278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0602 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



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Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_0602  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 
209 aa  403  1.0000000000000001e-112  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2012  transcriptional regulator, TetR family  72.41 
 
 
206 aa  229  2e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.719864  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3008  putative transcriptional regulator, TetR family  58.59 
 
 
203 aa  202  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4304  TetR family transcriptional regulator  62.83 
 
 
214 aa  194  7e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.127399  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4074  TetR family transcriptional regulator  62.3 
 
 
214 aa  192  3e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4150  TetR family transcriptional regulator  62.3 
 
 
214 aa  192  3e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7526  putative transcriptional regulator, TetR family  46.82 
 
 
204 aa  149  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277737  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0278  transcriptional regulator, TetR family  43.53 
 
 
206 aa  124  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.72994  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5818  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 
216 aa  115  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.199964  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4073  putative transcriptional regulator, TetR family  42 
 
 
208 aa  112  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.134392  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4685  transcriptional regulator, TetR family  42.36 
 
 
205 aa  112  5e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.421028  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2221  transcriptional regulator, TetR family  41.04 
 
 
206 aa  108  8.000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3036  TetR family transcriptional regulator  40.8 
 
 
196 aa  106  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2555  TetR family transcriptional regulator  35.23 
 
 
205 aa  105  4e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6626  TetR family transcriptional regulator  37.85 
 
 
210 aa  100  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4359  transcriptional regulator, TetR family  37.08 
 
 
205 aa  97.8  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3021  TetR family transcriptional regulator  37.3 
 
 
194 aa  95.9  3e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49231  normal  0.167388 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3006  TetR family transcriptional regulator  37.3 
 
 
194 aa  95.1  7e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313875  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3052  TetR family transcriptional regulator  37.3 
 
 
194 aa  95.1  7e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5223  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 
197 aa  90.9  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.325156 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7144  transcriptional regulator, TetR family  38.92 
 
 
188 aa  89.7  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.251131 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3311  putative transcriptional regulator, TetR family  36.78 
 
 
192 aa  89.4  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1006  transcriptional regulator, TetR family  34.12 
 
 
190 aa  86.7  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.217455  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3506  TetR family transcriptional regulator  35.06 
 
 
195 aa  86.3  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  0.0873465 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5908  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
200 aa  85.9  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.889059 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3063  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
192 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.857011  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2623  TetR family transcriptional regulator  33.7 
 
 
209 aa  82  0.000000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0845142 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3287  TetR family transcriptional regulator  34.97 
 
 
195 aa  82  0.000000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.443656  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3303  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
191 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.916403  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0075  transcriptional regulator, TetR family  31.33 
 
 
194 aa  78.6  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2792  transcriptional regulator, TetR family  36.42 
 
 
248 aa  78.6  0.00000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.41359  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3176  transcriptional regulator, TetR family  36.14 
 
 
193 aa  78.6  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00199059 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0884  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 
237 aa  78.6  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.214434 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1975  transcriptional regulator, TetR family  32.81 
 
 
199 aa  78.6  0.00000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382484  normal  0.828211 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1030  transcriptional regulator, TetR family  32.94 
 
 
204 aa  77.8  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.468417  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5207  TetR family transcriptional regulator  34.86 
 
 
216 aa  77.4  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5295  TetR family transcriptional regulator  34.86 
 
 
216 aa  77.4  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.334601  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5587  TetR family transcriptional regulator  34.86 
 
 
216 aa  77.4  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.214408 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5615  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
200 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000827938  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5979  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
200 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000443748  hitchhiker  0.000881636 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5089  putative transcriptional regulator, TetR family  32.2 
 
 
210 aa  75.5  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1478  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
217 aa  74.7  0.0000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1687  regulatory protein, TetR  32.1 
 
 
266 aa  74.7  0.0000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7464  TetR family transcriptional regulator  31.36 
 
 
200 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0288781  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1387  transcriptional regulator, TetR family  33.86 
 
 
213 aa  74.3  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4135  TetR family transcriptional regulator  31.79 
 
 
194 aa  74.7  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2482  transcriptional regulator, TetR family  36.47 
 
 
230 aa  74.3  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2727  TetR family transcriptional regulator  32.4 
 
 
192 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.109313 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4006  transcriptional regulator, TetR family  37.76 
 
 
193 aa  72.8  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.685052  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3683  TetR family transcriptional regulator  34.55 
 
 
193 aa  72.4  0.000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.14289  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3026  transcriptional regulator, putative  32.93 
 
 
181 aa  72  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.127274  normal  0.152535 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5159  transcriptional regulator, TetR family  35.09 
 
 
202 aa  71.6  0.000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4502  putative transcriptional regulator, TetR family  34.15 
 
 
249 aa  71.6  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.789852 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2652  TetR family transcriptional regulator  32.3 
 
 
200 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2697  TetR family transcriptional regulator  32.3 
 
 
200 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.312459  normal  0.0316845 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4469  transcriptional regulator, TetR family  35.54 
 
 
202 aa  71.2  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2682  TetR family transcriptional regulator  32.3 
 
 
200 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0327111  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1528  transcriptional regulator, TetR family  33.7 
 
 
194 aa  70.5  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.680556  normal  0.906011 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0091  TetR family transcriptional regulator  29.28 
 
 
187 aa  69.7  0.00000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0611138  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1533  regulatory protein TetR  32.09 
 
 
203 aa  69.3  0.00000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.987298  normal  0.249923 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2959  transcriptional regulator, TetR family  33.52 
 
 
200 aa  68.9  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3270  transcriptional regulator, TetR family  27.03 
 
 
199 aa  67.4  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3173  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 
213 aa  67  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0251  transcriptional regulator, TetR family  31.35 
 
 
185 aa  66.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.514546  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2963  TetR family transcriptional regulator  30.34 
 
 
189 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.412295 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1535  TetR family transcriptional regulator  35.86 
 
 
192 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0706  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 
383 aa  66.2  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14850  transcriptional regulator  30.68 
 
 
224 aa  66.6  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4993  transcriptional regulator, TetR family  32.32 
 
 
202 aa  66.2  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.309228 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0691  regulatory protein TetR  36.2 
 
 
202 aa  66.6  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4348  transcriptional regulator, TetR family  30.49 
 
 
198 aa  66.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2332  regulatory protein, TetR  33.51 
 
 
204 aa  66.2  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000899921 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2948  TetR family transcriptional regulator  30.64 
 
 
191 aa  66.2  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2992  TetR family transcriptional regulator  30.64 
 
 
191 aa  66.2  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.385096  normal  0.373192 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4219  transcriptional regulator, TetR family  30.49 
 
 
202 aa  65.9  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4457  TetR family transcriptional regulator  31.21 
 
 
209 aa  65.9  0.0000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.108103 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0061  transcriptional regulator, TetR family  33.1 
 
 
224 aa  65.1  0.0000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1474  TetR family transcriptional regulator  36.88 
 
 
188 aa  64.7  0.0000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3160  transcriptional regulator, putative  30.54 
 
 
181 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0108534  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2283  TetR family transcriptional regulator  32.54 
 
 
173 aa  64.7  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000000171234  hitchhiker  0.000491617 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5564  transcriptional regulator, TetR family  28.73 
 
 
201 aa  64.7  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0028  TetR family transcriptional regulator  35.4 
 
 
191 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.35435 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4620  transcriptional regulator, TetR family  38.56 
 
 
194 aa  64.3  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.732833  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0038  TetR family transcriptional regulator  35.4 
 
 
191 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2394  transcriptional regulator, TetR family  35.06 
 
 
188 aa  63.5  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.469906  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3363  transcriptional regulator, TetR family  34.21 
 
 
199 aa  63.5  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4158  TetR family transcriptional regulator  31.21 
 
 
205 aa  63.9  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.000188504  n/a   
 
 
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NC_008705  Mkms_0047  TetR family transcriptional regulator  35.4 
 
 
191 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0431132 
 
 
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NC_013595  Sros_4433  putative transcriptional regulator, TetR family  34.05 
 
 
199 aa  63.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.304497  hitchhiker  0.00999637 
 
 
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NC_010002  Daci_1889  TetR family transcriptional regulator  32.37 
 
 
195 aa  63.5  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_010510  Mrad2831_5887  TetR family transcriptional regulator  31.79 
 
 
187 aa  62.8  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.350094 
 
 
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NC_011891  A2cp1_3063  regulatory protein TetR  33.77 
 
 
191 aa  63.2  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009077  Mjls_1531  TetR family transcriptional regulator  31.33 
 
 
200 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.556905 
 
 
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NC_008726  Mvan_1870  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 
200 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.524009  normal 
 
 
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NC_007777  Francci3_2758  TetR family transcriptional regulator  29.47 
 
 
231 aa  61.6  0.000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_009664  Krad_4434  transcriptional regulator  50 
 
 
203 aa  61.6  0.000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.147694  normal 
 
 
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NC_013510  Tcur_3771  transcriptional regulator, TetR family  28.81 
 
 
223 aa  61.6  0.000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_013172  Bfae_28220  transcriptional regulator  32.03 
 
 
195 aa  61.2  0.000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_008705  Mkms_1585  TetR family transcriptional regulator  30.72 
 
 
200 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_013521  Sked_20410  transcriptional regulator, tetR family  28.07 
 
 
222 aa  61.2  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.539092  normal  0.887832 
 
 
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