113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1705 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_1705  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 203 aa  410  1e-114  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.164694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1703  TetR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 199 aa  126  2.0000000000000002e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.188958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1427  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 204 aa  104  7e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.286714  hitchhiker  0.000126282 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0191  transcriptional regulator, TetR family  29.07 
 
 		 243 aa  72.8  0.000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00113557  decreased coverage  0.000257741 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0899  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 193 aa  65.1  0.0000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.494549  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1694  TetR family transcriptional regulator  24.21 
 
 		 219 aa  64.7  0.0000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0960426 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1697  hypothetical protein  24.39 
 
 		 199 aa  63.2  0.000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.280342 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0726  transcriptional regulator, TetR family  38.57 
 
 		 203 aa  62  0.000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1535  transcriptional regulator, TetR family  23.3 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1870  TetR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 200 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.524009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4496  TetR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 202 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0468943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2740  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 230 aa  54.7  0.0000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0291953  hitchhiker  0.000390237 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1567  TetR family transcriptional regulator  27 
 
 		 202 aa  54.3  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.246189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1502  transcriptional regulator, TetR family  23.58 
 
 		 195 aa  54.3  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.385487  normal  0.318035 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3893  transcriptional regulator, TetR family  26.19 
 
 		 194 aa  53.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0918047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1531  TetR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 200 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1656  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 196 aa  52  0.000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0515046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1141  TetR family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 218 aa  51.6  0.000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.864063  hitchhiker  0.000033846 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6348  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 400 aa  51.6  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00107036  hitchhiker  0.00103053 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1561  TetR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 200 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.478798  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1585  TetR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 200 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3850  TetR family transcriptional regulator  23.57 
 
 		 207 aa  50.4  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.349935 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 203 aa  50.1  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3441  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 215 aa  49.7  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0282  TetR family transcriptional regulator  23.33 
 
 		 201 aa  49.3  0.00003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.356366  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4359  transcriptional regulator, TetR family  26.4 
 
 		 205 aa  49.3  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5223  TetR family transcriptional regulator  23.03 
 
 		 197 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.325156 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2263  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 222 aa  47.4  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.632681  normal  0.89343 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1467  hypothetical protein  34.88 
 
 		 213 aa  47.4  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.165444  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4603  regulatory protein TetR  24.24 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204139  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14850  transcriptional regulator  30.99 
 
 		 224 aa  47.4  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1508  transcriptional regulator, TetR family  23.08 
 
 		 215 aa  47  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0994502  normal  0.123569 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0358  regulatory protein, TetR  23.36 
 
 		 240 aa  46.2  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000667156 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0884  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 237 aa  46.6  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.214434 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0981  TetR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 178 aa  46.2  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3431  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 189 aa  46.2  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3827  transcriptional regulator, TetR family  28.12 
 
 		 190 aa  46.6  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2689  TetR family transcriptional regulator  22.83 
 
 		 186 aa  45.8  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2746  regulatory protein TetR  22.83 
 
 		 186 aa  45.8  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1611  regulatory protein TetR  40.38 
 
 		 222 aa  45.8  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.993172  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0215  transcriptional regulator, TetR family  36.21 
 
 		 246 aa  46.2  0.0004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.674801 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0184  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 197 aa  45.4  0.0005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4404  TetR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 199 aa  45.4  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0114676  normal  0.191291 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3341  TetR family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 196 aa  45.4  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0092  transcriptional regulator, TetR family  32.05 
 
 		 207 aa  45.4  0.0006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00302716  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 190 aa  45.1  0.0007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6545  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 227 aa  45.1  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.129926 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5697  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 227 aa  44.7  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.949992  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  23.7 
 
 		 203 aa  45.1  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6061  TetR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 191 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.660328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3217  transcriptional regulator, TetR family  38.71 
 
 		 207 aa  44.7  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000141467  hitchhiker  0.00109998 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1248  AcrR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 199 aa  44.3  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6801  transcriptional regulator, TetR family  30.86 
 
 		 217 aa  43.9  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.142519  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6821  transcriptional regulator, TetR family  37.04 
 
 		 230 aa  44.3  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23170  transcriptional regulator, TetR family  28.69 
 
 		 206 aa  44.7  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.946487  normal  0.100375 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5555  putative transcriptional regulator, TetR family  27.11 
 
 		 260 aa  43.9  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.620464  normal  0.438645 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3885  TetR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 242 aa  43.5  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6105  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 201 aa  43.1  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.93473  normal  0.666323 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0045  transcriptional regulator  23.78 
 
 		 181 aa  43.5  0.002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0375278  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 324 aa  43.5  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4158  TetR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 205 aa  43.5  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.000188504  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3734  TetR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 202 aa  43.1  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0165853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4797  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 216 aa  43.5  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00913075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2881  transcriptional regulator, TetR family  30.93 
 
 		 367 aa  43.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02070  transcriptional regulator, tetR family  35.09 
 
 		 218 aa  43.5  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1718  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 228 aa  42.7  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.114077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3722  TetR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 202 aa  43.1  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.869277  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1114  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 186 aa  42.7  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.213128 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3795  TetR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 202 aa  43.1  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.796114  normal  0.124585 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3103  TetR family transcriptional regulator  51.52 
 
 		 207 aa  43.1  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.960941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3500  TetR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 191 aa  42.7  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00541119  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1553  TetR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 212 aa  42.7  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.260138 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5866  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 236 aa  43.1  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1381  transcriptional regulator, TetR family  25.79 
 
 		 184 aa  42.7  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.419771  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24200  transcriptional regulator, tetR family  26.32 
 
 		 204 aa  42.7  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.130166  normal  0.0410828 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0559  TetR family transcriptional regulator  25.99 
 
 		 451 aa  42.7  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.932394  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0571  TetR family transcriptional regulator  25.99 
 
 		 428 aa  42.4  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.108649  hitchhiker  0.00715519 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0549  TetR family transcriptional regulator  25.99 
 
 		 451 aa  42.7  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.166167  normal  0.823365 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2679  TetR family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 233 aa  42.7  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.196743  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0283  transcriptional regulator, TetR family  32.43 
 
 		 211 aa  42.7  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0292147 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2878  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 202 aa  42.4  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4723  TetR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 230 aa  42.4  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.72626  normal  0.852816 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0219  regulatory protein, TetR  32.43 
 
 		 211 aa  42.4  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3432  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 211 aa  42.4  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0339823  normal  0.853068 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3409  TetR family transcriptional regulator  23.72 
 
 		 212 aa  42.4  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 190 aa  42.4  0.005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3185  TetR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 208 aa  42.4  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 213 aa  42.4  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1603  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 213 aa  42.4  0.005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  30.14 
 
 		 207 aa  42  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2349  TetR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 357 aa  42  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00426882  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  22.07 
 
 		 195 aa  42  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1709  TetR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 224 aa  42  0.006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.400859  normal  0.0301663 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4773  regulatory protein TetR  29 
 
 		 184 aa  42  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.550217  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3736  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 200 aa  41.6  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.042499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0030  TetR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 196 aa  41.6  0.007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.100703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0566  transcription regulator protein  31.78 
 
 		 207 aa  41.6  0.007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.000000411686  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1848  transcriptional regulator, TetR family  26.37 
 
 		 190 aa  41.6  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00246548 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4304  TetR family transcriptional regulator  22.91 
 
 		 202 aa  41.6  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148025  normal  0.676238 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13188  TetR family transcriptional regulator  24.74 
 
 		 208 aa  41.6  0.008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.166406 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>