252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_4150 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4074  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 214 aa  412  1e-114  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4150  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 214 aa  412  1e-114  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4304  TetR family transcriptional regulator  99.53 
 
 		 214 aa  411  1e-114  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.127399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0602  transcriptional regulator, TetR family  64.12 
 
 		 209 aa  203  1e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2012  transcriptional regulator, TetR family  62.94 
 
 		 206 aa  187  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.719864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3008  putative transcriptional regulator, TetR family  50.52 
 
 		 203 aa  158  7e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7526  putative transcriptional regulator, TetR family  44.21 
 
 		 204 aa  118  6e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3036  TetR family transcriptional regulator  42.41 
 
 		 196 aa  108  5e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4685  transcriptional regulator, TetR family  43.98 
 
 		 205 aa  107  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.421028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5818  TetR family transcriptional regulator  43.27 
 
 		 216 aa  106  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.199964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0278  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 206 aa  98.2  7e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.72994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4073  putative transcriptional regulator, TetR family  37.87 
 
 		 208 aa  96.7  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.134392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2555  TetR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 205 aa  96.3  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6626  TetR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 210 aa  92.8  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2221  transcriptional regulator, TetR family  40.37 
 
 		 206 aa  92.8  4e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4359  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 205 aa  87.4  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4469  transcriptional regulator, TetR family  37.77 
 
 		 202 aa  86.3  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2792  transcriptional regulator, TetR family  36.65 
 
 		 248 aa  85.5  6e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.41359  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1006  transcriptional regulator, TetR family  36.14 
 
 		 190 aa  84.3  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.217455  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5223  TetR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 197 aa  82.4  0.000000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.325156 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1975  transcriptional regulator, TetR family  33.5 
 
 		 199 aa  80.9  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382484  normal  0.828211 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4135  TetR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 194 aa  79.3  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2454  TetR family transcriptional regulator  35.26 
 
 		 185 aa  79.3  0.00000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3021  TetR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 194 aa  79.3  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49231  normal  0.167388 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7144  transcriptional regulator, TetR family  34.97 
 
 		 188 aa  77.8  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.251131 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3006  TetR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 194 aa  77.8  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313875  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3052  TetR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 194 aa  77.8  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1370  transcriptional regulator, TetR family  34.83 
 
 		 199 aa  76.6  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1474  TetR family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 188 aa  74.7  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5207  TetR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 216 aa  73.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2482  transcriptional regulator, TetR family  39.31 
 
 		 230 aa  74.7  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5295  TetR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 216 aa  73.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.334601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5587  TetR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 216 aa  73.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.214408 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5089  putative transcriptional regulator, TetR family  29.33 
 
 		 210 aa  72.8  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14850  transcriptional regulator  36.81 
 
 		 224 aa  73.2  0.000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4993  transcriptional regulator, TetR family  32.35 
 
 		 202 aa  72.4  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.309228 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0884  TetR family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 237 aa  71.6  0.000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.214434 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4502  putative transcriptional regulator, TetR family  37.82 
 
 		 249 aa  71.6  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.789852 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1030  transcriptional regulator, TetR family  32.57 
 
 		 204 aa  71.2  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.468417  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5159  transcriptional regulator, TetR family  32.34 
 
 		 202 aa  69.7  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4515  transcriptional regulator, TetR family  30.11 
 
 		 191 aa  69.7  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5908  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 200 aa  68.9  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.889059 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2332  regulatory protein, TetR  31.19 
 
 		 204 aa  68.9  0.00000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000899921 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4786  regulatory protein TetR  36.02 
 
 		 189 aa  67.8  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1528  transcriptional regulator, TetR family  36.49 
 
 		 194 aa  67.4  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.680556  normal  0.906011 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1687  regulatory protein, TetR  32.54 
 
 		 266 aa  67.8  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4457  TetR family transcriptional regulator  33.13 
 
 		 209 aa  67.8  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.108103 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2758  TetR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 231 aa  66.6  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4006  transcriptional regulator, TetR family  48.75 
 
 		 193 aa  65.9  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.685052  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2394  transcriptional regulator, TetR family  39.13 
 
 		 188 aa  65.9  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.469906  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3818  transcriptional regulator, TetR family  30.2 
 
 		 212 aa  65.5  0.0000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.104466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1889  TetR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 195 aa  65.5  0.0000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0075  transcriptional regulator, TetR family  29.52 
 
 		 194 aa  65.1  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2283  TetR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 173 aa  64.7  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000000171234  hitchhiker  0.000491617 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2652  TetR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 200 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2697  TetR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 200 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.312459  normal  0.0316845 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2682  TetR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 200 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0327111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5887  TetR family transcriptional regulator  34.66 
 
 		 187 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.350094 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0028  TetR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 191 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.35435 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5615  TetR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 200 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000827938  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1533  regulatory protein TetR  32.58 
 
 		 203 aa  63.2  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.987298  normal  0.249923 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5979  TetR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 200 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000443748  hitchhiker  0.000881636 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3176  transcriptional regulator, TetR family  37.68 
 
 		 193 aa  63.2  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00199059 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0038  TetR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 191 aa  62.4  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0047  TetR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 191 aa  62.4  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0431132 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1387  transcriptional regulator, TetR family  34.18 
 
 		 213 aa  62  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3270  transcriptional regulator, TetR family  25.81 
 
 		 199 aa  61.6  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3063  TetR family transcriptional regulator  25.29 
 
 		 192 aa  61.6  0.000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.857011  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2120  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 187 aa  61.6  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.613447  normal  0.0993721 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7464  TetR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 200 aa  61.6  0.000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0288781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3683  TetR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 193 aa  61.6  0.000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.14289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3173  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 213 aa  60.8  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2593  putative transcriptional regulator, TetR family  35.76 
 
 		 205 aa  61.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0854341 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1961  TetR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 187 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.797544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4348  transcriptional regulator, TetR family  28.25 
 
 		 198 aa  60.1  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4434  transcriptional regulator  47.62 
 
 		 203 aa  59.7  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.147694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0691  regulatory protein TetR  32.7 
 
 		 202 aa  59.3  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0706  TetR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 383 aa  59.3  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4339  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 207 aa  59.3  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00746452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2385  transcriptional regulator, TetR family  40.78 
 
 		 176 aa  59.3  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000106592  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3148  TetR family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 231 aa  58.9  0.00000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.647957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1870  TetR family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 200 aa  58.9  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.524009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3303  TetR family transcriptional regulator  25.29 
 
 		 191 aa  58.5  0.00000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.916403  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2959  transcriptional regulator, TetR family  31.55 
 
 		 200 aa  58.5  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3528  transcriptional regulator, TetR family  34.57 
 
 		 192 aa  58.2  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.069513  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3287  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 195 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.443656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1531  TetR family transcriptional regulator  33.95 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1252  TetR family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0581191  normal  0.11609 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2037  transcriptional regulator, TetR family  40.71 
 
 		 234 aa  57.4  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3311  putative transcriptional regulator, TetR family  31.95 
 
 		 192 aa  57  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4272  TetR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 191 aa  57  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6035  transcriptional regulator, TetR family  31.52 
 
 		 203 aa  57.4  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1553  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.260138 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1535  TetR family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 192 aa  57  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1561  TetR family transcriptional regulator  36.03 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.478798  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0251  transcriptional regulator, TetR family  28.8 
 
 		 185 aa  56.2  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.514546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1585  TetR family transcriptional regulator  36.03 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2374  TetR family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 191 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3506  TetR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  0.0873465 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3363  transcriptional regulator, TetR family  30.94 
 
 		 199 aa  56.2  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>