More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1870 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



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Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_1870  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
200 aa  390  1e-108  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.524009  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4496  TetR family transcriptional regulator  84.5 
 
 
202 aa  333  1e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0468943  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1531  TetR family transcriptional regulator  75 
 
 
200 aa  283  9e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1561  TetR family transcriptional regulator  74.5 
 
 
200 aa  282  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.478798  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1585  TetR family transcriptional regulator  74.5 
 
 
200 aa  282  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13188  TetR family transcriptional regulator  69.7 
 
 
208 aa  246  2e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.166406 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4603  regulatory protein TetR  60.51 
 
 
211 aa  224  4e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204139  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1961  TetR family transcriptional regulator  42.47 
 
 
187 aa  139  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.797544  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4384  TetR family transcriptional regulator  40.53 
 
 
208 aa  125  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0492  TetR family transcriptional regulator  46.28 
 
 
193 aa  121  7e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.496213  normal  0.296626 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1821  TetR family transcriptional regulator  40.4 
 
 
199 aa  109  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.305938 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3270  transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 
199 aa  92  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3153  TetR family transcriptional regulator  38.22 
 
 
215 aa  91.7  7e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.755786  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4348  transcriptional regulator, TetR family  29.84 
 
 
198 aa  88.2  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20410  transcriptional regulator, tetR family  37.95 
 
 
222 aa  87.8  8e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.539092  normal  0.887832 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4515  transcriptional regulator, TetR family  31.94 
 
 
191 aa  86.7  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5564  transcriptional regulator, TetR family  35.22 
 
 
201 aa  85.9  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5615  TetR family transcriptional regulator  32.78 
 
 
200 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000827938  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5979  TetR family transcriptional regulator  32.78 
 
 
200 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000443748  hitchhiker  0.000881636 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1030  transcriptional regulator, TetR family  33.51 
 
 
204 aa  82.4  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.468417  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2700  TetR family transcriptional regulator  36.13 
 
 
200 aa  82.4  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2670  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 
214 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.545748  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2715  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 
214 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.180608  normal  0.0320009 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5233  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 
184 aa  79.3  0.00000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.494471  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5321  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 
184 aa  79.3  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.868815 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0061  transcriptional regulator, TetR family  34.87 
 
 
224 aa  79  0.00000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5613  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 
184 aa  78.6  0.00000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.687182  normal  0.405211 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7464  TetR family transcriptional regulator  32.42 
 
 
200 aa  78.2  0.00000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0288781  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3021  TetR family transcriptional regulator  37.43 
 
 
194 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49231  normal  0.167388 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3771  transcriptional regulator, TetR family  32.74 
 
 
223 aa  75.9  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1684  regulatory protein TetR  35.05 
 
 
211 aa  75.5  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.817144  normal  0.172233 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5089  putative transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 
210 aa  74.7  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3176  transcriptional regulator, TetR family  32.43 
 
 
193 aa  73.2  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00199059 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4073  putative transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 
208 aa  73.2  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.134392  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3006  TetR family transcriptional regulator  36.26 
 
 
194 aa  72.4  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313875  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2555  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
205 aa  72.4  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3052  TetR family transcriptional regulator  36.26 
 
 
194 aa  72.4  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5908  TetR family transcriptional regulator  31.53 
 
 
200 aa  72  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.889059 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2959  transcriptional regulator, TetR family  35.33 
 
 
200 aa  72  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2332  regulatory protein, TetR  31.67 
 
 
204 aa  72  0.000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000899921 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2574  TetR family transcriptional regulator  35.66 
 
 
213 aa  70.9  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2037  transcriptional regulator, TetR family  35.62 
 
 
234 aa  70.5  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3225  TetR family transcriptional regulator  38.01 
 
 
213 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.314279  normal  0.210871 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3111  transcriptional regulator, TetR family  33.67 
 
 
203 aa  69.7  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0884  TetR family transcriptional regulator  32.8 
 
 
237 aa  69.3  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.214434 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6035  transcriptional regulator, TetR family  33.67 
 
 
203 aa  68.9  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1370  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 
199 aa  68.9  0.00000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4993  transcriptional regulator, TetR family  30.89 
 
 
202 aa  68.6  0.00000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.309228 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7472  transcriptional regulator, TetR family  31.75 
 
 
228 aa  68.2  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3683  TetR family transcriptional regulator  36.59 
 
 
193 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.14289  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1467  hypothetical protein  39.62 
 
 
213 aa  67.8  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.165444  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1975  transcriptional regulator, TetR family  29.7 
 
 
199 aa  67.8  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382484  normal  0.828211 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3008  putative transcriptional regulator, TetR family  31.71 
 
 
203 aa  67.4  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2758  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 
231 aa  66.6  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1275  transcriptional regulator, TetR family  34.55 
 
 
214 aa  67  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0778  TetR family transcriptional regulator  32.42 
 
 
199 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.308556  normal  0.547023 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1616  transcriptional regulator, TetR family  36.14 
 
 
224 aa  67  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.86283 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4359  transcriptional regulator, TetR family  31.77 
 
 
205 aa  67  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14850  transcriptional regulator  37.25 
 
 
224 aa  66.2  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0364  TetR family transcriptional regulator  33.54 
 
 
209 aa  65.9  0.0000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0014  TetR family transcriptional regulator  33.54 
 
 
234 aa  65.9  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.730336  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4851  TetR family transcriptional regulator  32.91 
 
 
209 aa  65.9  0.0000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000188922 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1252  TetR family transcriptional regulator  32.52 
 
 
202 aa  65.5  0.0000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0581191  normal  0.11609 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0872  transcriptional regulator, TetR family  53.12 
 
 
212 aa  65.1  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.83423  normal  0.281851 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0893  regulatory protein TetR  51.47 
 
 
194 aa  65.1  0.0000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0706  TetR family transcriptional regulator  36.42 
 
 
383 aa  64.7  0.0000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0075  transcriptional regulator, TetR family  34.55 
 
 
194 aa  64.7  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4754  transcriptional regulator, TetR family  49.25 
 
 
216 aa  64.3  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00853884  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0602  transcriptional regulator, TetR family  28.8 
 
 
209 aa  63.2  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2727  TetR family transcriptional regulator  36.14 
 
 
192 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.109313 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3063  TetR family transcriptional regulator  27.65 
 
 
192 aa  62.8  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.857011  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4433  putative transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 
199 aa  63.2  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.304497  hitchhiker  0.00999637 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0278  transcriptional regulator, TetR family  32.5 
 
 
206 aa  62  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.72994  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3303  TetR family transcriptional regulator  27.65 
 
 
191 aa  62  0.000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.916403  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0326  Transcriptional regulator protein  31.29 
 
 
217 aa  62  0.000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4219  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 
202 aa  62  0.000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11588  regulatory protein  33.33 
 
 
202 aa  61.6  0.000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.8751e-36  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0011  transcriptional regulator, putative  22.62 
 
 
179 aa  61.2  0.000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2593  putative transcriptional regulator, TetR family  32.48 
 
 
205 aa  61.2  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0854341 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2623  TetR family transcriptional regulator  30.18 
 
 
209 aa  60.5  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0845142 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3148  TetR family transcriptional regulator  31.75 
 
 
231 aa  60.1  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.647957  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1528  transcriptional regulator, TetR family  28.87 
 
 
194 aa  60.1  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.680556  normal  0.906011 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3063  regulatory protein TetR  34.1 
 
 
191 aa  60.1  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4818  transcriptional regulator, TetR family  33.58 
 
 
208 aa  60.1  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.945526  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5008  TetR family transcriptional regulator  48.28 
 
 
201 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0873  transcriptional regulator, TetR family  44.09 
 
 
215 aa  59.7  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00991598  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7144  transcriptional regulator, TetR family  32.16 
 
 
188 aa  59.7  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.251131 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1705  TetR family transcriptional regulator  28.86 
 
 
203 aa  59.3  0.00000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.164694  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2677  transcriptional regulator, TetR family  35.94 
 
 
206 aa  59.3  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0882789  normal  0.108498 
 
 
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NC_013757  Gobs_1434  transcriptional regulator, TetR family  40.29 
 
 
185 aa  59.3  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_013510  Tcur_3528  transcriptional regulator, TetR family  35.8 
 
 
192 aa  58.9  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.069513  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4339  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 
207 aa  58.9  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00746452  normal 
 
 
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NC_008146  Mmcs_5207  TetR family transcriptional regulator  30.06 
 
 
216 aa  58.5  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5295  TetR family transcriptional regulator  30.06 
 
 
216 aa  58.5  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.334601  normal 
 
 
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NC_014210  Ndas_1929  transcriptional regulator, TetR family  48.65 
 
 
214 aa  58.5  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.609447 
 
 
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NC_009077  Mjls_5587  TetR family transcriptional regulator  30.06 
 
 
216 aa  58.5  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.214408 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3344  TetR family transcriptional regulator  29.85 
 
 
202 aa  58.5  0.00000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.685113 
 
 
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NC_012912  Dd1591_2281  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 
215 aa  58.5  0.00000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_008146  Mmcs_2948  TetR family transcriptional regulator  35.45 
 
 
191 aa  58.5  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_008705  Mkms_2992  TetR family transcriptional regulator  35.45 
 
 
191 aa  58.5  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.385096  normal  0.373192 
 
 
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