More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1556 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1556  putative transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 182 aa  353  8.999999999999999e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1528  transcriptional regulator, TetR family  48.88 
 
 		 194 aa  164  8e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.680556  normal  0.906011 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0061  transcriptional regulator, TetR family  41.14 
 
 		 224 aa  106  2e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4073  putative transcriptional regulator, TetR family  38.18 
 
 		 208 aa  105  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.134392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3311  putative transcriptional regulator, TetR family  38.78 
 
 		 192 aa  102  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0278  transcriptional regulator, TetR family  37.89 
 
 		 206 aa  100  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.72994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2623  TetR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 209 aa  99.8  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0845142 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7526  putative transcriptional regulator, TetR family  40.36 
 
 		 204 aa  99  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5089  putative transcriptional regulator, TetR family  33.86 
 
 		 210 aa  99  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4359  transcriptional regulator, TetR family  36.26 
 
 		 205 aa  98.2  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5908  TetR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 200 aa  97.4  9e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.889059 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0075  transcriptional regulator, TetR family  36.75 
 
 		 194 aa  97.4  9e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4219  transcriptional regulator, TetR family  36.42 
 
 		 202 aa  94.7  6e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3441  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 215 aa  94.4  8e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14850  transcriptional regulator  37.22 
 
 		 224 aa  93.2  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1030  transcriptional regulator, TetR family  37.85 
 
 		 204 aa  92.8  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.468417  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7464  TetR family transcriptional regulator  35.67 
 
 		 200 aa  91.3  7e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0288781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5818  TetR family transcriptional regulator  39.69 
 
 		 216 aa  90.9  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.199964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3270  transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 		 199 aa  89.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3176  transcriptional regulator, TetR family  36.46 
 
 		 193 aa  89.7  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00199059 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3063  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 192 aa  89  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.857011  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3021  TetR family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 210 aa  89.4  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1478  TetR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 217 aa  89.4  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1975  transcriptional regulator, TetR family  32.96 
 
 		 199 aa  87.4  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382484  normal  0.828211 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5615  TetR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 200 aa  86.7  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000827938  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2555  TetR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 205 aa  86.7  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5979  TetR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 200 aa  86.7  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000443748  hitchhiker  0.000881636 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2758  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 231 aa  85.9  3e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3303  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 191 aa  85.5  4e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.916403  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4685  transcriptional regulator, TetR family  40.26 
 
 		 205 aa  85.1  5e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.421028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5159  transcriptional regulator, TetR family  33.97 
 
 		 202 aa  85.1  5e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1275  transcriptional regulator, TetR family  36.57 
 
 		 214 aa  83.6  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5564  transcriptional regulator, TetR family  36.76 
 
 		 201 aa  83.6  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2332  regulatory protein, TetR  35.14 
 
 		 204 aa  82.4  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000899921 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4515  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 191 aa  82.4  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3036  TetR family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 196 aa  82.8  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2221  transcriptional regulator, TetR family  32.57 
 
 		 206 aa  80.9  0.000000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2727  TetR family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 192 aa  80.1  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109313 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4502  putative transcriptional regulator, TetR family  44.12 
 
 		 249 aa  79.3  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.789852 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3006  TetR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 194 aa  79.3  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313875  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0326  Transcriptional regulator protein  36.78 
 
 		 217 aa  79.3  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3052  TetR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 194 aa  79.3  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4348  transcriptional regulator, TetR family  32.72 
 
 		 198 aa  79  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3528  transcriptional regulator, TetR family  38.13 
 
 		 192 aa  78.6  0.00000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.069513  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1370  transcriptional regulator, TetR family  36.81 
 
 		 199 aa  77.8  0.00000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3021  TetR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 194 aa  77.8  0.00000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49231  normal  0.167388 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3813  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 222 aa  77.4  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0327168  normal  0.449726 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0778  TetR family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 199 aa  77  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.308556  normal  0.547023 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0884  TetR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 237 aa  77  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.214434 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0706  TetR family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 383 aa  76.6  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11588  regulatory protein  33.33 
 
 		 202 aa  76.6  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.8751e-36  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4620  transcriptional regulator, TetR family  38.59 
 
 		 194 aa  75.9  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.732833  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2232  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 201 aa  75.5  0.0000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.731324  hitchhiker  0.00520971 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2454  TetR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 185 aa  75.1  0.0000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1961  TetR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 187 aa  75.1  0.0000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.797544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1387  transcriptional regulator, TetR family  35.36 
 
 		 213 aa  74.7  0.0000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2402  transcriptional regulator, TetR family  32.22 
 
 		 204 aa  74.7  0.0000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0028  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 191 aa  74.7  0.0000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.35435 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0893  regulatory protein TetR  36.63 
 
 		 194 aa  74.3  0.0000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0038  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 191 aa  74.3  0.0000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0047  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 191 aa  74.3  0.0000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0431132 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1687  regulatory protein, TetR  36.88 
 
 		 266 aa  74.3  0.0000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2012  transcriptional regulator, TetR family  31.51 
 
 		 206 aa  73.6  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.719864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3818  transcriptional regulator, TetR family  32.39 
 
 		 212 aa  73.6  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.104466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3506  TetR family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 195 aa  73.9  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  0.0873465 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3771  transcriptional regulator, TetR family  34.91 
 
 		 223 aa  73.9  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2574  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 213 aa  74.3  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1163  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 189 aa  73.9  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.370888  normal  0.723677 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1531  TetR family transcriptional regulator  32.9 
 
 		 200 aa  73.2  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1474  TetR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 188 aa  72.8  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2959  transcriptional regulator, TetR family  37.71 
 
 		 200 aa  72.8  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3287  TetR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 195 aa  72.4  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.443656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3008  putative transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 203 aa  72.4  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1434  transcriptional regulator, TetR family  35.2 
 
 		 185 aa  72  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2482  transcriptional regulator, TetR family  35.58 
 
 		 230 aa  72  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2792  transcriptional regulator, TetR family  36.31 
 
 		 248 aa  71.6  0.000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.41359  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3683  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 193 aa  71.6  0.000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.14289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3063  regulatory protein TetR  36.51 
 
 		 191 aa  72  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7472  transcriptional regulator, TetR family  33.51 
 
 		 228 aa  71.6  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1870  TetR family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 200 aa  71.6  0.000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.524009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1561  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 200 aa  70.9  0.000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.478798  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1585  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 200 aa  70.9  0.000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05420  transcriptional regulator, tetR family  38.51 
 
 		 188 aa  70.9  0.00000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2394  transcriptional regulator, TetR family  35.22 
 
 		 188 aa  69.7  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.469906  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4006  transcriptional regulator, TetR family  36.42 
 
 		 193 aa  70.1  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.685052  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4339  TetR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 207 aa  69.3  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00746452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0691  regulatory protein TetR  32.57 
 
 		 202 aa  69.3  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3324  transcriptional regulator, TetR family  37.72 
 
 		 225 aa  68.9  0.00000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.748824 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0602  transcriptional regulator, TetR family  29.45 
 
 		 209 aa  68.9  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4786  regulatory protein TetR  34.81 
 
 		 189 aa  68.2  0.00000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013947  Snas_3363  transcriptional regulator, TetR family  40.8 
 
 		 199 aa  67.8  0.00000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1929  transcriptional regulator, TetR family  37.27 
 
 		 214 aa  67.8  0.00000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.609447 
 
 
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NC_008146  Mmcs_2948  TetR family transcriptional regulator  34.42 
 
 		 191 aa  67  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008705  Mkms_2992  TetR family transcriptional regulator  34.42 
 
 		 191 aa  67  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.385096  normal  0.373192 
 
 
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NC_014210  Ndas_4469  transcriptional regulator, TetR family  33.75 
 
 		 202 aa  67  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011004  Rpal_1006  transcriptional regulator, TetR family  31.29 
 
 		 190 aa  66.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.217455  n/a   
 
 
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NC_009921  Franean1_6626  TetR family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 210 aa  66.2  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009338  Mflv_5169  hypothetical protein  31.86 
 
 		 188 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.27231  normal  0.324397 
 
 
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NC_013595  Sros_4433  putative transcriptional regulator, TetR family  34.68 
 
 		 199 aa  66.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.304497  hitchhiker  0.00999637 
 
 
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NC_013521  Sked_12090  transcriptional regulator, tetR family  34.64 
 
 		 182 aa  66.6  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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