272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3818 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_3818  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 212 aa  426  1e-119  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.104466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1553  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 212 aa  159  3e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.260138 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3063  TetR family transcriptional regulator  34.66 
 
 		 192 aa  124  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.857011  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3303  TetR family transcriptional regulator  34.66 
 
 		 191 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.916403  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2652  TetR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 200 aa  108  5e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2697  TetR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 200 aa  108  5e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.312459  normal  0.0316845 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0845  transcriptional regulator, TetR family  31.63 
 
 		 200 aa  108  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2682  TetR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 200 aa  108  5e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0327111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3063  regulatory protein TetR  37.77 
 
 		 191 aa  107  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4359  transcriptional regulator, TetR family  34.12 
 
 		 205 aa  104  8e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2959  transcriptional regulator, TetR family  36.17 
 
 		 200 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5089  putative transcriptional regulator, TetR family  32.95 
 
 		 210 aa  101  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0075  transcriptional regulator, TetR family  32.39 
 
 		 194 aa  96.3  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2623  TetR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 209 aa  95.9  4e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0845142 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1478  TetR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 217 aa  94.7  9e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4073  putative transcriptional regulator, TetR family  34.13 
 
 		 208 aa  94.7  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.134392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5159  transcriptional regulator, TetR family  34.3 
 
 		 202 aa  93.6  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4255  TetR family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 216 aa  92.4  5e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.323719 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3111  transcriptional regulator, TetR family  32.93 
 
 		 203 aa  91.3  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0706  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 383 aa  89.7  3e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5770  transcriptional regulator, TetR family  31.87 
 
 		 201 aa  89.4  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.805337 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0061  transcriptional regulator, TetR family  31.35 
 
 		 224 aa  87.4  1e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5223  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 197 aa  86.7  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.325156 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1030  transcriptional regulator, TetR family  31.49 
 
 		 204 aa  86.3  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.468417  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1252  TetR family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 202 aa  85.9  4e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0581191  normal  0.11609 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1528  transcriptional regulator, TetR family  32.83 
 
 		 194 aa  85.1  7e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.680556  normal  0.906011 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1975  transcriptional regulator, TetR family  33.73 
 
 		 199 aa  84.7  9e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382484  normal  0.828211 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0011  transcriptional regulator, putative  27.32 
 
 		 179 aa  82.8  0.000000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4993  transcriptional regulator, TetR family  34.08 
 
 		 202 aa  83.2  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.309228 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5908  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 200 aa  82  0.000000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.889059 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14850  transcriptional regulator  28.99 
 
 		 224 aa  81.3  0.000000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5207  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 216 aa  81.3  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3363  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 199 aa  81.3  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5295  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 216 aa  81.3  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.334601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5587  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 216 aa  81.3  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.214408 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1763  TetR family transcriptional regulator  34.73 
 
 		 287 aa  80.5  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000686866 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6035  transcriptional regulator, TetR family  32.76 
 
 		 203 aa  80.5  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0893  regulatory protein TetR  32.98 
 
 		 194 aa  79.7  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7464  TetR family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 200 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0288781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3021  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 194 aa  79  0.00000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49231  normal  0.167388 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0884  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 237 aa  78.2  0.00000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.214434 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2332  regulatory protein, TetR  31.09 
 
 		 204 aa  77.4  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000899921 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4219  transcriptional regulator, TetR family  30.22 
 
 		 202 aa  77.4  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2221  transcriptional regulator, TetR family  34.71 
 
 		 206 aa  77.8  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20410  transcriptional regulator, tetR family  28.16 
 
 		 222 aa  77.4  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.539092  normal  0.887832 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3148  TetR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 231 aa  77  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.647957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3006  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 194 aa  77.4  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313875  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3052  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 194 aa  77.4  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2402  transcriptional regulator, TetR family  31.64 
 
 		 204 aa  76.3  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1275  transcriptional regulator, TetR family  32.97 
 
 		 214 aa  75.5  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2758  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 231 aa  73.9  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1929  transcriptional regulator, TetR family  29.52 
 
 		 214 aa  73.2  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.609447 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3270  transcriptional regulator, TetR family  29.82 
 
 		 199 aa  73.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0278  transcriptional regulator, TetR family  30.85 
 
 		 206 aa  72.8  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.72994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2593  putative transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 205 aa  72.4  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0854341 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1531  TetR family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 200 aa  72  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5008  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 201 aa  71.6  0.000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5564  transcriptional regulator, TetR family  29.27 
 
 		 201 aa  71.6  0.000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0778  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 199 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.308556  normal  0.547023 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5615  TetR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 200 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000827938  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1561  TetR family transcriptional regulator  33.92 
 
 		 200 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.478798  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5979  TetR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 200 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000443748  hitchhiker  0.000881636 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1585  TetR family transcriptional regulator  33.92 
 
 		 200 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3036  TetR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 196 aa  70.5  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1697  transcriptional regulator, TetR family  27.39 
 
 		 230 aa  70.1  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1535  TetR family transcriptional regulator  33.92 
 
 		 192 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3008  putative transcriptional regulator, TetR family  28.71 
 
 		 203 aa  68.9  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4515  transcriptional regulator, TetR family  28.49 
 
 		 191 aa  68.9  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1687  regulatory protein, TetR  33.14 
 
 		 266 aa  68.2  0.00000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1119  TetR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 213 aa  68.2  0.00000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1533  regulatory protein TetR  27.08 
 
 		 203 aa  68.2  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.987298  normal  0.249923 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3771  transcriptional regulator, TetR family  24.69 
 
 		 223 aa  67.4  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4433  putative transcriptional regulator, TetR family  42.05 
 
 		 199 aa  66.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.304497  hitchhiker  0.00999637 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0857  TetR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 181 aa  66.6  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.755905  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0874  TetR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 181 aa  66.6  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0602  transcriptional regulator, TetR family  32.4 
 
 		 209 aa  66.6  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4272  TetR family transcriptional regulator  54.24 
 
 		 191 aa  65.5  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1515  TetR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 213 aa  65.5  0.0000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3506  TetR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 195 aa  65.5  0.0000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  0.0873465 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0326  Transcriptional regulator protein  26.09 
 
 		 217 aa  65.5  0.0000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2374  TetR family transcriptional regulator  51.61 
 
 		 191 aa  65.5  0.0000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4208  TetR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 213 aa  65.1  0.0000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.826614 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2232  transcriptional regulator, TetR family  27.53 
 
 		 201 aa  64.7  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.731324  hitchhiker  0.00520971 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4074  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 214 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7472  transcriptional regulator, TetR family  24.85 
 
 		 228 aa  64.7  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4150  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 214 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4304  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 214 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.127399  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4348  transcriptional regulator, TetR family  28.25 
 
 		 198 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3176  transcriptional regulator, TetR family  25.28 
 
 		 193 aa  63.2  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00199059 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4496  TetR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 202 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0468943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3287  TetR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 195 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.443656  normal  1 
 
 
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NC_009077  Mjls_0028  TetR family transcriptional regulator  50.85 
 
 		 191 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.35435 
 
 
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NC_008146  Mmcs_0038  TetR family transcriptional regulator  50.85 
 
 		 191 aa  62.8  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013947  Snas_1684  regulatory protein TetR  25.15 
 
 		 211 aa  62.8  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.817144  normal  0.172233 
 
 
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NC_011145  AnaeK_2394  transcriptional regulator, TetR family  32.08 
 
 		 188 aa  62.8  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.469906  n/a   
 
 
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NC_013093  Amir_2385  transcriptional regulator, TetR family  34.86 
 
 		 176 aa  62.8  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000106592  n/a   
 
 
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NC_008705  Mkms_0047  TetR family transcriptional regulator  50.85 
 
 		 191 aa  62.8  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0431132 
 
 
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NC_013441  Gbro_4603  regulatory protein TetR  28.73 
 
 		 211 aa  62.4  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204139  n/a   
 
 
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NC_009077  Mjls_2963  TetR family transcriptional regulator  23.43 
 
 		 189 aa  62  0.000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.412295 
 
 
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NC_009565  TBFG_11588  regulatory protein  26.32 
 
 		 202 aa  61.6  0.000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.8751e-36  normal  1 
 
 
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