More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_2670 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



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Organism name
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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2670  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 214 aa  425  1e-118  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.545748  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2715  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 214 aa  425  1e-118  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.180608  normal  0.0320009 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2700  TetR family transcriptional regulator  99 
 
 		 200 aa  395  1e-109  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3153  TetR family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 215 aa  121  7e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.755786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4496  TetR family transcriptional regulator  39.16 
 
 		 202 aa  92  5e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0468943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1870  TetR family transcriptional regulator  37.87 
 
 		 200 aa  92.4  5e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.524009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1531  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 200 aa  91.3  9e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1561  TetR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 200 aa  89.7  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.478798  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1585  TetR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 200 aa  89.7  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4603  regulatory protein TetR  34.71 
 
 		 211 aa  89  5e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204139  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4384  TetR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 208 aa  85.9  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0893  regulatory protein TetR  34.57 
 
 		 194 aa  82.8  0.000000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1961  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 187 aa  81.6  0.000000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.797544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13188  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 208 aa  79.7  0.00000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.166406 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0492  TetR family transcriptional regulator  36.31 
 
 		 193 aa  78.2  0.00000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.496213  normal  0.296626 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3344  TetR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 202 aa  78.2  0.00000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.685113 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1975  transcriptional regulator, TetR family  30.95 
 
 		 199 aa  76.6  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382484  normal  0.828211 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3063  TetR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 192 aa  75.9  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.857011  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2332  regulatory protein, TetR  32.12 
 
 		 204 aa  75.9  0.0000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000899921 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2454  TetR family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 185 aa  75.5  0.0000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0884  TetR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 237 aa  75.1  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.214434 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5159  transcriptional regulator, TetR family  29.52 
 
 		 202 aa  75.1  0.0000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0075  transcriptional regulator, TetR family  32.52 
 
 		 194 aa  75.1  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1763  TetR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 287 aa  75.1  0.0000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000686866 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1370  transcriptional regulator, TetR family  39.29 
 
 		 199 aa  73.6  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3303  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 191 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.916403  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11588  regulatory protein  33.54 
 
 		 202 aa  73.2  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.8751e-36  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4433  putative transcriptional regulator, TetR family  34.75 
 
 		 199 aa  70.9  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.304497  hitchhiker  0.00999637 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3148  TetR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 231 aa  70.5  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.647957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1275  transcriptional regulator, TetR family  30.89 
 
 		 214 aa  69.7  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2402  transcriptional regulator, TetR family  32.18 
 
 		 204 aa  69.7  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3021  TetR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 210 aa  69.3  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5564  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 201 aa  68.2  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3021  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 194 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49231  normal  0.167388 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2593  putative transcriptional regulator, TetR family  31.69 
 
 		 205 aa  67.4  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0854341 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3176  transcriptional regulator, TetR family  31.55 
 
 		 193 aa  67.8  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00199059 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5908  TetR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 200 aa  66.6  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.889059 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3225  TetR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 213 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.314279  normal  0.210871 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3006  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 194 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313875  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3052  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 194 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2482  transcriptional regulator, TetR family  31.89 
 
 		 230 aa  65.9  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2652  TetR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 200 aa  65.9  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3714  transcriptional regulator, TetR family  32.52 
 
 		 178 aa  65.5  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.530873  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2697  TetR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 200 aa  65.9  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.312459  normal  0.0316845 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2682  TetR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 200 aa  65.9  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0327111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1684  regulatory protein TetR  29.38 
 
 		 211 aa  65.5  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.817144  normal  0.172233 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1030  transcriptional regulator, TetR family  33.88 
 
 		 204 aa  64.7  0.0000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.468417  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3038  transcriptional regulator  33.54 
 
 		 230 aa  64.3  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5207  TetR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 216 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5295  TetR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 216 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.334601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5587  TetR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 216 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.214408 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5089  putative transcriptional regulator, TetR family  26.4 
 
 		 210 aa  63.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0706  TetR family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 383 aa  63.5  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0061  transcriptional regulator, TetR family  27.45 
 
 		 224 aa  63.9  0.000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  26.25 
 
 		 190 aa  63.5  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2555  TetR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 205 aa  63.5  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 190 aa  62.8  0.000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2221  transcriptional regulator, TetR family  28.82 
 
 		 206 aa  62.8  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2394  transcriptional regulator, TetR family  31.48 
 
 		 188 aa  62.8  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.469906  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4339  TetR family transcriptional regulator  33.13 
 
 		 207 aa  62.4  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00746452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2037  transcriptional regulator, TetR family  32.53 
 
 		 234 aa  62  0.000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1474  TetR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 188 aa  62  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4073  putative transcriptional regulator, TetR family  27.95 
 
 		 208 aa  61.6  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.134392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2959  transcriptional regulator, TetR family  29.94 
 
 		 200 aa  62  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3270  transcriptional regulator, TetR family  25.15 
 
 		 199 aa  61.6  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3818  transcriptional regulator, TetR family  25.42 
 
 		 212 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.104466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4993  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 202 aa  61.2  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.309228 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20410  transcriptional regulator, tetR family  27.71 
 
 		 222 aa  61.2  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.539092  normal  0.887832 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5008  TetR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 201 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3111  transcriptional regulator, TetR family  30.38 
 
 		 203 aa  61.2  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3311  putative transcriptional regulator, TetR family  38.2 
 
 		 192 aa  60.1  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4818  transcriptional regulator, TetR family  30.66 
 
 		 208 aa  59.7  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.945526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1687  regulatory protein, TetR  25.95 
 
 		 266 aa  59.3  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4359  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4272  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 191 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4620  transcriptional regulator, TetR family  34.17 
 
 		 194 aa  58.5  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.732833  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0845  transcriptional regulator, TetR family  27.93 
 
 		 200 aa  58.2  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3001  transcriptional regulator, TetR family  42.5 
 
 		 207 aa  58.5  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.145736  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1237  transcriptional regulator, TetR family  29.09 
 
 		 219 aa  58.2  0.00000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.689055  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0028  TetR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 191 aa  58.2  0.00000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.35435 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2623  TetR family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0845142 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3063  regulatory protein TetR  27.81 
 
 		 191 aa  57.8  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0091  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 187 aa  57.4  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0611138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5615  TetR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 200 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000827938  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5233  TetR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 184 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.494471  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5979  TetR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 200 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000443748  hitchhiker  0.000881636 
 
 
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NC_009077  Mjls_5613  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 184 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.687182  normal  0.405211 
 
 
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NC_013947  Snas_2827  transcriptional regulator, TetR family  34.85 
 
 		 186 aa  57.8  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.05215  normal  0.803833 
 
 
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NC_014210  Ndas_4469  transcriptional regulator, TetR family  32.59 
 
 		 202 aa  57.8  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008705  Mkms_5321  TetR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 184 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.868815 
 
 
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NC_008726  Mvan_1821  TetR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 199 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.305938 
 
 
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NC_013530  Xcel_2792  transcriptional regulator, TetR family  32.2 
 
 		 248 aa  57.8  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.41359  n/a   
 
 
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NC_013757  Gobs_4219  transcriptional regulator, TetR family  32.93 
 
 		 202 aa  57  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008463  PA14_16790  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297454  normal  1 
 
 
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NC_009656  PSPA7_1461  putative transcriptional regulator  37.04 
 
 		 212 aa  57  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013160  Cyan8802_4515  transcriptional regulator, TetR family  26.32 
 
 		 191 aa  56.6  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_7526  putative transcriptional regulator, TetR family  26.71 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277737  normal  1 
 
 
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NC_007777  Francci3_2758  TetR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 231 aa  56.2  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_014210  Ndas_1929  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.609447 
 
 
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NC_008146  Mmcs_0038  TetR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 191 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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