More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1703 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_1703  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 199 aa  412  1e-114  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.188958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1705  TetR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 203 aa  138  4.999999999999999e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.164694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1427  TetR family transcriptional regulator  33.84 
 
 		 204 aa  116  1.9999999999999998e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.286714  hitchhiker  0.000126282 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0191  transcriptional regulator, TetR family  26.8 
 
 		 243 aa  72.4  0.000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00113557  decreased coverage  0.000257741 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1697  hypothetical protein  43.66 
 
 		 199 aa  67  0.0000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.280342 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1656  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 196 aa  65.5  0.0000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0515046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0726  transcriptional regulator, TetR family  29.44 
 
 		 203 aa  64.7  0.0000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1535  transcriptional regulator, TetR family  35.9 
 
 		 204 aa  62  0.000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1694  TetR family transcriptional regulator  22.44 
 
 		 219 aa  58.5  0.00000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0960426 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1527  TetR family transcriptional regulator  25.3 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1502  transcriptional regulator, TetR family  26.42 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.385487  normal  0.318035 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0360  TetR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 193 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2740  TetR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 230 aa  55.1  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0291953  hitchhiker  0.000390237 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2353  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 217 aa  53.9  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.384863  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2545  TetR family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 217 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0577985  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2366  TetR family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 217 aa  53.9  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.711286  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2324  TetR family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 217 aa  53.9  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000190708  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2543  TetR family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 217 aa  53.9  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2508  transcriptional regulator, TetR family  25.49 
 
 		 217 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2510  TetR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 209 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00262483  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1090  transcriptional regulator, TetR family  22.22 
 
 		 204 aa  53.1  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.141216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1567  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 202 aa  53.1  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.246189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0880  transcriptional regulator, TetR family  34.33 
 
 		 212 aa  52.8  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.987052  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 211 aa  52.4  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 211 aa  52.4  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2055  putative transcriptional regulator, TetR family  24.66 
 
 		 229 aa  52.8  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2502  transcriptional regulator, TetR family  36.11 
 
 		 291 aa  52.4  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 211 aa  52.4  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4079  TetR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 244 aa  52.4  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.780842  normal  0.246764 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2815  transcriptional regulator, TetR family  24.84 
 
 		 217 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000266483 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  38.71 
 
 		 207 aa  52.4  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2094  transcriptional regulator, TetR family  30.61 
 
 		 186 aa  52.4  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000324065 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2500  transcriptional regulator, TetR family  38.81 
 
 		 211 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 211 aa  52.4  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  38.81 
 
 		 211 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3353  TetR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 195 aa  51.6  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0972  TetR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 233 aa  50.8  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.93446  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1398  transcriptional regulator, TetR family  27.03 
 
 		 195 aa  50.8  0.00001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1508  transcriptional regulator, TetR family  26.9 
 
 		 215 aa  51.2  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0994502  normal  0.123569 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2282  TetR family transcriptional regulator  24.84 
 
 		 217 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3998  transcriptional regulator, TetR family  34.69 
 
 		 205 aa  50.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0825494  normal  0.0160725 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1381  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 184 aa  50.4  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.419771  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  37.31 
 
 		 211 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24360  transcriptional regulator  34.85 
 
 		 211 aa  50.1  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0949  transcriptional regulator, TetR family  35.82 
 
 		 286 aa  49.7  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0750  transcriptional regulator, TetR family  31.91 
 
 		 236 aa  49.7  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0322855 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0899  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 193 aa  49.7  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.494549  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 324 aa  49.7  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2557  transcriptional regulator, TetR family  24.18 
 
 		 217 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.15322e-23 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3979  transcriptional regulator, TetR family  28.19 
 
 		 222 aa  48.9  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.318215  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03730  transcriptional regulator, TetR family  25.93 
 
 		 215 aa  49.3  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2285  TetR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 211 aa  48.9  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0118465  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4211  transcriptional regulator, TetR family  38.33 
 
 		 178 aa  48.5  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.954356 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2332  regulatory protein, TetR  25.79 
 
 		 204 aa  48.1  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000899921 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1150  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 222 aa  48.1  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1201  transcription regulator protein  26.29 
 
 		 209 aa  48.1  0.00008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal  0.871194 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  31.2 
 
 		 194 aa  48.1  0.00008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1173  regulatory protein, TetR  30.26 
 
 		 202 aa  48.1  0.00008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.959952 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5358  transcriptional regulator, TetR family  26.47 
 
 		 196 aa  48.1  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25838  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1323  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 207 aa  48.1  0.00008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3775  transcriptional regulator, TetR family  23.03 
 
 		 224 aa  48.1  0.00008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4522  transcriptional regulator, TetR family  32.89 
 
 		 191 aa  48.1  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.828993  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4364  TetR family transcriptional regulator  25.19 
 
 		 206 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1290  AcrR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 199 aa  47.8  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 193 aa  47.8  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 213 aa  47.8  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3299  transcriptional regulator, TetR family  30.65 
 
 		 201 aa  47.4  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000002111  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3004  transcriptional regulator, TetR family  35.59 
 
 		 186 aa  47.4  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.519568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1526  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 189 aa  47.4  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000234923  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5045  TetR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 206 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.906168  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6328  transcriptional regulator, TetR family  30.99 
 
 		 199 aa  47.8  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00138827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  30.14 
 
 		 213 aa  47.8  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5815  TetR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 206 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3965  transcriptional regulator, TetR family  27.34 
 
 		 208 aa  47.4  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1848  transcriptional regulator, TetR family  33.82 
 
 		 190 aa  47.8  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00246548 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3998  transcriptional regulator, TetR family  34.57 
 
 		 245 aa  47.8  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000456955  normal  0.178314 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2134  TetR family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 205 aa  47.8  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.269562  normal  0.11419 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3721  transcriptional regulator, TetR family  26.96 
 
 		 260 aa  47.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249433  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2371  transcriptional regulator, TetR family  33.82 
 
 		 190 aa  47  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0185343  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2698  TetR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 203 aa  47  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0091  HTH-type transcriptional regulator, TetR family  29.51 
 
 		 199 aa  47  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.903201  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2349  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 357 aa  47  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00426882  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  27.54 
 
 		 307 aa  46.6  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6228  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 194 aa  47  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.301912  normal  0.923303 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0810  transcriptional regulator  30.34 
 
 		 206 aa  47  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.490663  normal  0.19914 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0184  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 335 aa  46.6  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000505732  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3431  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 189 aa  47  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3088  transcriptional regulator of TetR family protein  23.9 
 
 		 198 aa  46.6  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.119848 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  24.38 
 
 		 190 aa  46.2  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 224 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3641  TetR family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 200 aa  46.2  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.798229 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0808  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 191 aa  46.2  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0884  TetR family transcriptional regulator  24.05 
 
 		 237 aa  46.2  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.214434 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2786  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 190 aa  46.2  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.06199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3815  regulatory protein, TetR  29.2 
 
 		 252 aa  46.6  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00651597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 224 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 224 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 224 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0696  TetR family transcriptional regulator  23.13 
 
 		 194 aa  45.8  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0503  TetR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 376 aa  45.8  0.0004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>