143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4434 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_4434  transcriptional regulator  100 
 
 		 203 aa  384  1e-106  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.147694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6626  TetR family transcriptional regulator  44.67 
 
 		 210 aa  135  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4135  TetR family transcriptional regulator  42.77 
 
 		 194 aa  134  7.000000000000001e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0691  regulatory protein TetR  43.2 
 
 		 202 aa  134  8e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4457  TetR family transcriptional regulator  44.75 
 
 		 209 aa  129  3e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.108103 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7144  transcriptional regulator, TetR family  44.86 
 
 		 188 aa  127  9.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.251131 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1006  transcriptional regulator, TetR family  44.83 
 
 		 190 aa  124  1e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.217455  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4786  regulatory protein TetR  43.79 
 
 		 189 aa  117  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3173  TetR family transcriptional regulator  45.56 
 
 		 213 aa  114  6.9999999999999995e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0251  transcriptional regulator, TetR family  41.32 
 
 		 185 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.514546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0223  putative transcriptional regulator, TetR family  43.11 
 
 		 185 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3026  transcriptional regulator, putative  39.18 
 
 		 181 aa  107  9.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.127274  normal  0.152535 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1889  TetR family transcriptional regulator  40.23 
 
 		 195 aa  106  3e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5887  TetR family transcriptional regulator  39.89 
 
 		 187 aa  106  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.350094 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3160  transcriptional regulator, putative  36.78 
 
 		 181 aa  104  8e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0108534  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2120  TetR family transcriptional regulator  37.95 
 
 		 187 aa  98.6  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.613447  normal  0.0993721 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2555  TetR family transcriptional regulator  42.6 
 
 		 205 aa  94  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1661  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 180 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0333899  normal  0.0197057 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7526  putative transcriptional regulator, TetR family  38.95 
 
 		 204 aa  83.6  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2283  TetR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 173 aa  82.4  0.000000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000000171234  hitchhiker  0.000491617 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3036  TetR family transcriptional regulator  41.71 
 
 		 196 aa  79  0.00000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0602  transcriptional regulator, TetR family  39.2 
 
 		 209 aa  75.5  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0278  transcriptional regulator, TetR family  40.61 
 
 		 206 aa  73.6  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.72994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3683  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 193 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.14289  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4685  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 205 aa  72.4  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.421028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4006  transcriptional regulator, TetR family  38.31 
 
 		 193 aa  72  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.685052  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2727  TetR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 192 aa  71.2  0.000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109313 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1533  regulatory protein TetR  34.36 
 
 		 203 aa  69.7  0.00000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.987298  normal  0.249923 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3008  putative transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 203 aa  68.6  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5908  TetR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 200 aa  68.2  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.889059 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5615  TetR family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 200 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000827938  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5979  TetR family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 200 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000443748  hitchhiker  0.000881636 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12090  transcriptional regulator, tetR family  40.71 
 
 		 182 aa  67  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2482  transcriptional regulator, TetR family  46.23 
 
 		 230 aa  67  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4073  putative transcriptional regulator, TetR family  37.28 
 
 		 208 aa  65.9  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.134392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4074  TetR family transcriptional regulator  39.88 
 
 		 214 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4150  TetR family transcriptional regulator  39.88 
 
 		 214 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4304  TetR family transcriptional regulator  39.88 
 
 		 214 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.127399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4620  transcriptional regulator, TetR family  47.17 
 
 		 194 aa  63.5  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.732833  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0706  TetR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 383 aa  62.4  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4469  transcriptional regulator, TetR family  43.96 
 
 		 202 aa  62.4  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7464  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 200 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0288781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1528  transcriptional regulator, TetR family  34.76 
 
 		 194 aa  60.8  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.680556  normal  0.906011 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5818  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 216 aa  61.2  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.199964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4359  transcriptional regulator, TetR family  31.91 
 
 		 205 aa  60.1  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3111  transcriptional regulator, TetR family  45.83 
 
 		 203 aa  58.5  0.00000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1030  transcriptional regulator, TetR family  43.02 
 
 		 204 aa  57.4  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.468417  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2792  transcriptional regulator, TetR family  43.93 
 
 		 248 aa  57  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.41359  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2221  transcriptional regulator, TetR family  35.84 
 
 		 206 aa  57  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2593  putative transcriptional regulator, TetR family  43.18 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0854341 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2012  transcriptional regulator, TetR family  37.71 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.719864  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2574  TetR family transcriptional regulator  49.28 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4348  transcriptional regulator, TetR family  31.37 
 
 		 198 aa  54.7  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4158  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 205 aa  54.3  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.000188504  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1687  regulatory protein, TetR  31.03 
 
 		 266 aa  54.3  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7472  transcriptional regulator, TetR family  31.79 
 
 		 228 aa  54.7  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4515  transcriptional regulator, TetR family  32.62 
 
 		 191 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1545  hypothetical protein  30.77 
 
 		 186 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.418833 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0884  TetR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 237 aa  53.5  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.214434 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1370  transcriptional regulator, TetR family  43.42 
 
 		 199 aa  52.8  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1474  TetR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 188 aa  52.4  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2394  transcriptional regulator, TetR family  34.44 
 
 		 188 aa  52.8  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.469906  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4993  transcriptional regulator, TetR family  38.78 
 
 		 202 aa  51.6  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.309228 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5089  putative transcriptional regulator, TetR family  28.16 
 
 		 210 aa  51.6  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0061  transcriptional regulator, TetR family  48.15 
 
 		 224 aa  51.6  0.000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1252  TetR family transcriptional regulator  49.18 
 
 		 202 aa  51.6  0.000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0581191  normal  0.11609 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2652  TetR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 200 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2697  TetR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 200 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.312459  normal  0.0316845 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2682  TetR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 200 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0327111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3270  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 199 aa  50.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0521  regulatory protein TetR  32.46 
 
 		 188 aa  50.1  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.368507  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3063  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 192 aa  49.7  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.857011  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2623  TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 209 aa  49.7  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0845142 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1616  transcriptional regulator, TetR family  44.3 
 
 		 224 aa  49.3  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.86283 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1237  transcriptional regulator, TetR family  44.3 
 
 		 219 aa  49.3  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.689055  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05420  transcriptional regulator, tetR family  32.98 
 
 		 188 aa  49.3  0.00004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3225  TetR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 213 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.314279  normal  0.210871 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20410  transcriptional regulator, tetR family  31.4 
 
 		 222 aa  48.9  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.539092  normal  0.887832 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0867  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 202 aa  48.9  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3006  TetR family transcriptional regulator  42.35 
 
 		 194 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313875  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3052  TetR family transcriptional regulator  42.35 
 
 		 194 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1275  transcriptional regulator, TetR family  44.19 
 
 		 214 aa  48.5  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1556  putative transcriptional regulator, TetR family  37.93 
 
 		 182 aa  48.1  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3021  TetR family transcriptional regulator  42.35 
 
 		 194 aa  48.1  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49231  normal  0.167388 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14850  transcriptional regulator  32.64 
 
 		 224 aa  48.1  0.00009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1541  TetR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 191 aa  47.8  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.590108  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2430  TetR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 189 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2475  TetR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 189 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3303  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 191 aa  47  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.916403  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3148  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 231 aa  47  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.647957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5207  TetR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 216 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5295  TetR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 216 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.334601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1163  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 189 aa  47  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.370888  normal  0.723677 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5587  TetR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 216 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.214408 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4433  putative transcriptional regulator, TetR family  35.24 
 
 		 199 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.304497  hitchhiker  0.00999637 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4754  transcriptional regulator, TetR family  38 
 
 		 216 aa  47  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00853884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1434  transcriptional regulator, TetR family  38.2 
 
 		 185 aa  46.6  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1387  transcriptional regulator, TetR family  34.19 
 
 		 213 aa  47  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1684  regulatory protein TetR  34.33 
 
 		 211 aa  46.6  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.817144  normal  0.172233 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1467  hypothetical protein  33.06 
 
 		 213 aa  45.8  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.165444  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>