149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_4457 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_4457  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 209 aa  415  9.999999999999999e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.108103 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0223  putative transcriptional regulator, TetR family  55.43 
 
 		 185 aa  191  6e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0251  transcriptional regulator, TetR family  55.62 
 
 		 185 aa  187  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.514546  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3160  transcriptional regulator, putative  50.84 
 
 		 181 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0108534  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3026  transcriptional regulator, putative  49.44 
 
 		 181 aa  178  4.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.127274  normal  0.152535 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2120  TetR family transcriptional regulator  49.49 
 
 		 187 aa  177  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.613447  normal  0.0993721 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1889  TetR family transcriptional regulator  53.75 
 
 		 195 aa  176  2e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4786  regulatory protein TetR  54.04 
 
 		 189 aa  175  5e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5887  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 187 aa  170  1e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.350094 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2283  TetR family transcriptional regulator  49.41 
 
 		 173 aa  154  8e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000000171234  hitchhiker  0.000491617 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3173  TetR family transcriptional regulator  52.57 
 
 		 213 aa  153  2e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1661  TetR family transcriptional regulator  45.25 
 
 		 180 aa  149  3e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0333899  normal  0.0197057 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4135  TetR family transcriptional regulator  43.35 
 
 		 194 aa  142  5e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4434  transcriptional regulator  44.38 
 
 		 203 aa  120  9.999999999999999e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.147694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0691  regulatory protein TetR  39.76 
 
 		 202 aa  115  6e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1006  transcriptional regulator, TetR family  39.26 
 
 		 190 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.217455  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6626  TetR family transcriptional regulator  39.23 
 
 		 210 aa  109  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7144  transcriptional regulator, TetR family  37.78 
 
 		 188 aa  104  9e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.251131 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2555  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 205 aa  89.4  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5818  TetR family transcriptional regulator  48.96 
 
 		 216 aa  84.3  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.199964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7526  putative transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 		 204 aa  76.6  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3683  TetR family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 193 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.14289  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2221  transcriptional regulator, TetR family  34.54 
 
 		 206 aa  71.6  0.000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4348  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 198 aa  70.9  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3008  putative transcriptional regulator, TetR family  40.86 
 
 		 203 aa  68.9  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4515  transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 		 191 aa  68.2  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5908  TetR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 200 aa  67  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.889059 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1533  regulatory protein TetR  30.59 
 
 		 203 aa  66.2  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.987298  normal  0.249923 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0602  transcriptional regulator, TetR family  31.21 
 
 		 209 aa  65.1  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4685  transcriptional regulator, TetR family  34.55 
 
 		 205 aa  65.1  0.0000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.421028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5615  TetR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 200 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000827938  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5979  TetR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 200 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000443748  hitchhiker  0.000881636 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4073  putative transcriptional regulator, TetR family  32.12 
 
 		 208 aa  63.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.134392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11588  regulatory protein  31.45 
 
 		 202 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.8751e-36  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3036  TetR family transcriptional regulator  34.32 
 
 		 196 aa  63.9  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3270  transcriptional regulator, TetR family  29.29 
 
 		 199 aa  63.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2574  TetR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 213 aa  63.2  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0278  transcriptional regulator, TetR family  33.92 
 
 		 206 aa  61.2  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.72994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3006  TetR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 194 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313875  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3052  TetR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 194 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2374  TetR family transcriptional regulator  33.13 
 
 		 191 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3021  TetR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1687  regulatory protein, TetR  33.12 
 
 		 266 aa  60.1  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4502  putative transcriptional regulator, TetR family  30.67 
 
 		 249 aa  60.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.789852 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7464  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 200 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0288781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1163  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 189 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.370888  normal  0.723677 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3021  TetR family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 194 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49231  normal  0.167388 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14850  transcriptional regulator  29.44 
 
 		 224 aa  59.3  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3311  putative transcriptional regulator, TetR family  34.33 
 
 		 192 aa  58.5  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1528  transcriptional regulator, TetR family  42.22 
 
 		 194 aa  58.5  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.680556  normal  0.906011 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0706  TetR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 383 aa  57.4  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7472  transcriptional regulator, TetR family  29.65 
 
 		 228 aa  58.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3111  transcriptional regulator, TetR family  42.42 
 
 		 203 aa  57  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4272  TetR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 191 aa  57  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4339  TetR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 207 aa  57  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00746452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2482  transcriptional regulator, TetR family  31.02 
 
 		 230 aa  56.6  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4006  transcriptional regulator, TetR family  40.96 
 
 		 193 aa  57  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.685052  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4074  TetR family transcriptional regulator  33.13 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4150  TetR family transcriptional regulator  33.13 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4304  TetR family transcriptional regulator  33.13 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.127399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2792  transcriptional regulator, TetR family  30.21 
 
 		 248 aa  56.2  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.41359  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2012  transcriptional regulator, TetR family  31.93 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.719864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4219  transcriptional regulator, TetR family  30.82 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1370  transcriptional regulator, TetR family  30.11 
 
 		 199 aa  55.8  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0028  TetR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.35435 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4469  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0038  TetR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 191 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0047  TetR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 191 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0431132 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3176  transcriptional regulator, TetR family  40.45 
 
 		 193 aa  55.1  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00199059 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4359  transcriptional regulator, TetR family  28.74 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1975  transcriptional regulator, TetR family  28.87 
 
 		 199 aa  54.3  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382484  normal  0.828211 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3714  transcriptional regulator, TetR family  30.72 
 
 		 178 aa  54.3  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.530873  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5169  hypothetical protein  32.7 
 
 		 188 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.27231  normal  0.324397 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5564  transcriptional regulator, TetR family  30.26 
 
 		 201 aa  53.1  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2652  TetR family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 200 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2697  TetR family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 200 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.312459  normal  0.0316845 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2682  TetR family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 200 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0327111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2593  putative transcriptional regulator, TetR family  43 
 
 		 205 aa  52.4  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0854341 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0845  transcriptional regulator, TetR family  28.32 
 
 		 200 aa  52.4  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1616  transcriptional regulator, TetR family  30.56 
 
 		 224 aa  52  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.86283 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3063  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 192 aa  52  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.857011  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5902  TetR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 213 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1275  transcriptional regulator, TetR family  39.8 
 
 		 214 aa  51.2  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2727  TetR family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 192 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109313 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0893  regulatory protein TetR  27.69 
 
 		 194 aa  49.7  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3303  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 191 aa  49.7  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.916403  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5159  transcriptional regulator, TetR family  28.72 
 
 		 202 aa  49.7  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12090  transcriptional regulator, tetR family  29.94 
 
 		 182 aa  49.7  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0521  regulatory protein TetR  28.33 
 
 		 188 aa  49.7  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.368507  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4158  TetR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 205 aa  49.3  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.000188504  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4740  transcriptional regulator, TetR family  35.87 
 
 		 196 aa  49.3  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.609223  normal  0.406356 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5089  putative transcriptional regulator, TetR family  27.94 
 
 		 210 aa  49.3  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4754  transcriptional regulator, TetR family  29.94 
 
 		 216 aa  48.9  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00853884  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1929  transcriptional regulator, TetR family  29.73 
 
 		 214 aa  48.9  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.609447 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1434  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 185 aa  48.9  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3441  TetR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 215 aa  48.9  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2430  TetR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 189 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2475  TetR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 189 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1030  transcriptional regulator, TetR family  34.41 
 
 		 204 aa  48.5  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.468417  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4620  transcriptional regulator, TetR family  41 
 
 		 194 aa  48.5  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.732833  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>