192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4135 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_4135  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 194 aa  394  1e-109  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4457  TetR family transcriptional regulator  43.35 
 
 		 209 aa  142  4e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.108103 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0251  transcriptional regulator, TetR family  44.03 
 
 		 185 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.514546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4786  regulatory protein TetR  39.23 
 
 		 189 aa  134  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0223  putative transcriptional regulator, TetR family  43.04 
 
 		 185 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0691  regulatory protein TetR  37.08 
 
 		 202 aa  126  2.0000000000000002e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5887  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 187 aa  124  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.350094 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1006  transcriptional regulator, TetR family  36.99 
 
 		 190 aa  122  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.217455  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3173  TetR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 213 aa  122  3e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6626  TetR family transcriptional regulator  37.91 
 
 		 210 aa  122  4e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3026  transcriptional regulator, putative  38.61 
 
 		 181 aa  121  6e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.127274  normal  0.152535 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1889  TetR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 195 aa  121  8e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2283  TetR family transcriptional regulator  40.37 
 
 		 173 aa  120  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000000171234  hitchhiker  0.000491617 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4434  transcriptional regulator  42.2 
 
 		 203 aa  118  4.9999999999999996e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.147694  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3160  transcriptional regulator, putative  36.31 
 
 		 181 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0108534  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2120  TetR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 187 aa  114  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.613447  normal  0.0993721 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7144  transcriptional regulator, TetR family  34.81 
 
 		 188 aa  105  5e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.251131 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1661  TetR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 180 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0333899  normal  0.0197057 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2555  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 205 aa  91.7  6e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3683  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 193 aa  79  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.14289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3036  TetR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 196 aa  75.9  0.0000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5818  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 216 aa  75.5  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.199964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0602  transcriptional regulator, TetR family  31.79 
 
 		 209 aa  74.7  0.0000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7526  putative transcriptional regulator, TetR family  32.35 
 
 		 204 aa  74.7  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1533  regulatory protein TetR  30.06 
 
 		 203 aa  73.6  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.987298  normal  0.249923 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2374  TetR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 191 aa  72.8  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4074  TetR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 214 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4150  TetR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 214 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2221  transcriptional regulator, TetR family  25.41 
 
 		 206 aa  69.7  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4304  TetR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 214 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.127399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1528  transcriptional regulator, TetR family  34.18 
 
 		 194 aa  70.1  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.680556  normal  0.906011 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4685  transcriptional regulator, TetR family  35.88 
 
 		 205 aa  69.3  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.421028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4272  TetR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 191 aa  69.3  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0278  transcriptional regulator, TetR family  30.86 
 
 		 206 aa  68.6  0.00000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.72994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4006  transcriptional regulator, TetR family  45 
 
 		 193 aa  68.2  0.00000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.685052  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3008  putative transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 203 aa  67.4  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0845  transcriptional regulator, TetR family  33.16 
 
 		 200 aa  66.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5615  TetR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 200 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000827938  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5979  TetR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 200 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000443748  hitchhiker  0.000881636 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2012  transcriptional regulator, TetR family  28.82 
 
 		 206 aa  64.3  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.719864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4339  TetR family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 207 aa  63.5  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00746452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5908  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 200 aa  63.5  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.889059 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4502  putative transcriptional regulator, TetR family  34.38 
 
 		 249 aa  62  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.789852 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2727  TetR family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 192 aa  61.6  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109313 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4348  transcriptional regulator, TetR family  30.06 
 
 		 198 aa  62  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4469  transcriptional regulator, TetR family  30.18 
 
 		 202 aa  61.6  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4515  transcriptional regulator, TetR family  27.54 
 
 		 191 aa  60.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2652  TetR family transcriptional regulator  25.97 
 
 		 200 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2697  TetR family transcriptional regulator  25.97 
 
 		 200 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.312459  normal  0.0316845 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2682  TetR family transcriptional regulator  25.97 
 
 		 200 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0327111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4359  transcriptional regulator, TetR family  29.47 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1030  transcriptional regulator, TetR family  29.06 
 
 		 204 aa  58.2  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.468417  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4073  putative transcriptional regulator, TetR family  27.88 
 
 		 208 aa  57.8  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.134392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1478  TetR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 217 aa  57.8  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1370  transcriptional regulator, TetR family  31.43 
 
 		 199 aa  57.4  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7464  TetR family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 200 aa  57  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0288781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20410  transcriptional regulator, tetR family  28.57 
 
 		 222 aa  57  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.539092  normal  0.887832 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0893  regulatory protein TetR  26.38 
 
 		 194 aa  56.2  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3270  transcriptional regulator, TetR family  28.82 
 
 		 199 aa  56.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3303  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 191 aa  55.5  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.916403  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2482  transcriptional regulator, TetR family  39.53 
 
 		 230 aa  55.8  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2792  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 248 aa  55.5  0.0000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.41359  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7472  transcriptional regulator, TetR family  26.4 
 
 		 228 aa  55.1  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1387  transcriptional regulator, TetR family  31.98 
 
 		 213 aa  55.1  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0884  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 237 aa  55.1  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.214434 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3063  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 192 aa  55.1  0.0000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.857011  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2623  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 209 aa  54.7  0.0000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0845142 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2758  TetR family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 231 aa  53.9  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2574  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 213 aa  54.3  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1975  transcriptional regulator, TetR family  28.36 
 
 		 199 aa  54.3  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382484  normal  0.828211 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1870  TetR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 200 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.524009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0038  TetR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 191 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0047  TetR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 191 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0431132 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4740  transcriptional regulator, TetR family  27.01 
 
 		 196 aa  53.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.609223  normal  0.406356 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0028  TetR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 191 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.35435 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3021  TetR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 194 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49231  normal  0.167388 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1687  regulatory protein, TetR  26.92 
 
 		 266 aa  53.1  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3006  TetR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 194 aa  52  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313875  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3052  TetR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 194 aa  52  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4603  regulatory protein TetR  32.69 
 
 		 211 aa  52  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204139  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0075  transcriptional regulator, TetR family  26.14 
 
 		 194 aa  52  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4384  TetR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 208 aa  51.6  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3441  TetR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 215 aa  50.1  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1163  TetR family transcriptional regulator  25.3 
 
 		 189 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.370888  normal  0.723677 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5770  transcriptional regulator, TetR family  29.1 
 
 		 201 aa  50.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.805337 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12090  transcriptional regulator, tetR family  32.04 
 
 		 182 aa  50.1  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3311  putative transcriptional regulator, TetR family  26.14 
 
 		 192 aa  50.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5169  hypothetical protein  25.54 
 
 		 188 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.27231  normal  0.324397 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05420  transcriptional regulator, tetR family  27.56 
 
 		 188 aa  49.7  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5089  putative transcriptional regulator, TetR family  25.13 
 
 		 210 aa  49.3  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0706  TetR family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 383 aa  49.3  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2430  TetR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 189 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2475  TetR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 189 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2332  regulatory protein, TetR  28.8 
 
 		 204 aa  49.3  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000899921 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4158  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 205 aa  48.5  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.000188504  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14850  transcriptional regulator  27.17 
 
 		 224 aa  48.9  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3714  transcriptional regulator, TetR family  28.98 
 
 		 178 aa  48.5  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.530873  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3225  TetR family transcriptional regulator  26.54 
 
 		 213 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.314279  normal  0.210871 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6035  transcriptional regulator, TetR family  27.32 
 
 		 203 aa  48.1  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4177  transcriptional regulator, TetR family  19.19 
 
 		 181 aa  48.1  0.00009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>