More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4469 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



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Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_4469  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 
202 aa  396  1e-109  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2792  transcriptional regulator, TetR family  54.46 
 
 
248 aa  217  7.999999999999999e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.41359  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4006  transcriptional regulator, TetR family  49.47 
 
 
193 aa  148  5e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.685052  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2555  TetR family transcriptional regulator  38.04 
 
 
205 aa  98.6  5e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3036  TetR family transcriptional regulator  37.58 
 
 
196 aa  92.8  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3008  putative transcriptional regulator, TetR family  38.65 
 
 
203 aa  90.1  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7464  TetR family transcriptional regulator  36.2 
 
 
200 aa  85.9  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0288781  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0278  transcriptional regulator, TetR family  38.12 
 
 
206 aa  85.9  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.72994  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5615  TetR family transcriptional regulator  35.81 
 
 
200 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000827938  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5979  TetR family transcriptional regulator  35.81 
 
 
200 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000443748  hitchhiker  0.000881636 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2221  transcriptional regulator, TetR family  36.53 
 
 
206 aa  82.4  0.000000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6626  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 
210 aa  80.5  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4073  putative transcriptional regulator, TetR family  35.4 
 
 
208 aa  79.3  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.134392  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1387  transcriptional regulator, TetR family  35.57 
 
 
213 aa  77.4  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0884  TetR family transcriptional regulator  32.29 
 
 
237 aa  76.3  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.214434 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3111  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 
203 aa  73.2  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3176  transcriptional regulator, TetR family  35.11 
 
 
193 aa  72.8  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00199059 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2482  transcriptional regulator, TetR family  38.99 
 
 
230 aa  73.2  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5908  TetR family transcriptional regulator  31.79 
 
 
200 aa  72.8  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.889059 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1929  transcriptional regulator, TetR family  37.28 
 
 
214 aa  73.2  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.609447 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0706  TetR family transcriptional regulator  34.84 
 
 
383 aa  72.4  0.000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7144  transcriptional regulator, TetR family  36.6 
 
 
188 aa  72.8  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.251131 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4219  transcriptional regulator, TetR family  29.69 
 
 
202 aa  72.4  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7526  putative transcriptional regulator, TetR family  38.03 
 
 
204 aa  71.6  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277737  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0602  transcriptional regulator, TetR family  35.54 
 
 
209 aa  71.2  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4074  TetR family transcriptional regulator  37.85 
 
 
214 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4150  TetR family transcriptional regulator  37.85 
 
 
214 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4304  TetR family transcriptional regulator  37.85 
 
 
214 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.127399  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5818  TetR family transcriptional regulator  34.27 
 
 
216 aa  68.9  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.199964  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3771  transcriptional regulator, TetR family  31.55 
 
 
223 aa  68.9  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0038  TetR family transcriptional regulator  32.66 
 
 
191 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0047  TetR family transcriptional regulator  32.66 
 
 
191 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0431132 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4883  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
187 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00152311 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0028  TetR family transcriptional regulator  32.66 
 
 
191 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.35435 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2332  regulatory protein, TetR  31.43 
 
 
204 aa  66.2  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000899921 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5089  putative transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 
210 aa  65.9  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1533  regulatory protein TetR  32.18 
 
 
203 aa  65.5  0.0000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.987298  normal  0.249923 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1975  transcriptional regulator, TetR family  29.53 
 
 
199 aa  65.1  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382484  normal  0.828211 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1006  transcriptional regulator, TetR family  35.38 
 
 
190 aa  64.7  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.217455  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1467  hypothetical protein  30.51 
 
 
213 aa  64.7  0.0000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.165444  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1275  transcriptional regulator, TetR family  32.85 
 
 
214 aa  63.9  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1684  regulatory protein TetR  32.98 
 
 
211 aa  63.5  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.817144  normal  0.172233 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4685  transcriptional regulator, TetR family  39.74 
 
 
205 aa  63.9  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.421028  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0061  transcriptional regulator, TetR family  34.19 
 
 
224 aa  63.2  0.000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4272  TetR family transcriptional regulator  34.04 
 
 
191 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2374  TetR family transcriptional regulator  34.02 
 
 
191 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1237  transcriptional regulator, TetR family  34.5 
 
 
219 aa  62.8  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.689055  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1474  TetR family transcriptional regulator  34.36 
 
 
188 aa  62.4  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4434  transcriptional regulator  43.96 
 
 
203 aa  62  0.000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.147694  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4158  TetR family transcriptional regulator  32.21 
 
 
205 aa  62  0.000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.000188504  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1545  hypothetical protein  28.57 
 
 
186 aa  62  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.418833 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4135  TetR family transcriptional regulator  30.18 
 
 
194 aa  61.6  0.000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5887  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 
187 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.350094 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0326  Transcriptional regulator protein  32.21 
 
 
217 aa  61.2  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3063  TetR family transcriptional regulator  26.45 
 
 
192 aa  60.1  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.857011  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2394  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 
188 aa  60.5  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.469906  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0091  TetR family transcriptional regulator  30.06 
 
 
187 aa  60.1  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0611138  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0691  regulatory protein TetR  30.82 
 
 
202 aa  60.1  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3270  transcriptional regulator, TetR family  35.35 
 
 
199 aa  60.1  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0867  transcriptional regulator, TetR family  34.81 
 
 
202 aa  60.1  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3311  putative transcriptional regulator, TetR family  35.51 
 
 
192 aa  60.1  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4993  transcriptional regulator, TetR family  28.43 
 
 
202 aa  60.5  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.309228 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2623  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 
209 aa  59.3  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0845142 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5223  TetR family transcriptional regulator  29.69 
 
 
197 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.325156 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3303  TetR family transcriptional regulator  27.1 
 
 
191 aa  58.9  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.916403  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3148  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 
231 aa  58.9  0.00000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.647957  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4786  regulatory protein TetR  31.69 
 
 
189 aa  57.4  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2652  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 
200 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2454  TetR family transcriptional regulator  28.33 
 
 
185 aa  57.4  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2697  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 
200 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.312459  normal  0.0316845 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3506  TetR family transcriptional regulator  33.54 
 
 
195 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  0.0873465 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3260  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 
213 aa  57.8  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.122521  normal  0.297775 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2682  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 
200 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0327111  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2963  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 
189 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.412295 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3333  transcriptional regulator, TetR family  31.02 
 
 
211 aa  57.4  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.618946 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4433  putative transcriptional regulator, TetR family  32.69 
 
 
199 aa  56.6  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.304497  hitchhiker  0.00999637 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4348  transcriptional regulator, TetR family  35.58 
 
 
198 aa  56.6  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0830  TetR family transcriptional regulator  34.53 
 
 
195 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4818  transcriptional regulator, TetR family  28.49 
 
 
208 aa  56.2  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.945526  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2574  TetR family transcriptional regulator  34.88 
 
 
213 aa  56.2  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1870  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
200 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.524009  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0845  transcriptional regulator, TetR family  30.1 
 
 
200 aa  55.8  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3998  transcriptional regulator, TetR family  30.56 
 
 
245 aa  55.8  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000456955  normal  0.178314 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4457  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 
209 aa  55.8  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.108103 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1556  putative transcriptional regulator, TetR family  37.93 
 
 
182 aa  55.5  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1616  transcriptional regulator, TetR family  43.66 
 
 
224 aa  55.5  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.86283 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3324  transcriptional regulator, TetR family  35.21 
 
 
225 aa  55.5  0.0000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.748824 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2948  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 
191 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_008705  Mkms_2992  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 
191 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.385096  normal  0.373192 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2677  transcriptional regulator, TetR family  34.45 
 
 
206 aa  55.1  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0882789  normal  0.108498 
 
 
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NC_008726  Mvan_1961  TetR family transcriptional regulator  31.29 
 
 
187 aa  55.1  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.797544  normal 
 
 
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NC_013131  Caci_0075  transcriptional regulator, TetR family  29.01 
 
 
194 aa  55.1  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_007005  Psyr_3026  transcriptional regulator, putative  29.63 
 
 
181 aa  55.1  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.127274  normal  0.152535 
 
 
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NC_013160  Cyan8802_4515  transcriptional regulator, TetR family  36.47 
 
 
191 aa  54.7  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_009921  Franean1_1478  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 
217 aa  54.7  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_013131  Caci_4359  transcriptional regulator, TetR family  31.1 
 
 
205 aa  54.3  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.23587 
 
 
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NC_010002  Daci_1889  TetR family transcriptional regulator  26.88 
 
 
195 aa  54.3  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_013739  Cwoe_5159  transcriptional regulator, TetR family  30.12 
 
 
202 aa  54.3  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_008726  Mvan_3287  TetR family transcriptional regulator  34.75 
 
 
195 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.443656  normal 
 
 
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NC_013441  Gbro_0893  regulatory protein TetR  32.37 
 
 
194 aa  53.5  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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