295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_1531 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



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Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1561  TetR family transcriptional regulator  99.5 
 
 
200 aa  385  1e-106  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.478798  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1585  TetR family transcriptional regulator  99.5 
 
 
200 aa  385  1e-106  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1531  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
200 aa  386  1e-106  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1870  TetR family transcriptional regulator  75 
 
 
200 aa  283  9e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.524009  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4496  TetR family transcriptional regulator  71 
 
 
202 aa  275  5e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0468943  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13188  TetR family transcriptional regulator  76.26 
 
 
208 aa  268  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.166406 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4603  regulatory protein TetR  58.46 
 
 
211 aa  214  9.999999999999999e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204139  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4384  TetR family transcriptional regulator  43.85 
 
 
208 aa  144  9e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1961  TetR family transcriptional regulator  41.62 
 
 
187 aa  142  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.797544  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0492  TetR family transcriptional regulator  43.85 
 
 
193 aa  123  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.496213  normal  0.296626 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1821  TetR family transcriptional regulator  41.99 
 
 
199 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.305938 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3153  TetR family transcriptional regulator  38.92 
 
 
215 aa  95.9  4e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.755786  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3270  transcriptional regulator, TetR family  28.27 
 
 
199 aa  93.6  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4348  transcriptional regulator, TetR family  32.6 
 
 
198 aa  91.7  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5233  TetR family transcriptional regulator  36.59 
 
 
184 aa  86.7  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.494471  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5321  TetR family transcriptional regulator  36.59 
 
 
184 aa  86.7  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.868815 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1275  transcriptional regulator, TetR family  36.17 
 
 
214 aa  85.9  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5613  TetR family transcriptional regulator  36.59 
 
 
184 aa  85.9  4e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.687182  normal  0.405211 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20410  transcriptional regulator, tetR family  33.51 
 
 
222 aa  84  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.539092  normal  0.887832 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3176  transcriptional regulator, TetR family  37.85 
 
 
193 aa  83.6  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00199059 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5564  transcriptional regulator, TetR family  32.96 
 
 
201 aa  83.2  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2555  TetR family transcriptional regulator  32.8 
 
 
205 aa  82.8  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2700  TetR family transcriptional regulator  32.78 
 
 
200 aa  82.8  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3771  transcriptional regulator, TetR family  33.15 
 
 
223 aa  82  0.000000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0061  transcriptional regulator, TetR family  36.11 
 
 
224 aa  81.3  0.000000000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5615  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
200 aa  81.3  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000827938  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5979  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
200 aa  81.3  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000443748  hitchhiker  0.000881636 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1030  transcriptional regulator, TetR family  35.2 
 
 
204 aa  80.1  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.468417  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2670  TetR family transcriptional regulator  32.07 
 
 
214 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.545748  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2715  TetR family transcriptional regulator  32.07 
 
 
214 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.180608  normal  0.0320009 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3021  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
194 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49231  normal  0.167388 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5908  TetR family transcriptional regulator  34.39 
 
 
200 aa  77.4  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.889059 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4515  transcriptional regulator, TetR family  29.32 
 
 
191 aa  77.8  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3006  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 
194 aa  76.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313875  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3052  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 
194 aa  76.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2037  transcriptional regulator, TetR family  35.16 
 
 
234 aa  76.3  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5089  putative transcriptional regulator, TetR family  30.52 
 
 
210 aa  74.3  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14850  transcriptional regulator  39.35 
 
 
224 aa  73.2  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2758  TetR family transcriptional regulator  37.57 
 
 
231 aa  73.2  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0778  TetR family transcriptional regulator  35.16 
 
 
199 aa  72.4  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.308556  normal  0.547023 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3225  TetR family transcriptional regulator  36.47 
 
 
213 aa  71.6  0.000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.314279  normal  0.210871 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7464  TetR family transcriptional regulator  31.68 
 
 
200 aa  71.2  0.000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0288781  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0706  TetR family transcriptional regulator  32.8 
 
 
383 aa  71.2  0.000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4073  putative transcriptional regulator, TetR family  31.87 
 
 
208 aa  71.2  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.134392  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1684  regulatory protein TetR  35.59 
 
 
211 aa  70.5  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.817144  normal  0.172233 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3063  TetR family transcriptional regulator  29.05 
 
 
192 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.857011  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1370  transcriptional regulator, TetR family  36.91 
 
 
199 aa  70.5  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2574  TetR family transcriptional regulator  33.75 
 
 
213 aa  70.5  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7472  transcriptional regulator, TetR family  30.61 
 
 
228 aa  70.1  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3303  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 
191 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.916403  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2332  regulatory protein, TetR  30.56 
 
 
204 aa  67.8  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000899921 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4359  transcriptional regulator, TetR family  31.11 
 
 
205 aa  67.4  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1528  transcriptional regulator, TetR family  30.99 
 
 
194 aa  66.6  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.680556  normal  0.906011 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3818  transcriptional regulator, TetR family  34.5 
 
 
212 aa  66.2  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.104466  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5008  TetR family transcriptional regulator  34.24 
 
 
201 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1975  transcriptional regulator, TetR family  31.29 
 
 
199 aa  65.9  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382484  normal  0.828211 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3683  TetR family transcriptional regulator  32.96 
 
 
193 aa  65.1  0.0000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.14289  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0893  regulatory protein TetR  34.34 
 
 
194 aa  64.7  0.0000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5207  TetR family transcriptional regulator  29.47 
 
 
216 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1616  transcriptional regulator, TetR family  34.15 
 
 
224 aa  64.3  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.86283 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5295  TetR family transcriptional regulator  29.47 
 
 
216 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.334601  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5223  TetR family transcriptional regulator  30.12 
 
 
197 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.325156 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5587  TetR family transcriptional regulator  29.47 
 
 
216 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.214408 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0011  transcriptional regulator, putative  22.58 
 
 
179 aa  63.2  0.000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2623  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 
209 aa  63.5  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0845142 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2677  transcriptional regulator, TetR family  36.72 
 
 
206 aa  63.2  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0882789  normal  0.108498 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0873  transcriptional regulator, TetR family  34.55 
 
 
215 aa  63.5  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00991598  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6035  transcriptional regulator, TetR family  31.11 
 
 
203 aa  63.9  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0602  transcriptional regulator, TetR family  31.33 
 
 
209 aa  63.5  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1467  hypothetical protein  42.55 
 
 
213 aa  63.2  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.165444  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4754  transcriptional regulator, TetR family  58.18 
 
 
216 aa  62.8  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00853884  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4219  transcriptional regulator, TetR family  32.94 
 
 
202 aa  62.4  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1474  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 
188 aa  62.4  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0872  transcriptional regulator, TetR family  46.25 
 
 
212 aa  62.4  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.83423  normal  0.281851 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3111  transcriptional regulator, TetR family  33.92 
 
 
203 aa  62.4  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4740  transcriptional regulator, TetR family  32.03 
 
 
196 aa  62  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.609223  normal  0.406356 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2727  TetR family transcriptional regulator  32.11 
 
 
192 aa  62  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.109313 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2948  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
191 aa  61.6  0.000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2992  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
191 aa  61.6  0.000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.385096  normal  0.373192 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2959  transcriptional regulator, TetR family  33.74 
 
 
200 aa  61.2  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4339  TetR family transcriptional regulator  33.55 
 
 
207 aa  60.8  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00746452  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0364  TetR family transcriptional regulator  34.27 
 
 
209 aa  60.8  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1478  TetR family transcriptional regulator  30.22 
 
 
217 aa  60.8  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1556  putative transcriptional regulator, TetR family  32.9 
 
 
182 aa  61.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2593  putative transcriptional regulator, TetR family  32.89 
 
 
205 aa  60.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0854341 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4851  TetR family transcriptional regulator  33.11 
 
 
209 aa  61.2  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000188922 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1434  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 
185 aa  60.8  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2394  transcriptional regulator, TetR family  35.37 
 
 
188 aa  60.8  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.469906  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0028  TetR family transcriptional regulator  35.17 
 
 
191 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.35435 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2482  transcriptional regulator, TetR family  33.5 
 
 
230 aa  60.5  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0038  TetR family transcriptional regulator  35.17 
 
 
191 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2652  TetR family transcriptional regulator  31.47 
 
 
200 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3063  regulatory protein TetR  33.7 
 
 
191 aa  60.1  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3344  TetR family transcriptional regulator  31.36 
 
 
202 aa  60.1  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.685113 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0047  TetR family transcriptional regulator  35.17 
 
 
191 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0431132 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2697  TetR family transcriptional regulator  31.47 
 
 
200 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.312459  normal  0.0316845 
 
 
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NC_009953  Sare_3036  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 
196 aa  60.1  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_009664  Krad_3324  transcriptional regulator, TetR family  32.39 
 
 
225 aa  60.1  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.748824 
 
 
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NC_009077  Mjls_2682  TetR family transcriptional regulator  31.47 
 
 
200 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0327111  normal 
 
 
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NC_009077  Mjls_2963  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 
189 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.412295 
 
 
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