137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_1661 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_1661  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 180 aa  360  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0333899  normal  0.0197057 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3160  transcriptional regulator, putative  55.25 
 
 		 181 aa  197  9e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0108534  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3026  transcriptional regulator, putative  56.35 
 
 		 181 aa  192  2e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.127274  normal  0.152535 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0251  transcriptional regulator, TetR family  55.36 
 
 		 185 aa  185  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.514546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0223  putative transcriptional regulator, TetR family  57.14 
 
 		 185 aa  184  5e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5887  TetR family transcriptional regulator  51.65 
 
 		 187 aa  176  2e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.350094 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4457  TetR family transcriptional regulator  45.25 
 
 		 209 aa  166  2e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.108103 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4786  regulatory protein TetR  48.04 
 
 		 189 aa  162  3e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3173  TetR family transcriptional regulator  53.07 
 
 		 213 aa  160  1e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2120  TetR family transcriptional regulator  48.02 
 
 		 187 aa  158  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.613447  normal  0.0993721 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1889  TetR family transcriptional regulator  48.77 
 
 		 195 aa  155  3e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2283  TetR family transcriptional regulator  48.17 
 
 		 173 aa  149  1e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000000171234  hitchhiker  0.000491617 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4135  TetR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 194 aa  105  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6626  TetR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 210 aa  99.8  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4434  transcriptional regulator  37.22 
 
 		 203 aa  97.8  7e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.147694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0691  regulatory protein TetR  32.42 
 
 		 202 aa  92.8  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1006  transcriptional regulator, TetR family  31.9 
 
 		 190 aa  90.5  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.217455  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7144  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 188 aa  89.7  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.251131 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2555  TetR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 205 aa  74.7  0.0000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5818  TetR family transcriptional regulator  42.71 
 
 		 216 aa  70.9  0.000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.199964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12090  transcriptional regulator, tetR family  28.57 
 
 		 182 aa  67  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3008  putative transcriptional regulator, TetR family  30.11 
 
 		 203 aa  64.7  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3036  TetR family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 196 aa  63.9  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0602  transcriptional regulator, TetR family  45.26 
 
 		 209 aa  63.5  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7526  putative transcriptional regulator, TetR family  41.11 
 
 		 204 aa  62.8  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277737  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4685  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 205 aa  62  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.421028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3111  transcriptional regulator, TetR family  42.57 
 
 		 203 aa  60.8  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4502  putative transcriptional regulator, TetR family  48.53 
 
 		 249 aa  59.3  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.789852 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1275  transcriptional regulator, TetR family  27.37 
 
 		 214 aa  59.3  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4339  TetR family transcriptional regulator  25.99 
 
 		 207 aa  58.2  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00746452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4073  putative transcriptional regulator, TetR family  26.04 
 
 		 208 aa  57.4  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.134392  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2221  transcriptional regulator, TetR family  38.14 
 
 		 206 aa  57  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0884  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 237 aa  56.6  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.214434 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4620  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 194 aa  56.2  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.732833  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4359  transcriptional regulator, TetR family  27.47 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2727  TetR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109313 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1533  regulatory protein TetR  31.06 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.987298  normal  0.249923 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5615  TetR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000827938  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5979  TetR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000443748  hitchhiker  0.000881636 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7464  TetR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 200 aa  53.5  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0288781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4272  TetR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 191 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3683  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 193 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.14289  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0011  transcriptional regulator, putative  20.59 
 
 		 179 aa  52.4  0.000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3006  TetR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 194 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313875  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2792  transcriptional regulator, TetR family  27.87 
 
 		 248 aa  52  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.41359  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3052  TetR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 194 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2374  TetR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 191 aa  52  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7472  transcriptional regulator, TetR family  30.07 
 
 		 228 aa  52  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5564  transcriptional regulator, TetR family  35.42 
 
 		 201 aa  52  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2482  transcriptional regulator, TetR family  38.75 
 
 		 230 aa  51.2  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5089  putative transcriptional regulator, TetR family  25.79 
 
 		 210 aa  50.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3021  TetR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 194 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49231  normal  0.167388 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4469  transcriptional regulator, TetR family  29.81 
 
 		 202 aa  50.4  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2012  transcriptional regulator, TetR family  28.74 
 
 		 206 aa  50.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.719864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0706  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 383 aa  50.1  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0038  TetR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 191 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0047  TetR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 191 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0431132 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0028  TetR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 191 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.35435 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6347  TetR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 200 aa  49.7  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1975  transcriptional regulator, TetR family  27.17 
 
 		 199 aa  49.3  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382484  normal  0.828211 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0278  transcriptional regulator, TetR family  25.99 
 
 		 206 aa  49.3  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.72994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11588  regulatory protein  27.44 
 
 		 202 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.8751e-36  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1528  transcriptional regulator, TetR family  37.21 
 
 		 194 aa  48.9  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.680556  normal  0.906011 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3063  TetR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 192 aa  48.5  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.857011  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4074  TetR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 214 aa  48.1  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4150  TetR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 214 aa  48.1  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1370  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 199 aa  48.1  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4304  TetR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 214 aa  48.1  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.127399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4496  TetR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 202 aa  48.1  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0468943  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1237  transcriptional regulator, TetR family  39.8 
 
 		 219 aa  47.8  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.689055  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0061  transcriptional regulator, TetR family  40.79 
 
 		 224 aa  47.8  0.00008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3311  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 192 aa  47  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3303  TetR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 191 aa  47.4  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.916403  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5908  TetR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 200 aa  47.4  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.889059 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4006  transcriptional regulator, TetR family  36.25 
 
 		 193 aa  47.4  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.685052  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1870  TetR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 200 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.524009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3021  TetR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 210 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2232  transcriptional regulator, TetR family  26.7 
 
 		 201 aa  46.2  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.731324  hitchhiker  0.00520971 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3148  TetR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 231 aa  45.8  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.647957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4433  putative transcriptional regulator, TetR family  32.73 
 
 		 199 aa  45.8  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.304497  hitchhiker  0.00999637 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1616  transcriptional regulator, TetR family  27.68 
 
 		 224 aa  45.8  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.86283 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1541  TetR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 191 aa  45.4  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.590108  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1434  transcriptional regulator, TetR family  34.09 
 
 		 185 aa  45.8  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0845  transcriptional regulator, TetR family  23.6 
 
 		 200 aa  45.4  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1685  transcriptional regulator  29.21 
 
 		 197 aa  45.1  0.0005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1216  transcriptional regulator, TetR family  52.27 
 
 		 224 aa  45.1  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.187428 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02619  transcriptional regulator  31.37 
 
 		 217 aa  45.1  0.0006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2652  TetR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 200 aa  44.7  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2697  TetR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 200 aa  44.7  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.312459  normal  0.0316845 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2682  TetR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 200 aa  44.7  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0327111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3176  transcriptional regulator, TetR family  31.87 
 
 		 193 aa  44.7  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00199059 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2574  TetR family transcriptional regulator  22.99 
 
 		 213 aa  44.3  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1252  TetR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 202 aa  43.9  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0581191  normal  0.11609 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1553  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 212 aa  44.3  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.260138 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2593  putative transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 205 aa  43.9  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0854341 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2827  transcriptional regulator, TetR family  26.09 
 
 		 186 aa  43.9  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.05215  normal  0.803833 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4515  transcriptional regulator, TetR family  33.04 
 
 		 191 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05420  transcriptional regulator, tetR family  26.17 
 
 		 188 aa  43.9  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0893  regulatory protein TetR  23.76 
 
 		 194 aa  43.9  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4993  transcriptional regulator, TetR family  35.63 
 
 		 202 aa  43.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.309228 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>