More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_3006 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



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Plasmid unclonability p-value
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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3006  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 194 aa  375  1e-103  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313875  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3052  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 194 aa  375  1e-103  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3021  TetR family transcriptional regulator  97.42 
 
 		 194 aa  366  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49231  normal  0.167388 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0706  TetR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 383 aa  111  6e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0091  TetR family transcriptional regulator  38.73 
 
 		 187 aa  111  7.000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0611138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7526  putative transcriptional regulator, TetR family  39.76 
 
 		 204 aa  103  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1030  transcriptional regulator, TetR family  37.02 
 
 		 204 aa  101  6e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.468417  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5908  TetR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 200 aa  100  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.889059 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1763  TetR family transcriptional regulator  40.72 
 
 		 287 aa  100  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000686866 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1687  regulatory protein, TetR  36.53 
 
 		 266 aa  98.2  7e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3063  TetR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 192 aa  95.9  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.857011  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3333  transcriptional regulator, TetR family  37.77 
 
 		 211 aa  96.3  3e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.618946 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0061  transcriptional regulator, TetR family  35.36 
 
 		 224 aa  95.5  4e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4219  transcriptional regulator, TetR family  34.97 
 
 		 202 aa  95.1  6e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3303  TetR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 191 aa  92.8  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.916403  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1370  transcriptional regulator, TetR family  39.44 
 
 		 199 aa  91.7  5e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4620  transcriptional regulator, TetR family  40.98 
 
 		 194 aa  91.3  8e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.732833  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0602  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 209 aa  89.7  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1275  transcriptional regulator, TetR family  35.68 
 
 		 214 aa  89.4  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3441  TetR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 215 aa  89.4  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3311  putative transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 192 aa  89  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3148  TetR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 231 aa  89  4e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.647957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3270  transcriptional regulator, TetR family  28.5 
 
 		 199 aa  87  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4359  transcriptional regulator, TetR family  36.93 
 
 		 205 aa  86.7  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4754  transcriptional regulator, TetR family  36.26 
 
 		 216 aa  87  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00853884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14850  transcriptional regulator  35.87 
 
 		 224 aa  87  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0278  transcriptional regulator, TetR family  33.14 
 
 		 206 aa  85.5  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.72994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8134  hypothetical protein  33.16 
 
 		 203 aa  85.1  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.290445  normal  0.176944 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2963  TetR family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 189 aa  85.1  6e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.412295 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1929  transcriptional regulator, TetR family  38.82 
 
 		 214 aa  84.7  7e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.609447 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4348  transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 		 198 aa  84.7  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0075  transcriptional regulator, TetR family  31.36 
 
 		 194 aa  84.7  8e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3176  transcriptional regulator, TetR family  34.81 
 
 		 193 aa  84  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00199059 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2948  TetR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 191 aa  83.2  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2992  TetR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 191 aa  83.2  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.385096  normal  0.373192 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7472  transcriptional regulator, TetR family  34.91 
 
 		 228 aa  83.2  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4073  putative transcriptional regulator, TetR family  33.13 
 
 		 208 aa  82.8  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.134392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3008  putative transcriptional regulator, TetR family  37.3 
 
 		 203 aa  82  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4515  transcriptional regulator, TetR family  31.52 
 
 		 191 aa  81.6  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5159  transcriptional regulator, TetR family  32.91 
 
 		 202 aa  81.6  0.000000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3287  TetR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 195 aa  80.9  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.443656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0364  TetR family transcriptional regulator  38.22 
 
 		 209 aa  80.1  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3506  TetR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 195 aa  79.7  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  0.0873465 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4851  TetR family transcriptional regulator  39.31 
 
 		 209 aa  80.1  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188922 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0893  regulatory protein TetR  38.18 
 
 		 194 aa  80.1  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0884  TetR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 237 aa  79.3  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.214434 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1684  regulatory protein TetR  33.33 
 
 		 211 aa  79.7  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.817144  normal  0.172233 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2454  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 185 aa  79  0.00000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2037  transcriptional regulator, TetR family  33.67 
 
 		 234 aa  78.6  0.00000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2574  TetR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 213 aa  78.2  0.00000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3111  transcriptional regulator, TetR family  38.71 
 
 		 203 aa  78.6  0.00000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5564  transcriptional regulator, TetR family  34.09 
 
 		 201 aa  78.2  0.00000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1616  transcriptional regulator, TetR family  36.65 
 
 		 224 aa  78.2  0.00000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.86283 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3714  transcriptional regulator, TetR family  38.42 
 
 		 178 aa  76.6  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.530873  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1531  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 200 aa  76.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3771  transcriptional regulator, TetR family  32.73 
 
 		 223 aa  76.3  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1237  transcriptional regulator, TetR family  36.32 
 
 		 219 aa  75.9  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.689055  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1975  transcriptional regulator, TetR family  30.6 
 
 		 199 aa  76.3  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382484  normal  0.828211 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5818  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 216 aa  75.5  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.199964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2623  TetR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 209 aa  75.5  0.0000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0845142 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2593  putative transcriptional regulator, TetR family  35.76 
 
 		 205 aa  75.5  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0854341 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20410  transcriptional regulator, tetR family  29.32 
 
 		 222 aa  75.1  0.0000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.539092  normal  0.887832 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1561  TetR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 200 aa  74.7  0.0000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.478798  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1585  TetR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 200 aa  74.7  0.0000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4384  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 208 aa  74.7  0.0000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1961  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 187 aa  74.7  0.0000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.797544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2332  regulatory protein, TetR  33.53 
 
 		 204 aa  73.9  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000899921 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2959  transcriptional regulator, TetR family  36.76 
 
 		 200 aa  73.2  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1387  transcriptional regulator, TetR family  33.76 
 
 		 213 aa  73.6  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2402  transcriptional regulator, TetR family  33.53 
 
 		 204 aa  73.2  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1478  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 217 aa  73.2  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2012  transcriptional regulator, TetR family  30.67 
 
 		 206 aa  72.8  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.719864  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4685  transcriptional regulator, TetR family  36.87 
 
 		 205 aa  72.8  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.421028  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4818  transcriptional regulator, TetR family  31.61 
 
 		 208 aa  72.8  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.945526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1870  TetR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 200 aa  72.4  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.524009  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2221  transcriptional regulator, TetR family  28.98 
 
 		 206 aa  72.4  0.000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3818  transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 		 212 aa  72.4  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.104466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3683  TetR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 193 aa  72  0.000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.14289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5223  TetR family transcriptional regulator  33.69 
 
 		 197 aa  72  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.325156 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2758  TetR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 231 aa  71.6  0.000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3260  TetR family transcriptional regulator  36.31 
 
 		 213 aa  71.6  0.000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.122521  normal  0.297775 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2555  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 205 aa  71.6  0.000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0778  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 199 aa  71.2  0.000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.308556  normal  0.547023 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1556  putative transcriptional regulator, TetR family  34.25 
 
 		 182 aa  70.5  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4496  TetR family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 202 aa  69.7  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0468943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4074  TetR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 214 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4150  TetR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 214 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4304  TetR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 214 aa  69.3  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.127399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4740  transcriptional regulator, TetR family  32.08 
 
 		 196 aa  68.2  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.609223  normal  0.406356 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3225  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 213 aa  68.2  0.00000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.314279  normal  0.210871 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3998  transcriptional regulator, TetR family  31.84 
 
 		 245 aa  68.2  0.00000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000456955  normal  0.178314 
 
 
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NC_013595  Sros_5089  putative transcriptional regulator, TetR family  26.06 
 
 		 210 aa  67.4  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.627316 
 
 
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NC_008726  Mvan_5902  TetR family transcriptional regulator  37.09 
 
 		 213 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013757  Gobs_1434  transcriptional regulator, TetR family  46.99 
 
 		 185 aa  67  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009565  TBFG_11588  regulatory protein  32.37 
 
 		 202 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.8751e-36  normal  1 
 
 
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NC_013093  Amir_0867  transcriptional regulator, TetR family  37.24 
 
 		 202 aa  66.2  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011891  A2cp1_3063  regulatory protein TetR  35.14 
 
 		 191 aa  65.9  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013947  Snas_4993  transcriptional regulator, TetR family  33.12 
 
 		 202 aa  66.2  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.309228 
 
 
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NC_008726  Mvan_2727  TetR family transcriptional regulator  33.92 
 
 		 192 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109313 
 
 
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NC_009921  Franean1_6626  TetR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 210 aa  65.9  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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