More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1528 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_1528  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 194 aa  379  1e-104  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.680556  normal  0.906011 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1556  putative transcriptional regulator, TetR family  48.88 
 
 		 182 aa  117  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3176  transcriptional regulator, TetR family  37.77 
 
 		 193 aa  108  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00199059 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5089  putative transcriptional regulator, TetR family  34.74 
 
 		 210 aa  104  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5908  TetR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 200 aa  99.4  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.889059 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4073  putative transcriptional regulator, TetR family  33.14 
 
 		 208 aa  95.5  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.134392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0075  transcriptional regulator, TetR family  35.37 
 
 		 194 aa  95.1  6e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5818  TetR family transcriptional regulator  34.66 
 
 		 216 aa  93.6  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.199964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3683  TetR family transcriptional regulator  33.92 
 
 		 193 aa  92.8  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.14289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4219  transcriptional regulator, TetR family  34.9 
 
 		 202 aa  91.7  6e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7526  putative transcriptional regulator, TetR family  32.37 
 
 		 204 aa  90.1  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7472  transcriptional regulator, TetR family  37.07 
 
 		 228 aa  89.7  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1975  transcriptional regulator, TetR family  31.68 
 
 		 199 aa  89.4  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382484  normal  0.828211 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14850  transcriptional regulator  37.5 
 
 		 224 aa  86.7  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0706  TetR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 383 aa  85.9  3e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2555  TetR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 205 aa  85.1  6e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1030  transcriptional regulator, TetR family  36.98 
 
 		 204 aa  85.1  6e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.468417  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2623  TetR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 209 aa  84.7  7e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0845142 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3063  TetR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 192 aa  84  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.857011  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1478  TetR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 217 aa  84  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2221  transcriptional regulator, TetR family  41.1 
 
 		 206 aa  82.8  0.000000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4359  transcriptional regulator, TetR family  32.09 
 
 		 205 aa  82  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4685  transcriptional regulator, TetR family  37.16 
 
 		 205 aa  82  0.000000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.421028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4515  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 191 aa  81.3  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2402  transcriptional regulator, TetR family  31.94 
 
 		 204 aa  80.5  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3303  TetR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 191 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.916403  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3528  transcriptional regulator, TetR family  33.71 
 
 		 192 aa  80.5  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.069513  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5615  TetR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 200 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000827938  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5979  TetR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 200 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000443748  hitchhiker  0.000881636 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3036  TetR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 196 aa  80.9  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2727  TetR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 192 aa  80.9  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109313 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3311  putative transcriptional regulator, TetR family  31.61 
 
 		 192 aa  80.1  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5770  transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 		 201 aa  78.2  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.805337 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1474  TetR family transcriptional regulator  38.01 
 
 		 188 aa  78.2  0.00000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5587  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 216 aa  77.8  0.00000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.214408 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4348  transcriptional regulator, TetR family  35.54 
 
 		 198 aa  77.8  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5207  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 216 aa  77.8  0.00000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5295  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 216 aa  77.8  0.00000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.334601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2332  regulatory protein, TetR  32.22 
 
 		 204 aa  77.4  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000899921 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1275  transcriptional regulator, TetR family  36.47 
 
 		 214 aa  76.3  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3270  transcriptional regulator, TetR family  33.13 
 
 		 199 aa  76.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0278  transcriptional regulator, TetR family  33.74 
 
 		 206 aa  76.6  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.72994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0884  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 237 aa  77  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.214434 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2394  transcriptional regulator, TetR family  35.88 
 
 		 188 aa  75.9  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.469906  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2232  transcriptional regulator, TetR family  32.18 
 
 		 201 aa  75.5  0.0000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.731324  hitchhiker  0.00520971 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1687  regulatory protein, TetR  35.95 
 
 		 266 aa  74.7  0.0000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4433  putative transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 199 aa  74.7  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.304497  hitchhiker  0.00999637 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4818  transcriptional regulator, TetR family  32.78 
 
 		 208 aa  74.3  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.945526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3818  transcriptional regulator, TetR family  32.32 
 
 		 212 aa  73.9  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.104466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2012  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 206 aa  73.9  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.719864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2758  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 231 aa  73.6  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2482  transcriptional regulator, TetR family  35.57 
 
 		 230 aa  72.8  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2574  TetR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 213 aa  72.8  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1697  transcriptional regulator, TetR family  32.8 
 
 		 230 aa  72.4  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0061  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 224 aa  72  0.000000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2430  TetR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 189 aa  72  0.000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2475  TetR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 189 aa  72  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0091  TetR family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 187 aa  71.6  0.000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0611138  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1929  transcriptional regulator, TetR family  35.45 
 
 		 214 aa  72  0.000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.609447 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4339  TetR family transcriptional regulator  36.16 
 
 		 207 aa  71.6  0.000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00746452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3111  transcriptional regulator, TetR family  36.59 
 
 		 203 aa  71.6  0.000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0038  TetR family transcriptional regulator  49.41 
 
 		 191 aa  71.2  0.000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0047  TetR family transcriptional regulator  49.41 
 
 		 191 aa  71.2  0.000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0431132 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0028  TetR family transcriptional regulator  49.41 
 
 		 191 aa  71.2  0.000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.35435 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20410  transcriptional regulator, tetR family  31.07 
 
 		 222 aa  70.5  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.539092  normal  0.887832 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3441  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 215 aa  70.9  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5159  transcriptional regulator, TetR family  34 
 
 		 202 aa  70.1  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4502  putative transcriptional regulator, TetR family  34.03 
 
 		 249 aa  70.1  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.789852 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4135  TetR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 194 aa  70.1  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0602  transcriptional regulator, TetR family  37.16 
 
 		 209 aa  70.1  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1684  regulatory protein TetR  34.57 
 
 		 211 aa  69.7  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.817144  normal  0.172233 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24200  transcriptional regulator, tetR family  33.73 
 
 		 204 aa  68.6  0.00000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.130166  normal  0.0410828 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5564  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 201 aa  68.6  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4620  transcriptional regulator, TetR family  35.45 
 
 		 194 aa  68.2  0.00000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.732833  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4993  transcriptional regulator, TetR family  31.68 
 
 		 202 aa  68.2  0.00000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.309228 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3260  TetR family transcriptional regulator  39.23 
 
 		 213 aa  67.8  0.00000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.122521  normal  0.297775 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3714  transcriptional regulator, TetR family  39.71 
 
 		 178 aa  67.8  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.530873  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4006  transcriptional regulator, TetR family  33.77 
 
 		 193 aa  67.4  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.685052  n/a   
 
 
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NC_009921  Franean1_1763  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 287 aa  67  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000686866 
 
 
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NC_007005  Psyr_3026  transcriptional regulator, putative  36.05 
 
 		 181 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.127274  normal  0.152535 
 
 
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NC_007509  Bcep18194_C7464  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 200 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0288781  normal  1 
 
 
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NC_013441  Gbro_0893  regulatory protein TetR  33.15 
 
 		 194 aa  67  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013169  Ksed_05420  transcriptional regulator, tetR family  39.68 
 
 		 188 aa  67  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008726  Mvan_1545  hypothetical protein  28.57 
 
 		 186 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.418833 
 
 
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NC_009077  Mjls_1531  TetR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 200 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.556905 
 
 
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NC_009338  Mflv_3021  TetR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 210 aa  65.9  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  1 
 
 
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NC_011365  Gdia_1533  regulatory protein TetR  27.96 
 
 		 203 aa  66.2  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.987298  normal  0.249923 
 
 
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NC_008726  Mvan_5223  TetR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 197 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.325156 
 
 
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NC_013595  Sros_2593  putative transcriptional regulator, TetR family  33.17 
 
 		 205 aa  66.2  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0854341 
 
 
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NC_007777  Francci3_3148  TetR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 231 aa  65.9  0.0000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.647957  normal  1 
 
 
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NC_009565  TBFG_11588  regulatory protein  31.02 
 
 		 202 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.8751e-36  normal  1 
 
 
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NC_011004  Rpal_1006  transcriptional regulator, TetR family  31.76 
 
 		 190 aa  65.5  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.217455  n/a   
 
 
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NC_009077  Mjls_3021  TetR family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 194 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49231  normal  0.167388 
 
 
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NC_009338  Mflv_4384  TetR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 208 aa  65.5  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008146  Mmcs_4074  TetR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 214 aa  65.5  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008705  Mkms_4150  TetR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 214 aa  65.5  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008146  Mmcs_1561  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 200 aa  65.1  0.0000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.478798  n/a   
 
 
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NC_009077  Mjls_4304  TetR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 214 aa  65.1  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.127399  normal  1 
 
 
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NC_008705  Mkms_1585  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 200 aa  65.1  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012850  Rleg_0845  transcriptional regulator, TetR family  28.33 
 
 		 200 aa  65.1  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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