212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3036 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_3036  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 196 aa  377  1e-104  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4073  putative transcriptional regulator, TetR family  44.12 
 
 		 208 aa  130  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.134392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7526  putative transcriptional regulator, TetR family  46.84 
 
 		 204 aa  128  5.0000000000000004e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0278  transcriptional regulator, TetR family  46.29 
 
 		 206 aa  125  4.0000000000000003e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.72994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5818  TetR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 216 aa  124  9e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.199964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3008  putative transcriptional regulator, TetR family  41.03 
 
 		 203 aa  111  7.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4685  transcriptional regulator, TetR family  43.1 
 
 		 205 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.421028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2555  TetR family transcriptional regulator  42.7 
 
 		 205 aa  108  4.0000000000000004e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0602  transcriptional regulator, TetR family  40.8 
 
 		 209 aa  106  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2221  transcriptional regulator, TetR family  41.99 
 
 		 206 aa  103  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6626  TetR family transcriptional regulator  39.89 
 
 		 210 aa  101  8e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4304  TetR family transcriptional regulator  42.41 
 
 		 214 aa  94  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.127399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4074  TetR family transcriptional regulator  42.41 
 
 		 214 aa  93.6  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4150  TetR family transcriptional regulator  42.41 
 
 		 214 aa  93.6  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4469  transcriptional regulator, TetR family  37.58 
 
 		 202 aa  92.8  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1533  regulatory protein TetR  36.75 
 
 		 203 aa  91.3  8e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.987298  normal  0.249923 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2012  transcriptional regulator, TetR family  40.23 
 
 		 206 aa  91.3  9e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.719864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7464  TetR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 200 aa  86.7  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0288781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5908  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 200 aa  86.3  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.889059 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4006  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 193 aa  86.7  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.685052  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0706  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 383 aa  85.1  6e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1687  regulatory protein, TetR  36.36 
 
 		 266 aa  82.8  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0091  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 187 aa  82  0.000000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0611138  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3063  TetR family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 192 aa  81.6  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.857011  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1030  transcriptional regulator, TetR family  35.03 
 
 		 204 aa  81.3  0.000000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.468417  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1370  transcriptional regulator, TetR family  33.73 
 
 		 199 aa  80.1  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1528  transcriptional regulator, TetR family  32.89 
 
 		 194 aa  80.5  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.680556  normal  0.906011 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4359  transcriptional regulator, TetR family  34.3 
 
 		 205 aa  79.7  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3303  TetR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 191 aa  79.3  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.916403  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4502  putative transcriptional regulator, TetR family  35.62 
 
 		 249 aa  79.7  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.789852 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7144  transcriptional regulator, TetR family  35.39 
 
 		 188 aa  79  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.251131 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2792  transcriptional regulator, TetR family  32.09 
 
 		 248 aa  79  0.00000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.41359  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5615  TetR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 200 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000827938  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5979  TetR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 200 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000443748  hitchhiker  0.000881636 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0075  transcriptional regulator, TetR family  30.23 
 
 		 194 aa  76.3  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4135  TetR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 194 aa  75.5  0.0000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3176  transcriptional regulator, TetR family  32.93 
 
 		 193 aa  75.1  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00199059 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3021  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 194 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49231  normal  0.167388 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2623  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 209 aa  70.5  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0845142 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5887  TetR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 187 aa  70.5  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.350094 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0251  transcriptional regulator, TetR family  36.05 
 
 		 185 aa  70.5  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.514546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0223  putative transcriptional regulator, TetR family  35.93 
 
 		 185 aa  70.5  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1478  TetR family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 217 aa  69.7  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2758  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 231 aa  69.3  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3006  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 194 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313875  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3052  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 194 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4219  transcriptional regulator, TetR family  30.72 
 
 		 202 aa  69.7  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3026  transcriptional regulator, putative  33.33 
 
 		 181 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.127274  normal  0.152535 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4786  regulatory protein TetR  35.39 
 
 		 189 aa  68.9  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1006  transcriptional regulator, TetR family  32.94 
 
 		 190 aa  68.9  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.217455  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14850  transcriptional regulator  32.74 
 
 		 224 aa  67  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0884  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 237 aa  67.8  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.214434 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4434  transcriptional regulator  49.45 
 
 		 203 aa  66.6  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.147694  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3333  transcriptional regulator, TetR family  33.7 
 
 		 211 aa  65.9  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.618946 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1387  transcriptional regulator, TetR family  32.98 
 
 		 213 aa  66.2  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3813  transcriptional regulator, TetR family  32.76 
 
 		 222 aa  65.9  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0327168  normal  0.449726 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2232  transcriptional regulator, TetR family  33.14 
 
 		 201 aa  66.2  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.731324  hitchhiker  0.00520971 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20410  transcriptional regulator, tetR family  30.77 
 
 		 222 aa  66.2  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.539092  normal  0.887832 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5159  transcriptional regulator, TetR family  31.95 
 
 		 202 aa  65.1  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1531  TetR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 200 aa  65.1  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4457  TetR family transcriptional regulator  34.32 
 
 		 209 aa  64.3  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.108103 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2120  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 187 aa  63.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.613447  normal  0.0993721 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1561  TetR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 200 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.478798  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1585  TetR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 200 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1975  transcriptional regulator, TetR family  31.28 
 
 		 199 aa  62.8  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382484  normal  0.828211 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2332  regulatory protein, TetR  33.68 
 
 		 204 aa  62.8  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000899921 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3160  transcriptional regulator, putative  33.54 
 
 		 181 aa  62.4  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0108534  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2593  putative transcriptional regulator, TetR family  34.21 
 
 		 205 aa  62.4  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0854341 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2482  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 230 aa  62.4  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1889  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 195 aa  62  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3311  putative transcriptional regulator, TetR family  31.11 
 
 		 192 aa  62  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3818  transcriptional regulator, TetR family  30.59 
 
 		 212 aa  61.6  0.000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.104466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3683  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 193 aa  62  0.000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.14289  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1252  TetR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 202 aa  62  0.000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0581191  normal  0.11609 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3270  transcriptional regulator, TetR family  27.47 
 
 		 199 aa  61.2  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4515  transcriptional regulator, TetR family  29.48 
 
 		 191 aa  61.2  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2454  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 185 aa  60.8  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0691  regulatory protein TetR  48.31 
 
 		 202 aa  61.2  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4818  transcriptional regulator, TetR family  31.07 
 
 		 208 aa  60.5  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.945526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1556  putative transcriptional regulator, TetR family  35.26 
 
 		 182 aa  60.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1434  transcriptional regulator, TetR family  34.67 
 
 		 185 aa  60.5  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1697  transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 		 230 aa  60.5  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1275  transcriptional regulator, TetR family  29.12 
 
 		 214 aa  59.3  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3173  TetR family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 213 aa  58.9  0.00000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2652  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 200 aa  58.9  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2697  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 200 aa  58.9  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.312459  normal  0.0316845 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2682  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 200 aa  58.9  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0327111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4339  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00746452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4993  transcriptional regulator, TetR family  30.86 
 
 		 202 aa  58.9  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.309228 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4433  putative transcriptional regulator, TetR family  33.17 
 
 		 199 aa  58.9  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.304497  hitchhiker  0.00999637 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0011  transcriptional regulator, putative  20.83 
 
 		 179 aa  58.2  0.00000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1163  TetR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 189 aa  58.5  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.370888  normal  0.723677 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2402  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 204 aa  58.2  0.00000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7472  transcriptional regulator, TetR family  28.49 
 
 		 228 aa  58.2  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1545  hypothetical protein  26.11 
 
 		 186 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.418833 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11588  regulatory protein  28.16 
 
 		 202 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.8751e-36  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28220  transcriptional regulator  32.14 
 
 		 195 aa  57  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3287  TetR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 195 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.443656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0061  transcriptional regulator, TetR family  29.28 
 
 		 224 aa  57  0.0000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2283  TetR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 173 aa  56.2  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000000171234  hitchhiker  0.000491617 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>