More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1553 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1553  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 212 aa  436  1e-121  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.260138 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3818  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 212 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.104466  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3063  TetR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 192 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.857011  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3303  TetR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 191 aa  109  3e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.916403  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5223  TetR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 197 aa  93.6  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.325156 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3063  regulatory protein TetR  34.64 
 
 		 191 aa  92.4  5e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2959  transcriptional regulator, TetR family  32.18 
 
 		 200 aa  89.4  4e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1975  transcriptional regulator, TetR family  33.85 
 
 		 199 aa  88.2  9e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382484  normal  0.828211 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4255  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 216 aa  85.9  4e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.323719 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2652  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 200 aa  83.2  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2697  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 200 aa  83.2  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.312459  normal  0.0316845 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0884  TetR family transcriptional regulator  35.26 
 
 		 237 aa  82.8  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.214434 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2682  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 200 aa  83.2  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0327111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5207  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 216 aa  82.4  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5295  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 216 aa  82.4  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.334601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5587  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 216 aa  82.4  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.214408 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0075  transcriptional regulator, TetR family  31.61 
 
 		 194 aa  80.1  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3363  transcriptional regulator, TetR family  30.73 
 
 		 199 aa  80.1  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5770  transcriptional regulator, TetR family  32.62 
 
 		 201 aa  79.7  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.805337 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0845  transcriptional regulator, TetR family  25.76 
 
 		 200 aa  78.2  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4359  transcriptional regulator, TetR family  28.42 
 
 		 205 aa  77  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2402  transcriptional regulator, TetR family  37.16 
 
 		 204 aa  76.3  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4073  putative transcriptional regulator, TetR family  29.48 
 
 		 208 aa  75.9  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.134392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20410  transcriptional regulator, tetR family  26.37 
 
 		 222 aa  74.3  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.539092  normal  0.887832 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4993  transcriptional regulator, TetR family  28.9 
 
 		 202 aa  74.7  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.309228 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2623  TetR family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 209 aa  74.3  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0845142 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5159  transcriptional regulator, TetR family  27.53 
 
 		 202 aa  73.6  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6035  transcriptional regulator, TetR family  29.69 
 
 		 203 aa  73.2  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2332  regulatory protein, TetR  30 
 
 		 204 aa  72.8  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000899921 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1030  transcriptional regulator, TetR family  29.84 
 
 		 204 aa  72.4  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.468417  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2221  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 206 aa  72.4  0.000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4515  transcriptional regulator, TetR family  34.48 
 
 		 191 aa  72  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1478  TetR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 217 aa  71.6  0.000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2593  putative transcriptional regulator, TetR family  31.89 
 
 		 205 aa  70.9  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0854341 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2232  transcriptional regulator, TetR family  30.19 
 
 		 201 aa  69.7  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.731324  hitchhiker  0.00520971 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4339  TetR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 207 aa  68.9  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00746452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0278  transcriptional regulator, TetR family  29.61 
 
 		 206 aa  68.6  0.00000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.72994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1535  TetR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 192 aa  68.6  0.00000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5908  TetR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 200 aa  67.8  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.889059 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0011  transcriptional regulator, putative  25.99 
 
 		 179 aa  67.4  0.0000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14850  transcriptional regulator  30.23 
 
 		 224 aa  67  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0893  regulatory protein TetR  47.22 
 
 		 194 aa  66.2  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5564  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 201 aa  65.5  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5089  putative transcriptional regulator, TetR family  29.3 
 
 		 210 aa  65.5  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3111  transcriptional regulator, TetR family  30.91 
 
 		 203 aa  65.1  0.0000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7464  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 200 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0288781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0706  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 383 aa  65.1  0.0000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2758  TetR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 231 aa  65.5  0.0000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1528  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 194 aa  64.7  0.0000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.680556  normal  0.906011 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1275  transcriptional regulator, TetR family  27.64 
 
 		 214 aa  64.7  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3021  TetR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 210 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3270  transcriptional regulator, TetR family  31.4 
 
 		 199 aa  63.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4433  putative transcriptional regulator, TetR family  50.88 
 
 		 199 aa  63.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.304497  hitchhiker  0.00999637 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0028  TetR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 191 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.35435 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2374  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 191 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11588  regulatory protein  27.87 
 
 		 202 aa  62.8  0.000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.8751e-36  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5008  TetR family transcriptional regulator  27.53 
 
 		 201 aa  62.4  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0038  TetR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 191 aa  62.4  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0047  TetR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 191 aa  62.4  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0431132 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4348  transcriptional regulator, TetR family  31.98 
 
 		 198 aa  62.4  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0778  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 199 aa  62.4  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.308556  normal  0.547023 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2385  transcriptional regulator, TetR family  33.91 
 
 		 176 aa  62  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000106592  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3006  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 194 aa  62  0.000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313875  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3052  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 194 aa  62  0.000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3021  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 194 aa  62  0.000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49231  normal  0.167388 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1252  TetR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 202 aa  61.6  0.000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0581191  normal  0.11609 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5615  TetR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 200 aa  61.6  0.000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000827938  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5979  TetR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 200 aa  61.6  0.000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000443748  hitchhiker  0.000881636 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3176  transcriptional regulator, TetR family  26.32 
 
 		 193 aa  60.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00199059 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6292  TetR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0061  transcriptional regulator, TetR family  29.22 
 
 		 224 aa  59.3  0.00000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0602  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0425  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 216 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1763  TetR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 287 aa  57.8  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000686866 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3311  putative transcriptional regulator, TetR family  28.25 
 
 		 192 aa  58.2  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3998  transcriptional regulator, TetR family  30.33 
 
 		 245 aa  58.2  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000456955  normal  0.178314 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4272  TetR family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 191 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1121  TetR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0496337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4446  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7472  transcriptional regulator, TetR family  25.42 
 
 		 228 aa  57.4  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4219  transcriptional regulator, TetR family  25.53 
 
 		 202 aa  56.6  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1370  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 199 aa  57  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3975  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 203 aa  57.4  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3333  transcriptional regulator, TetR family  26.02 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.618946 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1993  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.209055  normal  0.134866 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3441  TetR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3036  TetR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3148  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 231 aa  54.7  0.0000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.647957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1687  regulatory protein, TetR  28.07 
 
 		 266 aa  54.7  0.0000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4818  transcriptional regulator, TetR family  24.86 
 
 		 208 aa  54.7  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.945526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2963  TetR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 189 aa  54.7  0.0000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.412295 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12090  transcriptional regulator, tetR family  26.18 
 
 		 182 aa  54.3  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3058  TetR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 209 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.765793  normal  0.0466418 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2792  transcriptional regulator, TetR family  25.28 
 
 		 248 aa  54.7  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.41359  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4496  TetR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 202 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0468943  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3260  TetR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 213 aa  54.7  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.122521  normal  0.297775 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4006  transcriptional regulator, TetR family  29.13 
 
 		 193 aa  54.3  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.685052  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1870  TetR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 200 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.524009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1961  TetR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 187 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.797544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3225  TetR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 213 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.314279  normal  0.210871 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>