284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3333 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3333  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 211 aa  413  9.999999999999999e-116  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.618946 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1684  regulatory protein TetR  42.64 
 
 		 211 aa  123  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.817144  normal  0.172233 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3303  TetR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 191 aa  104  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.916403  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3063  TetR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 192 aa  103  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.857011  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4219  transcriptional regulator, TetR family  36.76 
 
 		 202 aa  100  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3006  TetR family transcriptional regulator  37.77 
 
 		 194 aa  96.3  3e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313875  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3052  TetR family transcriptional regulator  37.77 
 
 		 194 aa  96.3  3e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3021  TetR family transcriptional regulator  37.77 
 
 		 194 aa  95.9  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49231  normal  0.167388 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20410  transcriptional regulator, tetR family  32.98 
 
 		 222 aa  95.1  7e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.539092  normal  0.887832 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5223  TetR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 197 aa  86.7  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.325156 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0706  TetR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 383 aa  86.7  3e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1275  transcriptional regulator, TetR family  32.98 
 
 		 214 aa  85.9  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3771  transcriptional regulator, TetR family  35.12 
 
 		 223 aa  83.6  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5207  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 216 aa  81.3  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5295  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 216 aa  81.3  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.334601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5587  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 216 aa  81.3  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.214408 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1030  transcriptional regulator, TetR family  33.51 
 
 		 204 aa  80.5  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.468417  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3111  transcriptional regulator, TetR family  33.51 
 
 		 203 aa  77.8  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5089  putative transcriptional regulator, TetR family  32.78 
 
 		 210 aa  77.4  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1961  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 187 aa  77.4  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.797544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4359  transcriptional regulator, TetR family  33.71 
 
 		 205 aa  76.6  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4384  TetR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 208 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3270  transcriptional regulator, TetR family  28.22 
 
 		 199 aa  76.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0061  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 224 aa  76.3  0.0000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0014  TetR family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 234 aa  76.3  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.730336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5908  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 200 aa  75.9  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.889059 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0845  transcriptional regulator, TetR family  31.94 
 
 		 200 aa  74.7  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0893  regulatory protein TetR  32.22 
 
 		 194 aa  73.9  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1687  regulatory protein, TetR  33.53 
 
 		 266 aa  72.4  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0884  TetR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 237 aa  72.4  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.214434 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2037  transcriptional regulator, TetR family  32.62 
 
 		 234 aa  71.6  0.000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7526  putative transcriptional regulator, TetR family  34.57 
 
 		 204 aa  70.5  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7472  transcriptional regulator, TetR family  32.35 
 
 		 228 aa  70.5  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2402  transcriptional regulator, TetR family  31.55 
 
 		 204 aa  69.7  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3225  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 213 aa  68.9  0.00000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.314279  normal  0.210871 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0075  transcriptional regulator, TetR family  32.22 
 
 		 194 aa  68.9  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11192  transcriptional regulator  28.96 
 
 		 201 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1697  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 230 aa  68.2  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4348  transcriptional regulator, TetR family  26.99 
 
 		 198 aa  67.8  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2232  transcriptional regulator, TetR family  31.69 
 
 		 201 aa  67  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.731324  hitchhiker  0.00520971 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5159  transcriptional regulator, TetR family  32.1 
 
 		 202 aa  66.6  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1252  TetR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 202 aa  66.6  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0581191  normal  0.11609 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1467  hypothetical protein  32.47 
 
 		 213 aa  66.6  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.165444  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4603  regulatory protein TetR  32.2 
 
 		 211 aa  66.2  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204139  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1763  TetR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 287 aa  66.2  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000686866 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2652  TetR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 200 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2697  TetR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 200 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.312459  normal  0.0316845 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2682  TetR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 200 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0327111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2758  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 231 aa  65.9  0.0000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3998  transcriptional regulator, TetR family  33.11 
 
 		 245 aa  65.5  0.0000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000456955  normal  0.178314 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4754  transcriptional regulator, TetR family  31.67 
 
 		 216 aa  65.9  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00853884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1535  TetR family transcriptional regulator  36.41 
 
 		 192 aa  65.5  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3036  TetR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 196 aa  65.5  0.0000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4993  transcriptional regulator, TetR family  29.1 
 
 		 202 aa  65.1  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.309228 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0011  transcriptional regulator, putative  20.11 
 
 		 179 aa  64.3  0.000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3148  TetR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 231 aa  64.7  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.647957  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3260  TetR family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 213 aa  64.7  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.122521  normal  0.297775 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2827  transcriptional regulator, TetR family  27.75 
 
 		 186 aa  64.7  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.05215  normal  0.803833 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5564  transcriptional regulator, TetR family  27.23 
 
 		 201 aa  64.3  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2727  TetR family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 192 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109313 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5770  transcriptional regulator, TetR family  33.53 
 
 		 201 aa  64.7  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.805337 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4515  transcriptional regulator, TetR family  25.15 
 
 		 191 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14850  transcriptional regulator  29.26 
 
 		 224 aa  63.2  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0872  transcriptional regulator, TetR family  29.02 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.83423  normal  0.281851 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6035  transcriptional regulator, TetR family  26.78 
 
 		 203 aa  63.2  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2332  regulatory protein, TetR  31.87 
 
 		 204 aa  63.2  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000899921 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1975  transcriptional regulator, TetR family  31.35 
 
 		 199 aa  62.8  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382484  normal  0.828211 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5008  TetR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 201 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0278  transcriptional regulator, TetR family  34.19 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.72994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2593  putative transcriptional regulator, TetR family  29.08 
 
 		 205 aa  62.4  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0854341 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4818  transcriptional regulator, TetR family  28.41 
 
 		 208 aa  62.4  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.945526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1370  transcriptional regulator, TetR family  30.6 
 
 		 199 aa  62  0.000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3344  TetR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 202 aa  62  0.000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.685113 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3441  TetR family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 215 aa  62  0.000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3311  putative transcriptional regulator, TetR family  31.18 
 
 		 192 aa  62  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0492  TetR family transcriptional regulator  39.52 
 
 		 193 aa  62  0.000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.496213  normal  0.296626 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3683  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 193 aa  62  0.000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.14289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2623  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 209 aa  60.5  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0845142 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2792  transcriptional regulator, TetR family  30.14 
 
 		 248 aa  60.1  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.41359  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0602  transcriptional regulator, TetR family  31.4 
 
 		 209 aa  60.1  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1478  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 217 aa  59.3  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3714  transcriptional regulator, TetR family  32.79 
 
 		 178 aa  59.3  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.530873  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1929  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 214 aa  59.3  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.609447 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1434  transcriptional regulator, TetR family  33.53 
 
 		 185 aa  58.9  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0778  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 199 aa  58.5  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.308556  normal  0.547023 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13188  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 208 aa  58.2  0.00000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.166406 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4073  putative transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 208 aa  57.4  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.134392  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4469  transcriptional regulator, TetR family  31.02 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4496  TetR family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 202 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0468943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3008  putative transcriptional regulator, TetR family  33.15 
 
 		 203 aa  57.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2677  transcriptional regulator, TetR family  31.97 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0882789  normal  0.108498 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11588  regulatory protein  27.33 
 
 		 202 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.8751e-36  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05420  transcriptional regulator, tetR family  35.16 
 
 		 188 aa  57.4  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0409  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 214 aa  57.4  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1553  TetR family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.260138 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2221  transcriptional regulator, TetR family  31.14 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5613  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 184 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.687182  normal  0.405211 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1870  TetR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.524009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3176  transcriptional regulator, TetR family  26.95 
 
 		 193 aa  55.8  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00199059 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3818  transcriptional regulator, TetR family  25.43 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.104466  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>