235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2827 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_2827  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 186 aa  367  1e-101  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.05215  normal  0.803833 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1275  transcriptional regulator, TetR family  32.09 
 
 		 214 aa  76.6  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11588  regulatory protein  31.67 
 
 		 202 aa  72  0.000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.8751e-36  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2037  transcriptional regulator, TetR family  35.58 
 
 		 234 aa  72.4  0.000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2332  regulatory protein, TetR  28.88 
 
 		 204 aa  69.3  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000899921 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4219  transcriptional regulator, TetR family  31.31 
 
 		 202 aa  67.4  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7472  transcriptional regulator, TetR family  31.89 
 
 		 228 aa  66.6  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0893  regulatory protein TetR  42.35 
 
 		 194 aa  65.9  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3063  TetR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 192 aa  65.5  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.857011  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3303  TetR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 191 aa  65.9  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.916403  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3441  TetR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 215 aa  65.5  0.0000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0706  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 383 aa  65.1  0.0000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0061  transcriptional regulator, TetR family  29.87 
 
 		 224 aa  65.1  0.0000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3021  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 210 aa  65.1  0.0000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3333  transcriptional regulator, TetR family  27.75 
 
 		 211 aa  64.7  0.0000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.618946 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1684  regulatory protein TetR  30.81 
 
 		 211 aa  64.7  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.817144  normal  0.172233 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5908  TetR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 200 aa  63.5  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.889059 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1030  transcriptional regulator, TetR family  34.22 
 
 		 204 aa  63.2  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.468417  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2593  putative transcriptional regulator, TetR family  33.71 
 
 		 205 aa  63.2  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0854341 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4359  transcriptional regulator, TetR family  31.49 
 
 		 205 aa  63.5  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0278  transcriptional regulator, TetR family  31.93 
 
 		 206 aa  62.8  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.72994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2652  TetR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 200 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2697  TetR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 200 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.312459  normal  0.0316845 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1961  TetR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 187 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.797544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2682  TetR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 200 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0327111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3111  transcriptional regulator, TetR family  34.66 
 
 		 203 aa  62.4  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4339  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 207 aa  62.4  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00746452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2394  transcriptional regulator, TetR family  33.11 
 
 		 188 aa  61.2  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.469906  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5089  putative transcriptional regulator, TetR family  34.15 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5233  TetR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 184 aa  59.7  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.494471  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5321  TetR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 184 aa  59.7  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.868815 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1252  TetR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 202 aa  59.7  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0581191  normal  0.11609 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3260  TetR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 213 aa  59.3  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.122521  normal  0.297775 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1616  transcriptional regulator, TetR family  33.59 
 
 		 224 aa  58.9  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.86283 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4818  transcriptional regulator, TetR family  29.94 
 
 		 208 aa  58.9  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.945526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5613  TetR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 184 aa  58.9  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.687182  normal  0.405211 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20410  transcriptional regulator, tetR family  29.31 
 
 		 222 aa  58.9  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.539092  normal  0.887832 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2555  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 205 aa  58.2  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3771  transcriptional regulator, TetR family  27.91 
 
 		 223 aa  57.8  0.00000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2482  transcriptional regulator, TetR family  40.66 
 
 		 230 aa  57.4  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4433  putative transcriptional regulator, TetR family  28.35 
 
 		 199 aa  57.4  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.304497  hitchhiker  0.00999637 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1370  transcriptional regulator, TetR family  28.18 
 
 		 199 aa  57.4  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0884  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 237 aa  57  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.214434 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3148  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 231 aa  56.6  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.647957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3344  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 202 aa  56.6  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.685113 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4620  transcriptional regulator, TetR family  42.22 
 
 		 194 aa  55.8  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.732833  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1763  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 287 aa  55.8  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000686866 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5564  transcriptional regulator, TetR family  27.03 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6035  transcriptional regulator, TetR family  25.7 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3225  TetR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.314279  normal  0.210871 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0075  transcriptional regulator, TetR family  29.05 
 
 		 194 aa  55.5  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3683  TetR family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 193 aa  55.5  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.14289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4073  putative transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 208 aa  55.1  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.134392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1474  TetR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 188 aa  55.1  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5223  TetR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 197 aa  55.1  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.325156 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1685  transcriptional regulator  25.83 
 
 		 197 aa  54.7  0.0000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2232  transcriptional regulator, TetR family  29.78 
 
 		 201 aa  53.9  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.731324  hitchhiker  0.00520971 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3270  transcriptional regulator, TetR family  28.07 
 
 		 199 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3153  TetR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 215 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.755786  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1434  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 185 aa  53.5  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3714  transcriptional regulator, TetR family  40.26 
 
 		 178 aa  53.1  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.530873  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5527  transcriptional regulator, TetR family  36.09 
 
 		 203 aa  53.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0778  TetR family transcriptional regulator  28.73 
 
 		 199 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.308556  normal  0.547023 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3757  transcriptional regulator, TetR family  27.5 
 
 		 206 aa  53.1  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0306386  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2670  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 214 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.545748  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2715  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 214 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.180608  normal  0.0320009 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11192  transcriptional regulator  28.87 
 
 		 201 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3311  putative transcriptional regulator, TetR family  28.12 
 
 		 192 aa  52.4  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1561  TetR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 200 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.478798  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1585  TetR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 200 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2700  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 200 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2574  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 213 aa  52.4  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4993  transcriptional regulator, TetR family  40.85 
 
 		 202 aa  52  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.309228 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3818  transcriptional regulator, TetR family  30.26 
 
 		 212 aa  52  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.104466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4754  transcriptional regulator, TetR family  40.22 
 
 		 216 aa  52  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00853884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4384  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 208 aa  52  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2623  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 209 aa  51.6  0.000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0845142 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2758  TetR family transcriptional regulator  26.82 
 
 		 231 aa  51.6  0.000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1531  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 200 aa  51.6  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5615  TetR family transcriptional regulator  24.46 
 
 		 200 aa  51.2  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000827938  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7526  putative transcriptional regulator, TetR family  28.98 
 
 		 204 aa  51.2  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5979  TetR family transcriptional regulator  24.46 
 
 		 200 aa  51.2  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000443748  hitchhiker  0.000881636 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7144  transcriptional regulator, TetR family  30.19 
 
 		 188 aa  51.2  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.251131 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1975  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 199 aa  51.2  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382484  normal  0.828211 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5818  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 216 aa  50.4  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.199964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4603  regulatory protein TetR  31.75 
 
 		 211 aa  50.4  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204139  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1248  AcrR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 199 aa  50.8  0.00001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0867  transcriptional regulator, TetR family  32.89 
 
 		 202 aa  50.8  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0011  transcriptional regulator, putative  22.4 
 
 		 179 aa  50.4  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4478  transcriptional regulator, TetR family  31.86 
 
 		 211 aa  50.1  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0857  TetR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 181 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.755905  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4685  transcriptional regulator, TetR family  44.62 
 
 		 205 aa  50.1  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.421028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0874  TetR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 181 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0872  transcriptional regulator, TetR family  28.09 
 
 		 212 aa  50.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.83423  normal  0.281851 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4496  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 202 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0468943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5008  TetR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 201 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5902  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 213 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0863  TetR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 181 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1478  TetR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 217 aa  48.9  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2402  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 204 aa  48.9  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>