282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4006 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



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Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_4006  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 
193 aa  371  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.685052  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2792  transcriptional regulator, TetR family  52.38 
 
 
248 aa  157  6e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.41359  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4469  transcriptional regulator, TetR family  49.47 
 
 
202 aa  148  4e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2555  TetR family transcriptional regulator  36.76 
 
 
205 aa  103  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5615  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 
200 aa  94  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000827938  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5979  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 
200 aa  94  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000443748  hitchhiker  0.000881636 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7464  TetR family transcriptional regulator  41.25 
 
 
200 aa  91.3  8e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0288781  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2482  transcriptional regulator, TetR family  39.34 
 
 
230 aa  89.7  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2221  transcriptional regulator, TetR family  39.67 
 
 
206 aa  88.2  7e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3036  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 
196 aa  86.3  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5908  TetR family transcriptional regulator  33.76 
 
 
200 aa  84.7  7e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.889059 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1387  transcriptional regulator, TetR family  40.52 
 
 
213 aa  84.3  9e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4073  putative transcriptional regulator, TetR family  37.76 
 
 
208 aa  82.8  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.134392  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3008  putative transcriptional regulator, TetR family  38.03 
 
 
203 aa  81.6  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4620  transcriptional regulator, TetR family  40.54 
 
 
194 aa  79.3  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.732833  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0706  TetR family transcriptional regulator  35.26 
 
 
383 aa  78.6  0.00000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6626  TetR family transcriptional regulator  36.81 
 
 
210 aa  78.2  0.00000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0028  TetR family transcriptional regulator  36.78 
 
 
191 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.35435 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0038  TetR family transcriptional regulator  36.78 
 
 
191 aa  76.3  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0047  TetR family transcriptional regulator  36.78 
 
 
191 aa  76.3  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0431132 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1474  TetR family transcriptional regulator  37.36 
 
 
188 aa  74.7  0.0000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1533  regulatory protein TetR  39.72 
 
 
203 aa  74.3  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.987298  normal  0.249923 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0602  transcriptional regulator, TetR family  37.76 
 
 
209 aa  72.8  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7526  putative transcriptional regulator, TetR family  37.93 
 
 
204 aa  72.4  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277737  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0691  regulatory protein TetR  39.24 
 
 
202 aa  72.4  0.000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0884  TetR family transcriptional regulator  34.54 
 
 
237 aa  72  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.214434 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0867  transcriptional regulator, TetR family  40.41 
 
 
202 aa  72  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1006  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 
190 aa  70.9  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.217455  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7144  transcriptional regulator, TetR family  36.94 
 
 
188 aa  70.9  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.251131 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2394  transcriptional regulator, TetR family  36.42 
 
 
188 aa  70.1  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.469906  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5818  TetR family transcriptional regulator  35.93 
 
 
216 aa  70.1  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.199964  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0278  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 
206 aa  70.1  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.72994  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1685  transcriptional regulator  33.9 
 
 
197 aa  69.7  0.00000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0061  transcriptional regulator, TetR family  33.71 
 
 
224 aa  70.5  0.00000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1975  transcriptional regulator, TetR family  33.16 
 
 
199 aa  69.7  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382484  normal  0.828211 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4434  transcriptional regulator  49.49 
 
 
203 aa  70.1  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.147694  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4219  transcriptional regulator, TetR family  32.04 
 
 
202 aa  68.6  0.00000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4135  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 
194 aa  68.2  0.00000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3111  transcriptional regulator, TetR family  35.9 
 
 
203 aa  67.8  0.00000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2454  TetR family transcriptional regulator  33.55 
 
 
185 aa  67.4  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1528  transcriptional regulator, TetR family  33.77 
 
 
194 aa  67.4  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.680556  normal  0.906011 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1684  regulatory protein TetR  33.68 
 
 
211 aa  66.2  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.817144  normal  0.172233 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1370  transcriptional regulator, TetR family  34.92 
 
 
199 aa  65.9  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1763  TetR family transcriptional regulator  38.14 
 
 
287 aa  65.9  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000686866 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2374  TetR family transcriptional regulator  33.67 
 
 
191 aa  65.9  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4272  TetR family transcriptional regulator  32.07 
 
 
191 aa  65.5  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1434  transcriptional regulator, TetR family  40.21 
 
 
185 aa  65.5  0.0000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2652  TetR family transcriptional regulator  31.94 
 
 
200 aa  65.1  0.0000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2697  TetR family transcriptional regulator  31.94 
 
 
200 aa  65.1  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.312459  normal  0.0316845 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2682  TetR family transcriptional regulator  31.94 
 
 
200 aa  65.1  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0327111  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5089  putative transcriptional regulator, TetR family  30.35 
 
 
210 aa  64.7  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2623  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 
209 aa  63.9  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0845142 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2232  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 
201 aa  64.3  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.731324  hitchhiker  0.00520971 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4685  transcriptional regulator, TetR family  40.35 
 
 
205 aa  63.9  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.421028  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3270  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 
199 aa  63.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3225  TetR family transcriptional regulator  35.03 
 
 
213 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.314279  normal  0.210871 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1030  transcriptional regulator, TetR family  36.22 
 
 
204 aa  62.4  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.468417  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3148  TetR family transcriptional regulator  31.96 
 
 
231 aa  62.4  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.647957  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2593  putative transcriptional regulator, TetR family  32.34 
 
 
205 aa  62.4  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0854341 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3176  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 
193 aa  62  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00199059 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0075  transcriptional regulator, TetR family  42.5 
 
 
194 aa  62  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7472  transcriptional regulator, TetR family  34.52 
 
 
228 aa  61.6  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1541  TetR family transcriptional regulator  34.88 
 
 
191 aa  60.8  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.590108  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1478  TetR family transcriptional regulator  34.25 
 
 
217 aa  60.5  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0521  regulatory protein TetR  42.74 
 
 
188 aa  60.8  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.368507  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3441  TetR family transcriptional regulator  35.03 
 
 
215 aa  60.8  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4348  transcriptional regulator, TetR family  31.78 
 
 
198 aa  60.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6035  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 
203 aa  60.1  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4515  transcriptional regulator, TetR family  30.07 
 
 
191 aa  60.1  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3063  TetR family transcriptional regulator  29.25 
 
 
192 aa  59.3  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.857011  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1467  hypothetical protein  32.46 
 
 
213 aa  59.7  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.165444  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1556  putative transcriptional regulator, TetR family  35.95 
 
 
182 aa  59.3  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0326  Transcriptional regulator protein  33.81 
 
 
217 aa  59.3  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3303  TetR family transcriptional regulator  30.19 
 
 
191 aa  58.2  0.00000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.916403  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2574  TetR family transcriptional regulator  36.92 
 
 
213 aa  58.2  0.00000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3006  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 
194 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313875  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5887  TetR family transcriptional regulator  43.69 
 
 
187 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.350094 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3052  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 
194 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3021  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 
194 aa  57  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49231  normal  0.167388 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4433  putative transcriptional regulator, TetR family  37.04 
 
 
199 aa  57  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.304497  hitchhiker  0.00999637 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3311  putative transcriptional regulator, TetR family  32.06 
 
 
192 aa  56.6  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4457  TetR family transcriptional regulator  40.96 
 
 
209 aa  57  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.108103 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1023  regulatory protein TetR  36.51 
 
 
196 aa  55.8  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.932216  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1561  TetR family transcriptional regulator  31.94 
 
 
200 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.478798  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0893  regulatory protein TetR  40 
 
 
194 aa  56.2  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2332  regulatory protein, TetR  31.84 
 
 
204 aa  56.2  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000899921 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1585  TetR family transcriptional regulator  31.94 
 
 
200 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20410  transcriptional regulator, tetR family  33.88 
 
 
222 aa  56.2  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.539092  normal  0.887832 
 
 
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NC_009077  Mjls_1531  TetR family transcriptional regulator  31.94 
 
 
200 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3026  transcriptional regulator, putative  31.06 
 
 
181 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.127274  normal  0.152535 
 
 
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NC_009921  Franean1_4339  TetR family transcriptional regulator  37.12 
 
 
207 aa  55.8  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00746452  normal 
 
 
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NC_010002  Daci_1889  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 
195 aa  55.5  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_009338  Mflv_3683  TetR family transcriptional regulator  31.35 
 
 
193 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.14289  normal 
 
 
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NC_014210  Ndas_1616  transcriptional regulator, TetR family  43.24 
 
 
224 aa  55.1  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.86283 
 
 
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NC_013172  Bfae_28220  transcriptional regulator  30.51 
 
 
195 aa  55.1  0.0000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009077  Mjls_2963  TetR family transcriptional regulator  30.53 
 
 
189 aa  55.1  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.412295 
 
 
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NC_008048  Sala_0091  TetR family transcriptional regulator  29.28 
 
 
187 aa  54.7  0.0000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0611138  normal 
 
 
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NC_008146  Mmcs_4074  TetR family transcriptional regulator  48.75 
 
 
214 aa  54.7  0.0000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_008705  Mkms_4150  TetR family transcriptional regulator  48.75 
 
 
214 aa  54.7  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_008726  Mvan_1163  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 
189 aa  54.7  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.370888  normal  0.723677 
 
 
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