183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_20410 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_20410  transcriptional regulator, tetR family  100 
 
 		 222 aa  444  1.0000000000000001e-124  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.539092  normal  0.887832 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0061  transcriptional regulator, TetR family  43.43 
 
 		 224 aa  116  1.9999999999999998e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1684  regulatory protein TetR  34 
 
 		 211 aa  111  7.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.817144  normal  0.172233 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1030  transcriptional regulator, TetR family  34.69 
 
 		 204 aa  103  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.468417  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3303  TetR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 191 aa  99.4  4e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.916403  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4993  transcriptional regulator, TetR family  33.85 
 
 		 202 aa  96.3  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.309228 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3333  transcriptional regulator, TetR family  32.98 
 
 		 211 aa  95.1  8e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.618946 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3063  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 192 aa  94.7  9e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.857011  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3683  TetR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 193 aa  92  6e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.14289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4219  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 202 aa  91.3  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2727  TetR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 192 aa  89  6e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109313 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1870  TetR family transcriptional regulator  37.95 
 
 		 200 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.524009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1961  TetR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 187 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.797544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7472  transcriptional regulator, TetR family  33.51 
 
 		 228 aa  86.3  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0884  TetR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 237 aa  85.9  5e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.214434 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4073  putative transcriptional regulator, TetR family  36.99 
 
 		 208 aa  85.1  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.134392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5908  TetR family transcriptional regulator  27 
 
 		 200 aa  84.7  9e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.889059 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5564  transcriptional regulator, TetR family  34.15 
 
 		 201 aa  84.7  9e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1370  transcriptional regulator, TetR family  32.8 
 
 		 199 aa  84.3  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1531  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 200 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0706  TetR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 383 aa  82.8  0.000000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1561  TetR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 200 aa  82  0.000000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.478798  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1585  TetR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 200 aa  82  0.000000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0845  transcriptional regulator, TetR family  29.19 
 
 		 200 aa  79.3  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4496  TetR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 202 aa  79  0.00000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0468943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13188  TetR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 208 aa  79.3  0.00000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.166406 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4359  transcriptional regulator, TetR family  29.55 
 
 		 205 aa  78.2  0.00000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1434  transcriptional regulator, TetR family  35.33 
 
 		 185 aa  77.8  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2454  TetR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 185 aa  77.4  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3714  transcriptional regulator, TetR family  38.79 
 
 		 178 aa  78.2  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.530873  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3111  transcriptional regulator, TetR family  33.5 
 
 		 203 aa  76.6  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4348  transcriptional regulator, TetR family  27.91 
 
 		 198 aa  76.6  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4384  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 208 aa  76.3  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4603  regulatory protein TetR  31.38 
 
 		 211 aa  75.9  0.0000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204139  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0075  transcriptional regulator, TetR family  29.44 
 
 		 194 aa  75.5  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3021  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 194 aa  75.5  0.0000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49231  normal  0.167388 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3006  TetR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 194 aa  75.1  0.0000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313875  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3052  TetR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 194 aa  75.1  0.0000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2221  transcriptional regulator, TetR family  32.75 
 
 		 206 aa  75.1  0.0000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0893  regulatory protein TetR  28.74 
 
 		 194 aa  74.7  0.0000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2574  TetR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 213 aa  74.3  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1553  TetR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 212 aa  74.3  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.260138 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1533  regulatory protein TetR  31.41 
 
 		 203 aa  74.3  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.987298  normal  0.249923 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2758  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 231 aa  73.6  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1697  transcriptional regulator, TetR family  29.35 
 
 		 230 aa  73.9  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14850  transcriptional regulator  30.85 
 
 		 224 aa  74.3  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1275  transcriptional regulator, TetR family  27.49 
 
 		 214 aa  73.9  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3441  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 215 aa  72.4  0.000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4515  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 191 aa  72.4  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1763  TetR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 287 aa  72.4  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000686866 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3530  regulatory protein TetR  32.35 
 
 		 235 aa  72  0.000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.898869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1687  regulatory protein, TetR  28.85 
 
 		 266 aa  71.6  0.000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2555  TetR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 205 aa  71.6  0.000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0011  transcriptional regulator, putative  22.7 
 
 		 179 aa  71.6  0.000000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2623  TetR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 209 aa  71.2  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0845142 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5223  TetR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 197 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.325156 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2037  transcriptional regulator, TetR family  30.85 
 
 		 234 aa  70.1  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1528  transcriptional regulator, TetR family  31.07 
 
 		 194 aa  70.5  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.680556  normal  0.906011 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3148  TetR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 231 aa  70.1  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.647957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2430  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 189 aa  69.3  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2475  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 189 aa  69.3  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3176  transcriptional regulator, TetR family  31.85 
 
 		 193 aa  69.3  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00199059 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1467  hypothetical protein  32.68 
 
 		 213 aa  69.3  0.00000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.165444  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2652  TetR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 200 aa  69.3  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5089  putative transcriptional regulator, TetR family  27.98 
 
 		 210 aa  68.9  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2697  TetR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 200 aa  69.3  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.312459  normal  0.0316845 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2682  TetR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 200 aa  69.3  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0327111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2332  regulatory protein, TetR  26.94 
 
 		 204 aa  68.9  0.00000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000899921 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7526  putative transcriptional regulator, TetR family  30.54 
 
 		 204 aa  67.8  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0278  transcriptional regulator, TetR family  32.73 
 
 		 206 aa  67.4  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.72994  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4818  transcriptional regulator, TetR family  27.59 
 
 		 208 aa  66.6  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.945526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0091  TetR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 187 aa  66.2  0.0000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0611138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3270  transcriptional regulator, TetR family  24.56 
 
 		 199 aa  66.2  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2593  putative transcriptional regulator, TetR family  28.93 
 
 		 205 aa  65.9  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0854341 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3021  TetR family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 210 aa  65.9  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2963  TetR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 189 aa  65.1  0.0000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.412295 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2948  TetR family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 191 aa  65.1  0.0000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2992  TetR family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 191 aa  65.1  0.0000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.385096  normal  0.373192 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0872  transcriptional regulator, TetR family  27.09 
 
 		 212 aa  65.1  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.83423  normal  0.281851 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5207  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 216 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1252  TetR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 202 aa  64.3  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0581191  normal  0.11609 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5295  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 216 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.334601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5587  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 216 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.214408 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1478  TetR family transcriptional regulator  25.65 
 
 		 217 aa  64.3  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3036  TetR family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 196 aa  64.3  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5770  transcriptional regulator, TetR family  27.52 
 
 		 201 aa  63.5  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.805337 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3771  transcriptional regulator, TetR family  29.94 
 
 		 223 aa  63.2  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2482  transcriptional regulator, TetR family  32.6 
 
 		 230 aa  63.5  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0492  TetR family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 193 aa  62.4  0.000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.496213  normal  0.296626 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1975  transcriptional regulator, TetR family  26.9 
 
 		 199 aa  62  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382484  normal  0.828211 
 
 
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NC_014210  Ndas_1929  transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 		 214 aa  62.4  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.609447 
 
 
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NC_014210  Ndas_1616  transcriptional regulator, TetR family  29.59 
 
 		 224 aa  62  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.86283 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3225  TetR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 213 aa  62  0.000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.314279  normal  0.210871 
 
 
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NC_011145  AnaeK_2394  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 188 aa  62  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.469906  n/a   
 
 
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NC_011145  AnaeK_2959  transcriptional regulator, TetR family  29.94 
 
 		 200 aa  61.6  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011989  Avi_0326  Transcriptional regulator protein  27.27 
 
 		 217 aa  61.6  0.000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009664  Krad_3324  transcriptional regulator, TetR family  27.81 
 
 		 225 aa  61.6  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.748824 
 
 
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NC_010725  Mpop_3818  transcriptional regulator, TetR family  28.16 
 
 		 212 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.104466  normal  1 
 
 
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NC_013595  Sros_3008  putative transcriptional regulator, TetR family  30.39 
 
 		 203 aa  60.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013947  Snas_4740  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 196 aa  59.3  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.609223  normal  0.406356 
 
 
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