More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1763 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



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Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1763  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 287 aa  565  1e-160  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000686866 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3148  TetR family transcriptional regulator  67.91 
 
 		 231 aa  262  6e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.647957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3111  transcriptional regulator, TetR family  45.73 
 
 		 203 aa  145  7.0000000000000006e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4993  transcriptional regulator, TetR family  45.03 
 
 		 202 aa  137  3.0000000000000003e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.309228 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2593  putative transcriptional regulator, TetR family  40.62 
 
 		 205 aa  126  5e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0854341 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1697  transcriptional regulator, TetR family  39.67 
 
 		 230 aa  116  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1252  TetR family transcriptional regulator  40.31 
 
 		 202 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0581191  normal  0.11609 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3998  transcriptional regulator, TetR family  43.31 
 
 		 245 aa  113  3e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000456955  normal  0.178314 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3021  TetR family transcriptional regulator  41.32 
 
 		 194 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49231  normal  0.167388 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3006  TetR family transcriptional regulator  40.72 
 
 		 194 aa  109  5e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313875  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3052  TetR family transcriptional regulator  40.72 
 
 		 194 aa  109  5e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0706  TetR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 383 aa  103  3e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3303  TetR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 191 aa  102  6e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.916403  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4348  transcriptional regulator, TetR family  35.8 
 
 		 198 aa  102  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3063  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 192 aa  102  9e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.857011  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3270  transcriptional regulator, TetR family  33.95 
 
 		 199 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5908  TetR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 200 aa  99.4  6e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.889059 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1975  transcriptional regulator, TetR family  33.67 
 
 		 199 aa  99  8e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382484  normal  0.828211 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1929  transcriptional regulator, TetR family  39.88 
 
 		 214 aa  98.2  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.609447 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4515  transcriptional regulator, TetR family  33.73 
 
 		 191 aa  97.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1684  regulatory protein TetR  34.41 
 
 		 211 aa  97.4  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.817144  normal  0.172233 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5159  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 202 aa  94  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0778  TetR family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 199 aa  94  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.308556  normal  0.547023 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4219  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 202 aa  92.4  7e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3714  transcriptional regulator, TetR family  41.82 
 
 		 178 aa  92.4  8e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.530873  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1275  transcriptional regulator, TetR family  35.35 
 
 		 214 aa  91.7  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1687  regulatory protein, TetR  35.96 
 
 		 266 aa  90.1  4e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5008  TetR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 201 aa  89  8e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0061  transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 		 224 aa  89  8e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7472  transcriptional regulator, TetR family  35.54 
 
 		 228 aa  87.8  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2652  TetR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 200 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2697  TetR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 200 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.312459  normal  0.0316845 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2682  TetR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 200 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0327111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2037  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 234 aa  86.7  5e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0014  TetR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 234 aa  85.9  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.730336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0893  regulatory protein TetR  41.46 
 
 		 194 aa  85.9  7e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1030  transcriptional regulator, TetR family  35.35 
 
 		 204 aa  85.5  8e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.468417  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2332  regulatory protein, TetR  32.83 
 
 		 204 aa  84.7  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000899921 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5564  transcriptional regulator, TetR family  30.32 
 
 		 201 aa  85.1  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1370  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 199 aa  84.3  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20410  transcriptional regulator, tetR family  31.67 
 
 		 222 aa  84.3  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.539092  normal  0.887832 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2555  TetR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 205 aa  83.6  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3818  transcriptional regulator, TetR family  34.73 
 
 		 212 aa  83.2  0.000000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.104466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5089  putative transcriptional regulator, TetR family  32.99 
 
 		 210 aa  82.8  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1237  transcriptional regulator, TetR family  34.55 
 
 		 219 aa  82.8  0.000000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.689055  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3771  transcriptional regulator, TetR family  33.75 
 
 		 223 aa  82.4  0.000000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0884  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 237 aa  81.6  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.214434 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6035  transcriptional regulator, TetR family  34.36 
 
 		 203 aa  81.6  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2792  transcriptional regulator, TetR family  32.18 
 
 		 248 aa  82  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.41359  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1467  hypothetical protein  31.63 
 
 		 213 aa  81.3  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.165444  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4359  transcriptional regulator, TetR family  31.38 
 
 		 205 aa  81.3  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0075  transcriptional regulator, TetR family  34.16 
 
 		 194 aa  80.9  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5207  TetR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 216 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5587  TetR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 216 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.214408 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1616  transcriptional regulator, TetR family  35.37 
 
 		 224 aa  80.5  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.86283 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5295  TetR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 216 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.334601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0867  transcriptional regulator, TetR family  37.08 
 
 		 202 aa  80.5  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2727  TetR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 192 aa  79.3  0.00000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109313 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2948  TetR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 191 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3176  transcriptional regulator, TetR family  32.78 
 
 		 193 aa  78.2  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00199059 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4620  transcriptional regulator, TetR family  38 
 
 		 194 aa  78.2  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.732833  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2992  TetR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 191 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.385096  normal  0.373192 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3287  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 195 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.443656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3506  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 195 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  0.0873465 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3683  TetR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 193 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.14289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1528  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 194 aa  77  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.680556  normal  0.906011 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3225  TetR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 213 aa  76.6  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.314279  normal  0.210871 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4818  transcriptional regulator, TetR family  28.89 
 
 		 208 aa  76.3  0.0000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.945526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1387  transcriptional regulator, TetR family  31.84 
 
 		 213 aa  76.6  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2963  TetR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 189 aa  76.3  0.0000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.412295 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2623  TetR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 209 aa  75.9  0.0000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0845142 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2221  transcriptional regulator, TetR family  33.72 
 
 		 206 aa  75.9  0.0000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3441  TetR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 215 aa  76.3  0.0000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2574  TetR family transcriptional regulator  39.31 
 
 		 213 aa  75.9  0.0000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4006  transcriptional regulator, TetR family  37.06 
 
 		 193 aa  74.7  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.685052  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0364  TetR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 209 aa  74.7  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2454  TetR family transcriptional regulator  31.32 
 
 		 185 aa  74.7  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5770  transcriptional regulator, TetR family  32.72 
 
 		 201 aa  74.3  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.805337 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2402  transcriptional regulator, TetR family  30.54 
 
 		 204 aa  73.6  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0845  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 200 aa  73.9  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7526  putative transcriptional regulator, TetR family  34.48 
 
 		 204 aa  73.6  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4754  transcriptional regulator, TetR family  44.66 
 
 		 216 aa  73.6  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00853884  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2281  transcriptional regulator, TetR family  31.96 
 
 		 215 aa  72.4  0.000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2430  TetR family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 189 aa  72.4  0.000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2475  TetR family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 189 aa  72.4  0.000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3324  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 225 aa  72.8  0.000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.748824 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1533  regulatory protein TetR  32.81 
 
 		 203 aa  72.4  0.000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.987298  normal  0.249923 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0091  TetR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 187 aa  72  0.000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0611138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2670  TetR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 214 aa  72  0.000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.545748  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3333  transcriptional regulator, TetR family  32.94 
 
 		 211 aa  72  0.000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.618946 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1478  TetR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 217 aa  72  0.000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008705  Mkms_2715  TetR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 214 aa  72  0.000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.180608  normal  0.0320009 
 
 
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NC_013131  Caci_0872  transcriptional regulator, TetR family  32.3 
 
 		 212 aa  72  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.83423  normal  0.281851 
 
 
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NC_013521  Sked_14850  transcriptional regulator  30.98 
 
 		 224 aa  70.9  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.126744 
 
 
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NC_009338  Mflv_3021  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 210 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  1 
 
 
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NC_009077  Mjls_2700  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 200 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_014165  Tbis_3260  TetR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 213 aa  71.6  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.122521  normal  0.297775 
 
 
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NC_013757  Gobs_1434  transcriptional regulator, TetR family  48.78 
 
 		 185 aa  71.2  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009565  TBFG_11192  transcriptional regulator  35.57 
 
 		 201 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013595  Sros_4073  putative transcriptional regulator, TetR family  31.49 
 
 		 208 aa  70.1  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.134392  normal  1 
 
 
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