102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_5169 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_5169  hypothetical protein  100 
 
 		 188 aa  373  1e-103  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.27231  normal  0.324397 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1163  TetR family transcriptional regulator  73.89 
 
 		 189 aa  271  5.000000000000001e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.370888  normal  0.723677 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4883  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 187 aa  108  3e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00152311 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1545  hypothetical protein  36.53 
 
 		 186 aa  107  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.418833 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1533  regulatory protein TetR  36 
 
 		 203 aa  76.6  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.987298  normal  0.249923 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2555  TetR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 205 aa  73.9  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0278  transcriptional regulator, TetR family  35.22 
 
 		 206 aa  73.9  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.72994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4073  putative transcriptional regulator, TetR family  33.96 
 
 		 208 aa  72  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.134392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5615  TetR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 200 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000827938  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5979  TetR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 200 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000443748  hitchhiker  0.000881636 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2221  transcriptional regulator, TetR family  30.23 
 
 		 206 aa  65.1  0.0000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3063  TetR family transcriptional regulator  24.28 
 
 		 192 aa  64.7  0.0000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.857011  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3303  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 191 aa  63.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.916403  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0706  TetR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 383 aa  63.2  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7464  TetR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 200 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0288781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3311  putative transcriptional regulator, TetR family  30.23 
 
 		 192 aa  61.2  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2482  transcriptional regulator, TetR family  34.09 
 
 		 230 aa  60.8  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0884  TetR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 237 aa  60.1  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.214434 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0061  transcriptional regulator, TetR family  32.93 
 
 		 224 aa  59.7  0.00000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7144  transcriptional regulator, TetR family  30.23 
 
 		 188 aa  59.7  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.251131 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1975  transcriptional regulator, TetR family  31.69 
 
 		 199 aa  59.3  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382484  normal  0.828211 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5908  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 200 aa  58.9  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.889059 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1556  putative transcriptional regulator, TetR family  31.69 
 
 		 182 aa  58.9  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1528  transcriptional regulator, TetR family  25.31 
 
 		 194 aa  58.9  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.680556  normal  0.906011 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1474  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 188 aa  58.5  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3683  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 193 aa  58.5  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.14289  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2574  TetR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 213 aa  58.2  0.00000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1030  transcriptional regulator, TetR family  27.87 
 
 		 204 aa  57  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.468417  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3111  transcriptional regulator, TetR family  30.57 
 
 		 203 aa  57  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4457  TetR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.108103 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1434  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 185 aa  55.5  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4219  transcriptional regulator, TetR family  28.96 
 
 		 202 aa  55.1  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2758  TetR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 231 aa  54.7  0.0000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6626  TetR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 210 aa  54.7  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2394  transcriptional regulator, TetR family  31.49 
 
 		 188 aa  54.3  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.469906  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4135  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 194 aa  53.5  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2037  transcriptional regulator, TetR family  29.28 
 
 		 234 aa  53.5  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3176  transcriptional regulator, TetR family  28.42 
 
 		 193 aa  53.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00199059 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20410  transcriptional regulator, tetR family  26.32 
 
 		 222 aa  53.5  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.539092  normal  0.887832 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4993  transcriptional regulator, TetR family  27.04 
 
 		 202 aa  53.1  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.309228 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3006  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 194 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313875  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3052  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 194 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3021  TetR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 194 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49231  normal  0.167388 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2727  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 192 aa  51.6  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109313 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2623  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 209 aa  51.6  0.000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0845142 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3324  transcriptional regulator, TetR family  32.92 
 
 		 225 aa  50.4  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.748824 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1685  transcriptional regulator  24.82 
 
 		 197 aa  50.4  0.00002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3441  TetR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 215 aa  49.3  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0845  transcriptional regulator, TetR family  25.13 
 
 		 200 aa  49.3  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1387  transcriptional regulator, TetR family  31.45 
 
 		 213 aa  49.7  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14850  transcriptional regulator  27.33 
 
 		 224 aa  49.7  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2792  transcriptional regulator, TetR family  27.22 
 
 		 248 aa  48.9  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.41359  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4006  transcriptional regulator, TetR family  28.97 
 
 		 193 aa  48.9  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.685052  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4515  transcriptional regulator, TetR family  26.53 
 
 		 191 aa  48.1  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3260  TetR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 213 aa  48.5  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.122521  normal  0.297775 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7526  putative transcriptional regulator, TetR family  28.03 
 
 		 204 aa  47.8  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0014  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 234 aa  47.8  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.730336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3036  TetR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 196 aa  47.8  0.00009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2402  transcriptional regulator, TetR family  26.88 
 
 		 204 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1616  transcriptional regulator, TetR family  31.64 
 
 		 224 aa  47.4  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.86283 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1961  TetR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 187 aa  47  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.797544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0492  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 193 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.496213  normal  0.296626 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1478  TetR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 217 aa  47  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1370  transcriptional regulator, TetR family  28.07 
 
 		 199 aa  47  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1237  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 219 aa  47  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.689055  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2283  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 173 aa  46.2  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000000171234  hitchhiker  0.000491617 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4469  transcriptional regulator, TetR family  28.38 
 
 		 202 aa  46.2  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28220  transcriptional regulator  29.33 
 
 		 195 aa  45.8  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2120  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 187 aa  45.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.613447  normal  0.0993721 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0326  Transcriptional regulator protein  25.13 
 
 		 217 aa  45.4  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4158  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 205 aa  43.9  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.000188504  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5818  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 216 aa  44.3  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.199964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0223  putative transcriptional regulator, TetR family  29.67 
 
 		 185 aa  43.9  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7472  transcriptional regulator, TetR family  24.19 
 
 		 228 aa  43.9  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4740  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 196 aa  43.9  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.609223  normal  0.406356 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2652  TetR family transcriptional regulator  25.65 
 
 		 200 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2697  TetR family transcriptional regulator  25.65 
 
 		 200 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.312459  normal  0.0316845 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2682  TetR family transcriptional regulator  25.65 
 
 		 200 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0327111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1006  transcriptional regulator, TetR family  27.04 
 
 		 190 aa  43.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.217455  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3714  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 178 aa  43.1  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.530873  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4786  regulatory protein TetR  27.88 
 
 		 189 aa  43.1  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4359  transcriptional regulator, TetR family  24.26 
 
 		 205 aa  43.5  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1023  regulatory protein TetR  30.53 
 
 		 196 aa  43.5  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.932216  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5089  putative transcriptional regulator, TetR family  24.07 
 
 		 210 aa  43.5  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3270  transcriptional regulator, TetR family  22.68 
 
 		 199 aa  42.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4502  putative transcriptional regulator, TetR family  29.45 
 
 		 249 aa  42.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.789852 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2232  transcriptional regulator, TetR family  26.28 
 
 		 201 aa  43.1  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.731324  hitchhiker  0.00520971 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5770  transcriptional regulator, TetR family  26.04 
 
 		 201 aa  42.4  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.805337 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6347  TetR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 200 aa  42  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0602  transcriptional regulator, TetR family  29.7 
 
 		 209 aa  42  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5564  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 201 aa  42  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0091  TetR family transcriptional regulator  27.53 
 
 		 187 aa  42  0.006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0611138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0028  TetR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 191 aa  42  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.35435 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1697  transcriptional regulator, TetR family  23.9 
 
 		 230 aa  42  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0521  regulatory protein TetR  28.95 
 
 		 188 aa  41.6  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.368507  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0038  TetR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 191 aa  41.2  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0047  TetR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 191 aa  41.2  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0431132 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1687  regulatory protein, TetR  30.72 
 
 		 266 aa  41.6  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3173  TetR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 213 aa  41.2  0.009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2332  regulatory protein, TetR  25.15 
 
 		 204 aa  41.2  0.01  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000899921 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>