223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_2430 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2430  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 189 aa  365  1e-100  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2475  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 189 aa  365  1e-100  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2727  TetR family transcriptional regulator  68.09 
 
 		 192 aa  257  6e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109313 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3683  TetR family transcriptional regulator  65.43 
 
 		 193 aa  251  6e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.14289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1030  transcriptional regulator, TetR family  37.02 
 
 		 204 aa  123  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.468417  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5908  TetR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 200 aa  120  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.889059 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0706  TetR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 383 aa  108  5e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3176  transcriptional regulator, TetR family  34.44 
 
 		 193 aa  102  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00199059 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2574  TetR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 213 aa  100  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1434  transcriptional regulator, TetR family  37.22 
 
 		 185 aa  96.7  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1370  transcriptional regulator, TetR family  32.2 
 
 		 199 aa  95.5  4e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4359  transcriptional regulator, TetR family  35.45 
 
 		 205 aa  92  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3063  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 192 aa  90.5  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.857011  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0061  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 224 aa  89.7  2e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3303  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 191 aa  86.7  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.916403  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3441  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 215 aa  87  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11588  regulatory protein  31.82 
 
 		 202 aa  86.3  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.8751e-36  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3813  transcriptional regulator, TetR family  35.36 
 
 		 222 aa  85.9  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0327168  normal  0.449726 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4219  transcriptional regulator, TetR family  31.64 
 
 		 202 aa  83.6  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2652  TetR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 200 aa  84  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2697  TetR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 200 aa  84  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.312459  normal  0.0316845 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2682  TetR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 200 aa  84  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0327111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0521  regulatory protein TetR  37.84 
 
 		 188 aa  83.2  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.368507  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1528  transcriptional regulator, TetR family  34.48 
 
 		 194 aa  83.2  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.680556  normal  0.906011 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3260  TetR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 213 aa  82.8  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.122521  normal  0.297775 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2758  TetR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 231 aa  82.4  0.000000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3311  putative transcriptional regulator, TetR family  34.46 
 
 		 192 aa  82.4  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8534  transcriptional regulator, TetR family  34.39 
 
 		 206 aa  80.1  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.027806  hitchhiker  0.00115544 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2037  transcriptional regulator, TetR family  34.57 
 
 		 234 aa  79.7  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2555  TetR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 205 aa  78.2  0.00000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2623  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 209 aa  77  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0845142 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8134  hypothetical protein  29.03 
 
 		 203 aa  76.3  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.290445  normal  0.176944 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3021  TetR family transcriptional regulator  31.32 
 
 		 210 aa  76.3  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1697  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 230 aa  75.5  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0873  transcriptional regulator, TetR family  32.11 
 
 		 215 aa  75.1  0.0000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00991598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2681  regulatory protein TetR  28.71 
 
 		 200 aa  74.7  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.111338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3111  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 203 aa  74.7  0.0000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20410  transcriptional regulator, tetR family  31.69 
 
 		 222 aa  74.3  0.0000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.539092  normal  0.887832 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0893  regulatory protein TetR  37.28 
 
 		 194 aa  73.2  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4740  transcriptional regulator, TetR family  29.73 
 
 		 196 aa  73.6  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.609223  normal  0.406356 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14850  transcriptional regulator  31.28 
 
 		 224 aa  73.2  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5564  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 201 aa  73.2  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2232  transcriptional regulator, TetR family  32.95 
 
 		 201 aa  72.8  0.000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.731324  hitchhiker  0.00520971 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5902  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 213 aa  72.8  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0867  transcriptional regulator, TetR family  31.44 
 
 		 202 aa  72.8  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1616  transcriptional regulator, TetR family  30.56 
 
 		 224 aa  72.4  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.86283 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05420  transcriptional regulator, tetR family  36.8 
 
 		 188 aa  72  0.000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0278  transcriptional regulator, TetR family  32.54 
 
 		 206 aa  72  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.72994  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4818  transcriptional regulator, TetR family  30.59 
 
 		 208 aa  71.6  0.000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.945526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5770  transcriptional regulator, TetR family  31.32 
 
 		 201 aa  71.2  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.805337 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2402  transcriptional regulator, TetR family  26.4 
 
 		 204 aa  70.9  0.000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1763  TetR family transcriptional regulator  32.96 
 
 		 287 aa  70.5  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000686866 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3021  TetR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 194 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49231  normal  0.167388 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11192  transcriptional regulator  28.57 
 
 		 201 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3998  transcriptional regulator, TetR family  35.57 
 
 		 245 aa  70.1  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000456955  normal  0.178314 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2454  TetR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 185 aa  69.7  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4754  transcriptional regulator, TetR family  28.09 
 
 		 216 aa  69.3  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00853884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0409  TetR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 214 aa  69.3  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1478  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 217 aa  68.9  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1275  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 214 aa  68.6  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3757  transcriptional regulator, TetR family  30.69 
 
 		 206 aa  68.6  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0306386  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3006  TetR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 194 aa  67  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313875  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0630  transcriptional regulator  26.77 
 
 		 209 aa  67  0.0000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.397184  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3052  TetR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 194 aa  67  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28220  transcriptional regulator  30.16 
 
 		 195 aa  67.4  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1961  TetR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 187 aa  67  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.797544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3528  transcriptional regulator, TetR family  33.79 
 
 		 192 aa  66.2  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.069513  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7144  transcriptional regulator, TetR family  31.84 
 
 		 188 aa  66.2  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.251131 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1023  regulatory protein TetR  32.47 
 
 		 196 aa  65.9  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.932216  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5089  putative transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 210 aa  65.9  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4073  putative transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 208 aa  65.9  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.134392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7526  putative transcriptional regulator, TetR family  31.14 
 
 		 204 aa  65.9  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0075  transcriptional regulator, TetR family  29.82 
 
 		 194 aa  65.5  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3714  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 178 aa  65.5  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.530873  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3506  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 195 aa  65.1  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  0.0873465 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5223  TetR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 197 aa  65.1  0.0000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.325156 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7472  transcriptional regulator, TetR family  27.13 
 
 		 228 aa  64.7  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3148  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 231 aa  64.7  0.0000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.647957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2012  transcriptional regulator, TetR family  33.11 
 
 		 206 aa  64.7  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.719864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5159  transcriptional regulator, TetR family  31.1 
 
 		 202 aa  64.3  0.0000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0326  Transcriptional regulator protein  28.02 
 
 		 217 aa  64.3  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0388  transcriptional regulator, TetR family  26.77 
 
 		 204 aa  63.9  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.654621 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3530  regulatory protein TetR  27.96 
 
 		 235 aa  63.9  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.898869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0602  transcriptional regulator, TetR family  30.91 
 
 		 209 aa  63.5  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1975  transcriptional regulator, TetR family  29.14 
 
 		 199 aa  62.8  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382484  normal  0.828211 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1684  regulatory protein TetR  32.39 
 
 		 211 aa  62.8  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.817144  normal  0.172233 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2677  transcriptional regulator, TetR family  30.93 
 
 		 206 aa  62  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0882789  normal  0.108498 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2281  transcriptional regulator, TetR family  33.08 
 
 		 215 aa  62  0.000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24200  transcriptional regulator, tetR family  33.1 
 
 		 204 aa  62  0.000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.130166  normal  0.0410828 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0364  TetR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 209 aa  61.6  0.000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2482  transcriptional regulator, TetR family  33.73 
 
 		 230 aa  61.6  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3333  transcriptional regulator, TetR family  28.89 
 
 		 211 aa  61.6  0.000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.618946 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4384  TetR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 208 aa  61.2  0.000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6626  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3036  TetR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 196 aa  60.5  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4851  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 209 aa  60.1  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188922 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1929  transcriptional regulator, TetR family  29.45 
 
 		 214 aa  58.9  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.609447 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2221  transcriptional regulator, TetR family  29.59 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2332  regulatory protein, TetR  28.96 
 
 		 204 aa  58.5  0.00000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000899921 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4135  TetR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 194 aa  57  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>