More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0191 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0191  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 243 aa  509  1e-143  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00113557  decreased coverage  0.000257741 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2740  TetR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 230 aa  206  2e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0291953  hitchhiker  0.000390237 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1694  TetR family transcriptional regulator  44.13 
 
 		 219 aa  201  9e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0960426 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0726  transcriptional regulator, TetR family  38.31 
 
 		 203 aa  135  5e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1697  hypothetical protein  28.72 
 
 		 199 aa  96.7  3e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.280342 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1567  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 202 aa  91.3  1e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.246189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0899  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 193 aa  86.7  3e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.494549  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1535  transcriptional regulator, TetR family  23.56 
 
 		 204 aa  83.6  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3149  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 205 aa  75.5  0.0000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1502  transcriptional regulator, TetR family  39.18 
 
 		 195 aa  73.2  0.000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.385487  normal  0.318035 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1705  TetR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 203 aa  72.8  0.000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.164694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 203 aa  72.4  0.000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4304  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 202 aa  70.9  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148025  normal  0.676238 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1656  TetR family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 196 aa  67.8  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0515046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0571  TetR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 200 aa  64.7  0.000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.530829  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1496  transcriptional regulator, TetR family  37.08 
 
 		 206 aa  64.7  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1636  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 200 aa  63.2  0.000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0265  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 200 aa  62.8  0.000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00630944 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1703  TetR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 199 aa  62.4  0.000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.188958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1427  TetR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 204 aa  62.4  0.000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.286714  hitchhiker  0.000126282 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4079  TetR family transcriptional regulator  26.38 
 
 		 244 aa  62  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.780842  normal  0.246764 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1571  TetR family transcriptional regulator  24 
 
 		 207 aa  60.5  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3815  regulatory protein, TetR  47.17 
 
 		 252 aa  60.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00651597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17710  transcriptional regulator  24.24 
 
 		 203 aa  60.5  0.00000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0632938  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 203 aa  59.7  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3170  TetR family transcriptional regulator  26.38 
 
 		 202 aa  59.3  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.148676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2742  transcriptional regulator, TetR family  24.31 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 256 aa  58.5  0.00000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  34.52 
 
 		 251 aa  58.5  0.00000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3836  TetR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 246 aa  58.2  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.487675  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2113  transcriptional regulator, TetR family  33.72 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.918403  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05720  transcriptional regulator  27.49 
 
 		 221 aa  57.4  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.203838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1100  TetR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0085  TetR family transcriptional regulator  26.01 
 
 		 195 aa  57  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.0016021  decreased coverage  0.0000722764 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 211 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0257  TetR family transcriptional regulator  24.84 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.837987 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3721  transcriptional regulator, TetR family  43.4 
 
 		 260 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249433  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4496  TetR family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 202 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0468943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1281  TetR family transcriptional regulator  24.63 
 
 		 210 aa  57  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.781108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26800  transcriptional regulator  25.33 
 
 		 184 aa  56.6  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.463482  normal  0.288316 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1531  TetR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1313  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28930  transcriptional regulator  25.27 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.218384 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3149  TetR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 233 aa  56.2  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2634  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.001775  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2977  transcriptional regulator, TetR family  26.71 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  25.15 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 224 aa  55.1  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2972  TetR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 216 aa  54.7  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.419953  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2545  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 217 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0577985  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2995  TetR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 211 aa  55.1  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.428403  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2508  transcriptional regulator, TetR family  37.31 
 
 		 217 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  26.59 
 
 		 218 aa  54.7  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3130  TetR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 216 aa  55.1  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1391  transcriptional regulator, TetR family  28.21 
 
 		 208 aa  55.1  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2815  transcriptional regulator, TetR family  37.31 
 
 		 217 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000266483 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1247  TetR family transcriptional regulator  20.9 
 
 		 206 aa  55.1  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0167  transcriptional regulator, TetR family  36.11 
 
 		 200 aa  54.7  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1843  transcriptional regulatory protein  24.85 
 
 		 201 aa  55.1  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.677238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 223 aa  54.7  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 211 aa  54.7  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1870  TetR family transcriptional regulator  25.99 
 
 		 200 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.524009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2986  TetR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 216 aa  55.1  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.741715  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3108  TetR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 235 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.90259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27500  transcriptional regulator  24.55 
 
 		 214 aa  54.3  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2282  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 217 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 217 aa  54.3  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2557  transcriptional regulator, TetR family  37.31 
 
 		 217 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.15322e-23 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1561  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 200 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.478798  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3088  TetR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 235 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.215093  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1317  TetR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 206 aa  53.9  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.237455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05370  transcriptional regulator, TetR family  42 
 
 		 205 aa  53.9  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000643211  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1297  TetR family transcriptional regulator  20.9 
 
 		 206 aa  54.3  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00583227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0455  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 224 aa  53.9  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  0.106872 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1585  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 200 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3148  TetR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 235 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.435592 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3449  TetR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 209 aa  54.3  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1933  AcrR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 243 aa  53.9  0.000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.189914  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2353  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 217 aa  53.9  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.384863  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1817  TetR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 195 aa  53.5  0.000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1550  transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 		 209 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.702649  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 222 aa  53.5  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1936  transcriptional regulator, TetR family  34.72 
 
 		 193 aa  53.1  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6173  transcriptional regulator, TetR family  32.05 
 
 		 202 aa  53.5  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2737  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 220 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4006  transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 		 202 aa  53.9  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2600  transcriptional regulator, TetR family  35.82 
 
 		 217 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2260  TetR family transcriptional regulator  22.94 
 
 		 214 aa  53.5  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0561114  normal  0.813784 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1596  hypothetical protein  40.32 
 
 		 205 aa  53.5  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0318645  normal  0.570188 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4891  transcriptional regulator, TetR family  26.83 
 
 		 261 aa  53.5  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.164408  normal  0.287477 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2636  transcriptional regulator, TetR family  29.34 
 
 		 198 aa  53.5  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0370  TetR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 223 aa  53.5  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0234884  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3111  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 210 aa  53.5  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3096  TetR family transcriptional regulator  51.02 
 
 		 202 aa  53.1  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0203472  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4061  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 240 aa  53.1  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  37.21 
 
 		 211 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>