128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0333 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0333  regulatory protein TetR  100 
 
 		 197 aa  380  1e-105  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.104773  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2037  transcriptional regulator, TetR family  36.76 
 
 		 234 aa  96.7  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7472  transcriptional regulator, TetR family  34.05 
 
 		 228 aa  88.6  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1616  transcriptional regulator, TetR family  35.03 
 
 		 224 aa  81.6  0.000000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.86283 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4754  transcriptional regulator, TetR family  35.23 
 
 		 216 aa  80.9  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00853884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5908  TetR family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 200 aa  76.6  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.889059 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0706  TetR family transcriptional regulator  31.32 
 
 		 383 aa  76.3  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3311  putative transcriptional regulator, TetR family  32.18 
 
 		 192 aa  75.5  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4219  transcriptional regulator, TetR family  30.05 
 
 		 202 aa  70.9  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3006  TetR family transcriptional regulator  32.96 
 
 		 194 aa  69.3  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313875  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3052  TetR family transcriptional regulator  32.96 
 
 		 194 aa  69.3  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3260  TetR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 213 aa  69.3  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.122521  normal  0.297775 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1030  transcriptional regulator, TetR family  32.45 
 
 		 204 aa  68.9  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.468417  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24200  transcriptional regulator, tetR family  28.87 
 
 		 204 aa  68.6  0.00000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.130166  normal  0.0410828 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3441  TetR family transcriptional regulator  29.48 
 
 		 215 aa  67.4  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3021  TetR family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 194 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49231  normal  0.167388 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11588  regulatory protein  29.65 
 
 		 202 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.8751e-36  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3021  TetR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 210 aa  65.9  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3683  TetR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 193 aa  65.5  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.14289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14850  transcriptional regulator  29.78 
 
 		 224 aa  65.1  0.0000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2623  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 209 aa  63.9  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0845142 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0364  TetR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 209 aa  63.2  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0867  transcriptional regulator, TetR family  32.07 
 
 		 202 aa  63.5  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2574  TetR family transcriptional regulator  46.84 
 
 		 213 aa  63.5  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2758  TetR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 231 aa  62.8  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2727  TetR family transcriptional regulator  26.84 
 
 		 192 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109313 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3176  transcriptional regulator, TetR family  27.81 
 
 		 193 aa  62.8  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00199059 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4851  TetR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 209 aa  62.4  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188922 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3111  transcriptional regulator, TetR family  33.57 
 
 		 203 aa  61.6  0.000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0014  TetR family transcriptional regulator  45.35 
 
 		 234 aa  60.8  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.730336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1478  TetR family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 217 aa  60.8  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3813  transcriptional regulator, TetR family  32.2 
 
 		 222 aa  60.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0327168  normal  0.449726 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3148  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 231 aa  59.7  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.647957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3528  transcriptional regulator, TetR family  30.27 
 
 		 192 aa  59.7  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.069513  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0630  transcriptional regulator  26.77 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.397184  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3063  TetR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 192 aa  57.8  0.00000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.857011  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2281  transcriptional regulator, TetR family  32.54 
 
 		 215 aa  57.8  0.00000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1685  transcriptional regulator  26.29 
 
 		 197 aa  57.8  0.0000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1370  transcriptional regulator, TetR family  31.76 
 
 		 199 aa  57.8  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3757  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0306386  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05420  transcriptional regulator, tetR family  34.15 
 
 		 188 aa  57.8  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1763  TetR family transcriptional regulator  26.78 
 
 		 287 aa  57  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000686866 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4818  transcriptional regulator, TetR family  28.98 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.945526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0061  transcriptional regulator, TetR family  29.52 
 
 		 224 aa  55.1  0.0000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3270  transcriptional regulator, TetR family  25.17 
 
 		 199 aa  54.7  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3303  TetR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 191 aa  54.7  0.0000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.916403  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2482  transcriptional regulator, TetR family  43.37 
 
 		 230 aa  53.9  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1528  transcriptional regulator, TetR family  32.03 
 
 		 194 aa  54.3  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.680556  normal  0.906011 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4993  transcriptional regulator, TetR family  37.23 
 
 		 202 aa  53.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.309228 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2332  regulatory protein, TetR  28.9 
 
 		 204 aa  53.5  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000899921 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1975  transcriptional regulator, TetR family  27.07 
 
 		 199 aa  53.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382484  normal  0.828211 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4515  transcriptional regulator, TetR family  25.87 
 
 		 191 aa  52.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1387  transcriptional regulator, TetR family  33.13 
 
 		 213 aa  52.4  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5564  transcriptional regulator, TetR family  28.76 
 
 		 201 aa  52  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1684  regulatory protein TetR  26.18 
 
 		 211 aa  52  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.817144  normal  0.172233 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2394  transcriptional regulator, TetR family  43.06 
 
 		 188 aa  52  0.000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.469906  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0873  transcriptional regulator, TetR family  24.74 
 
 		 215 aa  51.6  0.000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00991598  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3333  transcriptional regulator, TetR family  41.77 
 
 		 211 aa  51.6  0.000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.618946 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2652  TetR family transcriptional regulator  25.65 
 
 		 200 aa  51.2  0.000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2697  TetR family transcriptional regulator  25.65 
 
 		 200 aa  51.2  0.000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.312459  normal  0.0316845 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2682  TetR family transcriptional regulator  25.65 
 
 		 200 aa  51.2  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0327111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8534  transcriptional regulator, TetR family  27.47 
 
 		 206 aa  51.2  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.027806  hitchhiker  0.00115544 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2677  transcriptional regulator, TetR family  28.16 
 
 		 206 aa  50.8  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0882789  normal  0.108498 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0409  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 214 aa  50.8  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4348  transcriptional regulator, TetR family  30.63 
 
 		 198 aa  51.2  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28220  transcriptional regulator  28.34 
 
 		 195 aa  50.8  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4740  transcriptional regulator, TetR family  27.17 
 
 		 196 aa  50.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.609223  normal  0.406356 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2430  TetR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 189 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2475  TetR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 189 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3530  regulatory protein TetR  26.88 
 
 		 235 aa  49.7  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.898869  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2232  transcriptional regulator, TetR family  28.66 
 
 		 201 aa  50.1  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.731324  hitchhiker  0.00520971 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1474  TetR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 188 aa  49.3  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3771  transcriptional regulator, TetR family  28.19 
 
 		 223 aa  48.9  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1275  transcriptional regulator, TetR family  28.26 
 
 		 214 aa  48.5  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3225  TetR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 213 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.314279  normal  0.210871 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2402  transcriptional regulator, TetR family  30.39 
 
 		 204 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4384  TetR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 208 aa  47  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11192  transcriptional regulator  25 
 
 		 201 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3324  transcriptional regulator, TetR family  36.59 
 
 		 225 aa  46.6  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.748824 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0388  transcriptional regulator, TetR family  34.18 
 
 		 204 aa  47  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.654621 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0326  Transcriptional regulator protein  27.46 
 
 		 217 aa  47  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0521  regulatory protein TetR  30.41 
 
 		 188 aa  46.6  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.368507  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1237  transcriptional regulator, TetR family  29.03 
 
 		 219 aa  47  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.689055  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1553  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 212 aa  46.2  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.260138 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5089  putative transcriptional regulator, TetR family  24.19 
 
 		 210 aa  45.8  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2555  TetR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 205 aa  45.8  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1687  regulatory protein, TetR  29.55 
 
 		 266 aa  45.4  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4006  transcriptional regulator, TetR family  38.67 
 
 		 193 aa  45.4  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.685052  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3998  transcriptional regulator, TetR family  52.63 
 
 		 245 aa  45.4  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000456955  normal  0.178314 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1023  regulatory protein TetR  35.64 
 
 		 196 aa  45.4  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.932216  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4417  transcriptional regulator, TetR family  29.33 
 
 		 207 aa  45.1  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1556  putative transcriptional regulator, TetR family  40.54 
 
 		 182 aa  45.1  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2593  putative transcriptional regulator, TetR family  28.42 
 
 		 205 aa  45.1  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0854341 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1008  TetR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 214 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.535946  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1025  TetR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 214 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.589531  normal  0.553747 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1961  TetR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 187 aa  44.3  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.797544  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1929  transcriptional regulator, TetR family  30.99 
 
 		 214 aa  44.3  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.609447 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1434  transcriptional regulator, TetR family  36.54 
 
 		 185 aa  44.3  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0893  regulatory protein TetR  32.93 
 
 		 194 aa  44.7  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5233  TetR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 184 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.494471  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>