151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3153 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_3153  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 215 aa  419  1e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.755786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2700  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 200 aa  108  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2670  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 214 aa  107  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.545748  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2715  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 214 aa  107  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.180608  normal  0.0320009 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1961  TetR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 187 aa  99  5e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.797544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4384  TetR family transcriptional regulator  37.43 
 
 		 208 aa  98.2  8e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1531  TetR family transcriptional regulator  38.92 
 
 		 200 aa  95.9  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1561  TetR family transcriptional regulator  38.92 
 
 		 200 aa  95.5  6e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.478798  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1585  TetR family transcriptional regulator  38.92 
 
 		 200 aa  95.5  6e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4496  TetR family transcriptional regulator  39.38 
 
 		 202 aa  94.4  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0468943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4603  regulatory protein TetR  36.96 
 
 		 211 aa  91.7  7e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204139  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1870  TetR family transcriptional regulator  38.22 
 
 		 200 aa  91.7  8e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.524009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13188  TetR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 208 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.166406 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2402  transcriptional regulator, TetR family  29.9 
 
 		 204 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1821  TetR family transcriptional regulator  35.08 
 
 		 199 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.305938 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5233  TetR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 184 aa  69.3  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.494471  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5321  TetR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 184 aa  69.3  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.868815 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5613  TetR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 184 aa  69.3  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.687182  normal  0.405211 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0492  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 193 aa  68.6  0.00000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.496213  normal  0.296626 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2332  regulatory protein, TetR  28.37 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000899921 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6035  transcriptional regulator, TetR family  33.53 
 
 		 203 aa  58.5  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3225  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 213 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.314279  normal  0.210871 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0061  transcriptional regulator, TetR family  31.64 
 
 		 224 aa  57.8  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5564  transcriptional regulator, TetR family  38.28 
 
 		 201 aa  57  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4339  TetR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00746452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3063  regulatory protein TetR  30.12 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3683  TetR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 193 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.14289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5207  TetR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 216 aa  55.5  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5295  TetR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 216 aa  55.5  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.334601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5587  TetR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 216 aa  55.5  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.214408 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20410  transcriptional regulator, tetR family  25.41 
 
 		 222 aa  55.1  0.0000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.539092  normal  0.887832 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3303  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 191 aa  54.7  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.916403  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5615  TetR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 200 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000827938  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5979  TetR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 200 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000443748  hitchhiker  0.000881636 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5159  transcriptional regulator, TetR family  29.83 
 
 		 202 aa  54.7  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3063  TetR family transcriptional regulator  24.85 
 
 		 192 aa  54.3  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.857011  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2827  transcriptional regulator, TetR family  33.08 
 
 		 186 aa  53.9  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.05215  normal  0.803833 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3111  transcriptional regulator, TetR family  41.84 
 
 		 203 aa  53.5  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3506  TetR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 195 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  0.0873465 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1763  TetR family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 287 aa  53.1  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000686866 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0893  regulatory protein TetR  44.59 
 
 		 194 aa  53.1  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1684  regulatory protein TetR  28.21 
 
 		 211 aa  52  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.817144  normal  0.172233 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0778  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 199 aa  51.6  0.000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.308556  normal  0.547023 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4433  putative transcriptional regulator, TetR family  30.23 
 
 		 199 aa  51.2  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.304497  hitchhiker  0.00999637 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2454  TetR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 185 aa  51.2  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5089  putative transcriptional regulator, TetR family  24.88 
 
 		 210 aa  50.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4993  transcriptional regulator, TetR family  25.39 
 
 		 202 aa  50.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.309228 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1370  transcriptional regulator, TetR family  29.81 
 
 		 199 aa  50.1  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3270  transcriptional regulator, TetR family  22.35 
 
 		 199 aa  50.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0028  TetR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 191 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.35435 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5008  TetR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 201 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7472  transcriptional regulator, TetR family  26.88 
 
 		 228 aa  49.3  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0038  TetR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 191 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0047  TetR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 191 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0431132 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3021  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 194 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49231  normal  0.167388 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3006  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 194 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313875  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3052  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 194 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4272  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 191 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3148  TetR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 231 aa  48.5  0.00008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.647957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0884  TetR family transcriptional regulator  26 
 
 		 237 aa  48.5  0.00008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.214434 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 223 aa  48.1  0.00009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5488  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 238 aa  47.8  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2758  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 231 aa  47.8  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2652  TetR family transcriptional regulator  24.74 
 
 		 200 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2697  TetR family transcriptional regulator  24.74 
 
 		 200 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.312459  normal  0.0316845 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2682  TetR family transcriptional regulator  24.74 
 
 		 200 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0327111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2963  TetR family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 189 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.412295 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2374  TetR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 191 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3344  TetR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 202 aa  47.8  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.685113 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2555  TetR family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 205 aa  48.1  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2444  TetR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 217 aa  47  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2948  TetR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 191 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2992  TetR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 191 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.385096  normal  0.373192 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4818  transcriptional regulator, TetR family  24.16 
 
 		 208 aa  47.4  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.945526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2593  putative transcriptional regulator, TetR family  28.49 
 
 		 205 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0854341 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3176  transcriptional regulator, TetR family  39.66 
 
 		 193 aa  46.6  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00199059 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2959  transcriptional regulator, TetR family  29.21 
 
 		 200 aa  46.6  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3260  TetR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 213 aa  45.8  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.122521  normal  0.297775 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16790  TetR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 212 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7136  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 237 aa  46.2  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00720754  normal  0.217815 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1687  regulatory protein, TetR  29.59 
 
 		 266 aa  46.2  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1461  putative transcriptional regulator  28.92 
 
 		 212 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3818  transcriptional regulator, TetR family  25.56 
 
 		 212 aa  46.2  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.104466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4754  transcriptional regulator, TetR family  40.58 
 
 		 216 aa  46.2  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00853884  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2221  transcriptional regulator, TetR family  26.44 
 
 		 206 aa  45.8  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2623  TetR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 209 aa  45.8  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0845142 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3021  TetR family transcriptional regulator  24.58 
 
 		 210 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0075  transcriptional regulator, TetR family  27.37 
 
 		 194 aa  45.8  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14850  transcriptional regulator  28.31 
 
 		 224 aa  45.8  0.0005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2482  transcriptional regulator, TetR family  28.14 
 
 		 230 aa  45.8  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1467  hypothetical protein  31 
 
 		 213 aa  45.4  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.165444  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2385  transcriptional regulator, TetR family  33.63 
 
 		 176 aa  45.4  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000106592  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 212 aa  45.4  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4515  transcriptional regulator, TetR family  22.7 
 
 		 191 aa  45.4  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5908  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 200 aa  45.4  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.889059 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3998  transcriptional regulator, TetR family  25.32 
 
 		 245 aa  45.4  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000456955  normal  0.178314 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4620  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 194 aa  45.4  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.732833  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7464  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 200 aa  45.4  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0288781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3088  TetR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 235 aa  45.4  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.215093  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0160  transcriptional regulator  26.01 
 
 		 195 aa  45.4  0.0007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>