  TetR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 214 aa  77  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4304  TetR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 214 aa  77.4  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.127399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2332  regulatory protein, TetR  30.27 
 
 		 204 aa  76.3  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000899921 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2221  transcriptional regulator, TetR family  34.59 
 
 		 206 aa  76.6  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0830  TetR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 195 aa  76.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3111  transcriptional regulator, TetR family  37.68 
 
 		 203 aa  75.1  0.0000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1975  transcriptional regulator, TetR family  29.69 
 
 		 199 aa  74.7  0.0000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382484  normal  0.828211 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3148  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 231 aa  73.9  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.647957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1697  transcriptional regulator, TetR family  31.87 
 
 		 230 aa  74.3  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4359  transcriptional regulator, TetR family  32.78 
 
 		 205 aa  73.9  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0075  transcriptional regulator, TetR family  31.36 
 
 		 194 aa  73.2  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4339  TetR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 207 aa  73.6  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00746452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2623  TetR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 209 aa  72  0.000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0845142 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2670  TetR family transcriptional regulator  32.9 
 
 		 214 aa  72  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.545748  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2715  TetR family transcriptional regulator  32.9 
 
 		 214 aa  72  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.180608  normal  0.0320009 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2700  TetR family transcriptional regulator  32.9 
 
 		 200 aa  72  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1370  transcriptional regulator, TetR family  31.48 
 
 		 199 aa  71.6  0.000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3176  transcriptional regulator, TetR family  31.87 
 
 		 193 aa  70.9  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00199059 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3771  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 223 aa  70.9  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7472  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 228 aa  70.5  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6035  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 203 aa  69.3  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4620  transcriptional regulator, TetR family  30.86 
 
 		 194 aa  68.9  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.732833  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1030  transcriptional regulator, TetR family  29.14 
 
 		 204 aa  68.9  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.468417  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4348  transcriptional regulator, TetR family  28.07 
 
 		 198 aa  68.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14850  transcriptional regulator  32.4 
 
 		 224 aa  68.2  0.00000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2232  transcriptional regulator, TetR family  30.23 
 
 		 201 aa  68.2  0.00000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.731324  hitchhiker  0.00520971 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1387  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 213 aa  67.4  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4006  transcriptional regulator, TetR family  33.55 
 
 		 193 aa  67.4  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.685052  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2012  transcriptional regulator, TetR family  31.08 
 
 		 206 aa  67.4  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.719864  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1237  transcriptional regulator, TetR family  32.43 
 
 		 219 aa  66.6  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.689055  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0278  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 206 aa  66.2  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.72994  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4818  transcriptional regulator, TetR family  29.31 
 
 		 208 aa  66.2  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.945526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0884  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 237 aa  65.9  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.214434 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4685  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 205 aa  65.5  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.421028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6347  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 200 aa  65.1  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1478  TetR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 217 aa  65.5  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0706  TetR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 383 aa  64.3  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4073  putative transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 208 aa  63.9  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.134392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2394  transcriptional regulator, TetR family  37.67 
 
 		 188 aa  63.9  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.469906  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3324  regulatory protein, TetR  31.55 
 
 		 204 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0882884 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1763  TetR family transcriptional regulator  31.32 
 
 		 287 aa  63.2  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000686866 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1528  transcriptional regulator, TetR family  30.95 
 
 		 194 aa  63.5  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.680556  normal  0.906011 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5089  putative transcriptional regulator, TetR family  27.37 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2374  TetR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 191 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4515  transcriptional regulator, TetR family  28.39 
 
 		 191 aa  62.4  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2792  transcriptional regulator, TetR family  32.37 
 
 		 248 aa  62.4  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.41359  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3008  putative transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 203 aa  61.6  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3036  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 196 aa  61.2  0.000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0061  transcriptional regulator, TetR family  32.69 
 
 		 224 aa  61.6  0.000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3714  transcriptional regulator, TetR family  33.11 
 
 		 178 aa  61.2  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.530873  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3549  transcriptional regulator AefR  31.87 
 
 		 200 aa  61.2  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.695719  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0893  regulatory protein TetR  28.48 
 
 		 194 aa  60.5  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0602  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 209 aa  60.8  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0109  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 207 aa  60.5  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4433  putative transcriptional regulator, TetR family  32.39 
 
 		 199 aa  60.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.304497  hitchhiker  0.00999637 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2555  TetR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 205 aa  60.1  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5908  TetR family transcriptional regulator  26.16 
 
 		 200 aa  59.7  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.889059 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2482  transcriptional regulator, TetR family  34.64 
 
 		 230 aa  60.5  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2652  TetR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2697  TetR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.312459  normal  0.0316845 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0778  TetR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 199 aa  59.7  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.308556  normal  0.547023 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24200  transcriptional regulator, tetR family  31.68 
 
 		 204 aa  60.1  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.130166  normal  0.0410828 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2682  TetR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0327111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3021  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3303  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 191 aa  59.3  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.916403  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3270  transcriptional regulator, TetR family  25.29 
 
 		 199 aa  59.3  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3683  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 193 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.14289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1556  putative transcriptional regulator, TetR family  29.71 
 
 		 182 aa  59.3  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11588  regulatory protein  24.57 
 
 		 202 aa  58.9  0.00000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.8751e-36  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1687  regulatory protein, TetR  25 
 
 		 266 aa  58.5  0.00000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2593  putative transcriptional regulator, TetR family  28.12 
 
 		 205 aa  58.5  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0854341 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4306  TetR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 202 aa  57.8  0.00000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.651969  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3063  TetR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 192 aa  57.8  0.00000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.857011  n/a   
 
 
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NC_011894  Mnod_2402  transcriptional regulator, TetR family  31.61 
 
 		 204 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_014165  Tbis_1252  TetR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0581191  normal  0.11609 
 
 
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NC_014210  Ndas_4469  transcriptional regulator, TetR family  28.33 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008726  Mvan_4272  TetR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 191 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.814005 
 
 
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NC_008726  Mvan_5223  TetR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.325156 
 
 
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NC_008146  Mmcs_0038  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 191 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013947  Snas_1684  regulatory protein TetR  27.1 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.817144  normal  0.172233 
 
 
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NC_013441  Gbro_4603  regulatory protein TetR  30.72 
 
 		 211 aa  57  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204139  n/a   
 
 
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NC_008705  Mkms_0047  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 191 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0431132 
 
 
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NC_014165  Tbis_2574  TetR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008146  Mmcs_2430  TetR family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 189 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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