More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2037 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2037  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 234 aa  452  1.0000000000000001e-126  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1616  transcriptional regulator, TetR family  43.75 
 
 		 224 aa  145  7.0000000000000006e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.86283 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4754  transcriptional regulator, TetR family  42.55 
 
 		 216 aa  137  2e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00853884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7472  transcriptional regulator, TetR family  39.46 
 
 		 228 aa  132  5e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14850  transcriptional regulator  40.28 
 
 		 224 aa  131  7.999999999999999e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5908  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 200 aa  120  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.889059 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2758  TetR family transcriptional regulator  40.29 
 
 		 231 aa  118  9.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0706  TetR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 383 aa  115  7.999999999999999e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1030  transcriptional regulator, TetR family  39.06 
 
 		 204 aa  110  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.468417  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3441  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 215 aa  106  4e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3311  putative transcriptional regulator, TetR family  37.89 
 
 		 192 aa  105  8e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3176  transcriptional regulator, TetR family  35.03 
 
 		 193 aa  102  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00199059 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3111  transcriptional regulator, TetR family  39.89 
 
 		 203 aa  100  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11588  regulatory protein  34.01 
 
 		 202 aa  100  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.8751e-36  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2332  regulatory protein, TetR  35.16 
 
 		 204 aa  99.8  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000899921 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1370  transcriptional regulator, TetR family  38.42 
 
 		 199 aa  97.1  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1975  transcriptional regulator, TetR family  35.43 
 
 		 199 aa  94.7  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382484  normal  0.828211 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4219  transcriptional regulator, TetR family  33.87 
 
 		 202 aa  93.6  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1434  transcriptional regulator, TetR family  38.5 
 
 		 185 aa  93.6  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3021  TetR family transcriptional regulator  34.05 
 
 		 210 aa  94  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1684  regulatory protein TetR  36.42 
 
 		 211 aa  92.4  6e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.817144  normal  0.172233 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0893  regulatory protein TetR  34.95 
 
 		 194 aa  90.9  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3528  transcriptional regulator, TetR family  36.9 
 
 		 192 aa  89  6e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.069513  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1929  transcriptional regulator, TetR family  40.68 
 
 		 214 aa  89  6e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.609447 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0326  Transcriptional regulator protein  29.95 
 
 		 217 aa  88.2  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2574  TetR family transcriptional regulator  37.64 
 
 		 213 aa  87.4  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4515  transcriptional regulator, TetR family  30.73 
 
 		 191 aa  87.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2727  TetR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 192 aa  85.9  5e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109313 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3270  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 199 aa  85.1  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24200  transcriptional regulator, tetR family  33.33 
 
 		 204 aa  84.7  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.130166  normal  0.0410828 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3813  transcriptional regulator, TetR family  33.98 
 
 		 222 aa  84  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0327168  normal  0.449726 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1275  transcriptional regulator, TetR family  31.43 
 
 		 214 aa  84.3  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2652  TetR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 200 aa  82.4  0.000000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0884  TetR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 237 aa  82.4  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.214434 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2697  TetR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 200 aa  82.4  0.000000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.312459  normal  0.0316845 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2682  TetR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 200 aa  82.4  0.000000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0327111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3757  transcriptional regulator, TetR family  33.17 
 
 		 206 aa  82.4  0.000000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0306386  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2677  transcriptional regulator, TetR family  33.71 
 
 		 206 aa  82  0.000000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0882789  normal  0.108498 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4818  transcriptional regulator, TetR family  30.11 
 
 		 208 aa  81.6  0.000000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.945526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4993  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 202 aa  81.3  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.309228 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0873  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 215 aa  81.3  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00991598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3148  TetR family transcriptional regulator  36.91 
 
 		 231 aa  80.5  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.647957  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3260  TetR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 213 aa  80.5  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.122521  normal  0.297775 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3683  TetR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 193 aa  79.7  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.14289  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1252  TetR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 202 aa  79.3  0.00000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0581191  normal  0.11609 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2394  transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 		 188 aa  79.3  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.469906  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3006  TetR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 194 aa  78.6  0.00000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313875  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3052  TetR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 194 aa  78.6  0.00000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3998  transcriptional regulator, TetR family  34.63 
 
 		 245 aa  78.2  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000456955  normal  0.178314 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0075  transcriptional regulator, TetR family  31.61 
 
 		 194 aa  77  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1531  TetR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 200 aa  76.3  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11192  transcriptional regulator  31.22 
 
 		 201 aa  76.3  0.0000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2593  putative transcriptional regulator, TetR family  31.45 
 
 		 205 aa  75.9  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0854341 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4348  transcriptional regulator, TetR family  31.18 
 
 		 198 aa  75.5  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1474  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 188 aa  75.5  0.0000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1561  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 200 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.478798  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1685  transcriptional regulator  36.67 
 
 		 197 aa  74.7  0.000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1585  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 200 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4433  putative transcriptional regulator, TetR family  33.58 
 
 		 199 aa  74.7  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.304497  hitchhiker  0.00999637 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3021  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 194 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49231  normal  0.167388 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28220  transcriptional regulator  36.36 
 
 		 195 aa  74.3  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1763  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 287 aa  73.6  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000686866 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6035  transcriptional regulator, TetR family  33.52 
 
 		 203 aa  73.9  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4339  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 207 aa  73.6  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00746452  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2281  transcriptional regulator, TetR family  32.12 
 
 		 215 aa  73.2  0.000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2623  TetR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 209 aa  73.6  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0845142 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2482  transcriptional regulator, TetR family  33.68 
 
 		 230 aa  73.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5902  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 213 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3771  transcriptional regulator, TetR family  32.34 
 
 		 223 aa  73.2  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8534  transcriptional regulator, TetR family  30.94 
 
 		 206 aa  72.8  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.027806  hitchhiker  0.00115544 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0333  regulatory protein TetR  36.36 
 
 		 197 aa  72.8  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.104773  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5089  putative transcriptional regulator, TetR family  28.8 
 
 		 210 aa  72.8  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2827  transcriptional regulator, TetR family  35.58 
 
 		 186 aa  72.4  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.05215  normal  0.803833 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1237  transcriptional regulator, TetR family  35.58 
 
 		 219 aa  72  0.000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.689055  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4851  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 194 aa  72  0.000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4603  regulatory protein TetR  34.5 
 
 		 211 aa  71.6  0.000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204139  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3303  TetR family transcriptional regulator  26.78 
 
 		 191 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.916403  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3333  transcriptional regulator, TetR family  32.62 
 
 		 211 aa  71.6  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.618946 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3063  TetR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 192 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.857011  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5008  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 201 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1697  transcriptional regulator, TetR family  30.98 
 
 		 230 aa  70.5  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1870  TetR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 200 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.524009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1387  transcriptional regulator, TetR family  33.55 
 
 		 213 aa  70.5  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20410  transcriptional regulator, tetR family  30.85 
 
 		 222 aa  70.1  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.539092  normal  0.887832 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3953  TetR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 232 aa  70.1  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396138  normal  0.024229 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4496  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 202 aa  69.3  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0468943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3225  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 213 aa  69.7  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.314279  normal  0.210871 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2402  transcriptional regulator, TetR family  30.72 
 
 		 204 aa  68.9  0.00000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2029  TetR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 220 aa  68.9  0.00000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0867  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 202 aa  68.2  0.00000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0778  TetR family transcriptional regulator  31.66 
 
 		 199 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.308556  normal  0.547023 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1467  hypothetical protein  29.5 
 
 		 213 aa  67  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.165444  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4359  transcriptional regulator, TetR family  29.26 
 
 		 205 aa  67  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0845  transcriptional regulator, TetR family  30.05 
 
 		 200 aa  67.4  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1163  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 189 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.370888  normal  0.723677 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3530  regulatory protein TetR  30.34 
 
 		 235 aa  66.2  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.898869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4740  transcriptional regulator, TetR family  28.95 
 
 		 196 aa  66.2  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.609223  normal  0.406356 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0014  TetR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 234 aa  65.9  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.730336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2959  transcriptional regulator, TetR family  33.15 
 
 		 200 aa  65.9  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5564  transcriptional regulator, TetR family  32.41 
 
 		 201 aa  65.9  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>