266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3683 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_3683  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 193 aa  378  1e-104  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.14289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2727  TetR family transcriptional regulator  75.92 
 
 		 192 aa  291  3e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109313 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2430  TetR family transcriptional regulator  66.47 
 
 		 189 aa  218  3e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2475  TetR family transcriptional regulator  66.47 
 
 		 189 aa  218  3e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0706  TetR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 383 aa  123  1e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5908  TetR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 200 aa  124  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.889059 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1030  transcriptional regulator, TetR family  35.52 
 
 		 204 aa  119  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.468417  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1434  transcriptional regulator, TetR family  41.99 
 
 		 185 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3176  transcriptional regulator, TetR family  35.75 
 
 		 193 aa  111  8.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00199059 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2574  TetR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 213 aa  102  4e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1370  transcriptional regulator, TetR family  34.05 
 
 		 199 aa  101  6e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14850  transcriptional regulator  34.64 
 
 		 224 aa  99  4e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3441  TetR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 215 aa  98.6  5e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0521  regulatory protein TetR  38.17 
 
 		 188 aa  97.4  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.368507  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0061  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 224 aa  97.4  1e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3311  putative transcriptional regulator, TetR family  33.52 
 
 		 192 aa  95.9  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3063  TetR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 192 aa  95.5  4e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.857011  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3260  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 213 aa  93.2  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.122521  normal  0.297775 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1528  transcriptional regulator, TetR family  33.92 
 
 		 194 aa  92.8  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.680556  normal  0.906011 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20410  transcriptional regulator, tetR family  36.46 
 
 		 222 aa  92  4e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.539092  normal  0.887832 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3303  TetR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 191 aa  91.3  8e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.916403  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2652  TetR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 200 aa  90.1  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2697  TetR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 200 aa  90.1  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.312459  normal  0.0316845 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2682  TetR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 200 aa  90.1  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0327111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4219  transcriptional regulator, TetR family  32.04 
 
 		 202 aa  89.4  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5902  TetR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 213 aa  89.4  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5770  transcriptional regulator, TetR family  34.41 
 
 		 201 aa  86.7  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.805337 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0873  transcriptional regulator, TetR family  33.85 
 
 		 215 aa  86.3  3e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00991598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4359  transcriptional regulator, TetR family  32.61 
 
 		 205 aa  86.3  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7472  transcriptional regulator, TetR family  29.57 
 
 		 228 aa  85.5  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0409  TetR family transcriptional regulator  32.49 
 
 		 214 aa  85.1  5e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2758  TetR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 231 aa  83.6  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2555  TetR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 205 aa  83.6  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7144  transcriptional regulator, TetR family  33.15 
 
 		 188 aa  84  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.251131 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2623  TetR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 209 aa  82.8  0.000000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0845142 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3530  regulatory protein TetR  31.35 
 
 		 235 aa  82.8  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.898869  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2232  transcriptional regulator, TetR family  34.09 
 
 		 201 aa  82.4  0.000000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.731324  hitchhiker  0.00520971 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0630  transcriptional regulator  30.54 
 
 		 209 aa  81.6  0.000000000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.397184  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5089  putative transcriptional regulator, TetR family  30.56 
 
 		 210 aa  81.6  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8134  hypothetical protein  30.43 
 
 		 203 aa  80.9  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.290445  normal  0.176944 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0867  transcriptional regulator, TetR family  34.54 
 
 		 202 aa  80.9  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3111  transcriptional regulator, TetR family  33.88 
 
 		 203 aa  80.1  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2037  transcriptional regulator, TetR family  32.46 
 
 		 234 aa  79.7  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4073  putative transcriptional regulator, TetR family  35.47 
 
 		 208 aa  80.1  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.134392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28220  transcriptional regulator  36.79 
 
 		 195 aa  79.7  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11588  regulatory protein  32.16 
 
 		 202 aa  79.3  0.00000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.8751e-36  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4135  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 194 aa  79  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3021  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 210 aa  78.6  0.00000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4740  transcriptional regulator, TetR family  27.72 
 
 		 196 aa  78.2  0.00000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.609223  normal  0.406356 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7526  putative transcriptional regulator, TetR family  33.53 
 
 		 204 aa  78.2  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0075  transcriptional regulator, TetR family  30.46 
 
 		 194 aa  76.6  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11192  transcriptional regulator  29.12 
 
 		 201 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3813  transcriptional regulator, TetR family  31.35 
 
 		 222 aa  76.3  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0327168  normal  0.449726 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0278  transcriptional regulator, TetR family  33.73 
 
 		 206 aa  75.5  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.72994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3021  TetR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 194 aa  75.5  0.0000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49231  normal  0.167388 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0164  TetR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 208 aa  75.1  0.0000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0388  transcriptional regulator, TetR family  30.05 
 
 		 204 aa  75.1  0.0000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.654621 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1023  regulatory protein TetR  34.74 
 
 		 196 aa  74.7  0.0000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.932216  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5223  TetR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 197 aa  74.7  0.0000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.325156 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3528  transcriptional regulator, TetR family  36.69 
 
 		 192 aa  74.3  0.0000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.069513  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4457  TetR family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 209 aa  74.3  0.0000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.108103 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2681  regulatory protein TetR  28 
 
 		 200 aa  74.3  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.111338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0364  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 209 aa  73.9  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0326  Transcriptional regulator protein  27.27 
 
 		 217 aa  74.3  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0602  transcriptional regulator, TetR family  33.53 
 
 		 209 aa  73.2  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2402  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 204 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4851  TetR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 209 aa  73.2  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188922 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5207  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 216 aa  72.8  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5295  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 216 aa  72.8  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.334601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5587  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 216 aa  72.8  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.214408 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3006  TetR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 194 aa  72  0.000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313875  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3052  TetR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 194 aa  72  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6626  TetR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 210 aa  71.6  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1478  TetR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 217 aa  71.6  0.000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1616  transcriptional regulator, TetR family  30.94 
 
 		 224 aa  70.9  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.86283 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1684  regulatory protein TetR  33.68 
 
 		 211 aa  70.9  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.817144  normal  0.172233 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1685  transcriptional regulator  27.89 
 
 		 197 aa  70.9  0.00000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4818  transcriptional regulator, TetR family  31.79 
 
 		 208 aa  71.2  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.945526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1275  transcriptional regulator, TetR family  30.94 
 
 		 214 aa  69.7  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2221  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 206 aa  70.1  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2394  transcriptional regulator, TetR family  36.99 
 
 		 188 aa  69.7  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.469906  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5818  TetR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 216 aa  68.6  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.199964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1975  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 199 aa  68.6  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382484  normal  0.828211 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3148  TetR family transcriptional regulator  31.32 
 
 		 231 aa  68.2  0.00000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.647957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2482  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 230 aa  67.8  0.00000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5564  transcriptional regulator, TetR family  30.59 
 
 		 201 aa  67.8  0.00000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2012  transcriptional regulator, TetR family  32.68 
 
 		 206 aa  67  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.719864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1870  TetR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 200 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.524009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1687  regulatory protein, TetR  30.59 
 
 		 266 aa  67.4  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013093  Amir_3757  transcriptional regulator, TetR family  33.01 
 
 		 206 aa  67.4  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0306386  n/a   
 
 
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NC_013169  Ksed_05420  transcriptional regulator, tetR family  35.2 
 
 		 188 aa  67.4  0.0000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013159  Svir_24200  transcriptional regulator, tetR family  30.99 
 
 		 204 aa  66.2  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.130166  normal  0.0410828 
 
 
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NC_013235  Namu_3998  transcriptional regulator, TetR family  32.45 
 
 		 245 aa  66.6  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000456955  normal  0.178314 
 
 
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NC_009921  Franean1_1763  TetR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 287 aa  66.2  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000686866 
 
 
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NC_013441  Gbro_0893  regulatory protein TetR  30.43 
 
 		 194 aa  66.2  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_1697  transcriptional regulator, TetR family  30.9 
 
 		 230 aa  66.2  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013093  Amir_3714  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 178 aa  66.2  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.530873  n/a   
 
 
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NC_013440  Hoch_4754  transcriptional regulator, TetR family  28.49 
 
 		 216 aa  65.5  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00853884  normal  1 
 
 
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NC_009077  Mjls_1531  TetR family transcriptional regulator  32.96 
 
 		 200 aa  65.1  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.556905 
 
 
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NC_007760  Adeh_1474  TetR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 188 aa  65.1  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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