214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5818 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



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PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_5818  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
216 aa  417  1e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.199964  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4502  putative transcriptional regulator, TetR family  66.67 
 
 
249 aa  195  6e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.789852 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7526  putative transcriptional regulator, TetR family  47.34 
 
 
204 aa  144  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277737  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3036  TetR family transcriptional regulator  38.95 
 
 
196 aa  125  3e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4685  transcriptional regulator, TetR family  46.07 
 
 
205 aa  125  4.0000000000000003e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.421028  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4073  putative transcriptional regulator, TetR family  39.11 
 
 
208 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.134392  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0602  transcriptional regulator, TetR family  42.68 
 
 
209 aa  114  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3008  putative transcriptional regulator, TetR family  42.27 
 
 
203 aa  113  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0278  transcriptional regulator, TetR family  38.17 
 
 
206 aa  107  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.72994  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2012  transcriptional regulator, TetR family  40.34 
 
 
206 aa  99.4  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.719864  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4074  TetR family transcriptional regulator  41.88 
 
 
214 aa  96.7  3e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4150  TetR family transcriptional regulator  41.88 
 
 
214 aa  96.7  3e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4304  TetR family transcriptional regulator  41.88 
 
 
214 aa  96.3  3e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.127399  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7464  TetR family transcriptional regulator  32.07 
 
 
200 aa  94.4  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0288781  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1528  transcriptional regulator, TetR family  34.66 
 
 
194 aa  93.6  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.680556  normal  0.906011 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5615  TetR family transcriptional regulator  30.27 
 
 
200 aa  92.4  5e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000827938  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5979  TetR family transcriptional regulator  30.27 
 
 
200 aa  92.4  5e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000443748  hitchhiker  0.000881636 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2555  TetR family transcriptional regulator  31.75 
 
 
205 aa  87.4  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2221  transcriptional regulator, TetR family  35.15 
 
 
206 aa  84.7  9e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4457  TetR family transcriptional regulator  48.96 
 
 
209 aa  84.3  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.108103 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5908  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 
200 aa  78.6  0.00000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.889059 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6626  TetR family transcriptional regulator  35.43 
 
 
210 aa  77  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4135  TetR family transcriptional regulator  31.67 
 
 
194 aa  76.3  0.0000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3021  TetR family transcriptional regulator  33.14 
 
 
194 aa  75.9  0.0000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49231  normal  0.167388 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3311  putative transcriptional regulator, TetR family  30.49 
 
 
192 aa  75.1  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3006  TetR family transcriptional regulator  32.57 
 
 
194 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313875  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3052  TetR family transcriptional regulator  32.57 
 
 
194 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3176  transcriptional regulator, TetR family  32.03 
 
 
193 aa  74.3  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00199059 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1889  TetR family transcriptional regulator  49.43 
 
 
195 aa  72.8  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1006  transcriptional regulator, TetR family  37.74 
 
 
190 aa  72.8  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.217455  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2482  transcriptional regulator, TetR family  35.23 
 
 
230 aa  72.4  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1533  regulatory protein TetR  29.35 
 
 
203 aa  72.4  0.000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.987298  normal  0.249923 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7144  transcriptional regulator, TetR family  34.34 
 
 
188 aa  72  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.251131 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0691  regulatory protein TetR  35.91 
 
 
202 aa  71.6  0.000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2120  TetR family transcriptional regulator  37.27 
 
 
187 aa  71.2  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.613447  normal  0.0993721 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14850  transcriptional regulator  33.75 
 
 
224 aa  71.2  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4786  regulatory protein TetR  38.73 
 
 
189 aa  70.9  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4006  transcriptional regulator, TetR family  37.25 
 
 
193 aa  70.1  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.685052  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0223  putative transcriptional regulator, TetR family  34.91 
 
 
185 aa  69.3  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3173  TetR family transcriptional regulator  36.92 
 
 
213 aa  68.9  0.00000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0706  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
383 aa  68.9  0.00000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4469  transcriptional regulator, TetR family  34.97 
 
 
202 aa  69.3  0.00000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0251  transcriptional regulator, TetR family  31.28 
 
 
185 aa  67.8  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.514546  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3683  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
193 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.14289  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0028  TetR family transcriptional regulator  36.15 
 
 
191 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.35435 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4348  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 
198 aa  66.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4219  transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 
202 aa  66.2  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1370  transcriptional regulator, TetR family  30.34 
 
 
199 aa  66.2  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0884  TetR family transcriptional regulator  32.04 
 
 
237 aa  65.9  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.214434 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0075  transcriptional regulator, TetR family  31.09 
 
 
194 aa  65.9  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5887  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 
187 aa  65.5  0.0000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.350094 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0038  TetR family transcriptional regulator  36.15 
 
 
191 aa  65.1  0.0000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0047  TetR family transcriptional regulator  36.15 
 
 
191 aa  65.1  0.0000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0431132 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7472  transcriptional regulator, TetR family  32.92 
 
 
228 aa  65.5  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2066  hypothetical protein  75.61 
 
 
127 aa  65.1  0.0000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.431541  normal  0.627551 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2792  transcriptional regulator, TetR family  35.66 
 
 
248 aa  64.3  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.41359  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1030  transcriptional regulator, TetR family  29.81 
 
 
204 aa  64.3  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.468417  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3287  TetR family transcriptional regulator  30.54 
 
 
195 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.443656  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4359  transcriptional regulator, TetR family  30.06 
 
 
205 aa  63.9  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5902  TetR family transcriptional regulator  33.13 
 
 
213 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3528  transcriptional regulator, TetR family  34.68 
 
 
192 aa  62.8  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.069513  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1687  regulatory protein, TetR  35.4 
 
 
266 aa  62.8  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2402  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 
204 aa  62.8  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1387  transcriptional regulator, TetR family  31.33 
 
 
213 aa  62  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3026  transcriptional regulator, putative  30.86 
 
 
181 aa  62  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.127274  normal  0.152535 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2727  TetR family transcriptional regulator  31.29 
 
 
192 aa  61.6  0.000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.109313 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4433  putative transcriptional regulator, TetR family  34.23 
 
 
199 aa  60.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.304497  hitchhiker  0.00999637 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3021  TetR family transcriptional regulator  28.39 
 
 
210 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5564  transcriptional regulator, TetR family  30.32 
 
 
201 aa  60.5  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4496  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
202 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0468943  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11588  regulatory protein  30.77 
 
 
202 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.8751e-36  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2232  transcriptional regulator, TetR family  30.11 
 
 
201 aa  59.7  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.731324  hitchhiker  0.00520971 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2374  TetR family transcriptional regulator  36.07 
 
 
191 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4434  transcriptional regulator  48.78 
 
 
203 aa  59.7  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.147694  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1929  transcriptional regulator, TetR family  34.09 
 
 
214 aa  59.3  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.609447 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4851  TetR family transcriptional regulator  32.7 
 
 
209 aa  59.3  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000188922 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2283  TetR family transcriptional regulator  44.3 
 
 
173 aa  59.3  0.00000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000000171234  hitchhiker  0.000491617 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1531  TetR family transcriptional regulator  30.93 
 
 
200 aa  59.3  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2394  transcriptional regulator, TetR family  30.57 
 
 
188 aa  58.5  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.469906  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4515  transcriptional regulator, TetR family  26.59 
 
 
191 aa  58.2  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1561  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 
200 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.478798  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1975  transcriptional regulator, TetR family  28.41 
 
 
199 aa  58.2  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382484  normal  0.828211 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1585  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 
200 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4339  TetR family transcriptional regulator  37.72 
 
 
207 aa  57.8  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00746452  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3270  transcriptional regulator, TetR family  28.4 
 
 
199 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4620  transcriptional regulator, TetR family  40.78 
 
 
194 aa  57  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.732833  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1661  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 
180 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0333899  normal  0.0197057 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1474  TetR family transcriptional regulator  33.12 
 
 
188 aa  56.6  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2574  TetR family transcriptional regulator  32.24 
 
 
213 aa  56.6  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2037  transcriptional regulator, TetR family  28.64 
 
 
234 aa  56.6  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0364  TetR family transcriptional regulator  32.08 
 
 
209 aa  56.6  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1275  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 
214 aa  55.8  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1870  TetR family transcriptional regulator  33.74 
 
 
200 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.524009  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3506  TetR family transcriptional regulator  29.07 
 
 
195 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  0.0873465 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3063  TetR family transcriptional regulator  22.8 
 
 
192 aa  55.8  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.857011  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2758  TetR family transcriptional regulator  28.64 
 
 
231 aa  55.5  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3714  transcriptional regulator, TetR family  32.37 
 
 
178 aa  55.5  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.530873  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2652  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 
200 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_008705  Mkms_2697  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 
200 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.312459  normal  0.0316845 
 
 
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NC_009077  Mjls_2682  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 
200 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0327111  normal 
 
 
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