More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1427 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_1427  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 204 aa  414  9.999999999999999e-116  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.286714  hitchhiker  0.000126282 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1705  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 203 aa  104  7e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.164694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1703  TetR family transcriptional regulator  33.84 
 
 		 199 aa  100  2e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.188958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0899  TetR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 193 aa  68.6  0.00000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.494549  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1656  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 196 aa  65.9  0.0000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0515046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0466  TetR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 189 aa  62.4  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0191  transcriptional regulator, TetR family  45.9 
 
 		 243 aa  62.4  0.000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00113557  decreased coverage  0.000257741 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1694  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 219 aa  62.4  0.000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0960426 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1535  transcriptional regulator, TetR family  46.97 
 
 		 204 aa  59.7  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0726  transcriptional regulator, TetR family  31.43 
 
 		 203 aa  58.9  0.00000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19890  transcriptional regulator  24.85 
 
 		 346 aa  58.5  0.00000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.403358  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2740  TetR family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 230 aa  58.5  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0291953  hitchhiker  0.000390237 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1697  hypothetical protein  38.89 
 
 		 199 aa  56.2  0.0000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.280342 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0059  transcriptional regulator, TetR family  24.28 
 
 		 194 aa  55.5  0.0000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00007304  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1567  TetR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 202 aa  54.3  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.246189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19820  transcriptional regulator  25.9 
 
 		 260 aa  54.3  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1508  transcriptional regulator, TetR family  25.13 
 
 		 215 aa  54.3  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0994502  normal  0.123569 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0301  transcriptional regulator, TetR family  25.61 
 
 		 199 aa  52.8  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0864199  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1502  transcriptional regulator, TetR family  23.53 
 
 		 195 aa  52.8  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.385487  normal  0.318035 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3330  TetR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 225 aa  53.1  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.648103  normal  0.907597 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  25.61 
 
 		 203 aa  52  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3277  TetR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 275 aa  52.4  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26580  transcriptional regulator, TetR family  26.28 
 
 		 205 aa  52.4  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0994293 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3796  TetR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 275 aa  52  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.323175 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30540  transcriptional regulator, TetR family  28.83 
 
 		 195 aa  51.6  0.000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 213 aa  51.6  0.000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4061  TetR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 240 aa  50.8  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1515  putative transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 219 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254086  hitchhiker  0.00363064 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1778  TetR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 199 aa  50.4  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0789135  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 256 aa  49.7  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2260  regulatory protein TetR  38.89 
 
 		 199 aa  49.3  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.535255  normal  0.350629 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2425  TetR family transcriptional regulator  24.74 
 
 		 204 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.520855  normal  0.599881 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31350  hypothetical protein  23.49 
 
 		 203 aa  48.5  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.112877  normal  0.357558 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4298  TetR family transcriptional regulator  24.51 
 
 		 197 aa  48.5  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1958  TetR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 251 aa  48.5  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.455038  normal  0.501183 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6231  transcriptional regulator, TetR family  34.33 
 
 		 197 aa  48.5  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 324 aa  48.5  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1469  transcriptional regulator, TetR family  36.62 
 
 		 197 aa  48.5  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5095  transcriptional regulator, TetR family  37.04 
 
 		 200 aa  48.1  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.666558  normal  0.638711 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1603  transcriptional regulator, TetR family  27.08 
 
 		 213 aa  48.1  0.00009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1720  TetR family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 200 aa  48.1  0.00009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0262  transcriptional regulator, TetR family  25.4 
 
 		 199 aa  48.1  0.00009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.670528 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4304  TetR family transcriptional regulator  22.09 
 
 		 202 aa  48.1  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148025  normal  0.676238 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5488  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 238 aa  47.8  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3888  transcriptional regulator, TetR family  34.29 
 
 		 206 aa  47.4  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.693202 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0136  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 243 aa  47.8  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.30147  normal  0.0856805 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0684  TetR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 213 aa  47.4  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.974708 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3836  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 246 aa  47.8  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.487675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06539  hypothetical protein  25.41 
 
 		 218 aa  48.1  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3771  transcriptional regulator, TetR family  26.21 
 
 		 223 aa  48.1  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1012  transcriptional regulator, TetR family  29.35 
 
 		 212 aa  47.4  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.156612  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3720  transcriptional regulator, TetR family  26.01 
 
 		 200 aa  47.8  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.91394  normal  0.0177543 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0930  transcriptional regulator, TetR family  35.82 
 
 		 194 aa  47.4  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1985  transcriptional regulator, TetR family  29.84 
 
 		 206 aa  47.8  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1516  transcriptional regulator, TetR family  41.27 
 
 		 203 aa  47.4  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1478  TetR family transcriptional regulator  25.88 
 
 		 217 aa  47.8  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 206 aa  47.8  0.0001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0153  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 210 aa  47  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1436  TetR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 125 aa  46.6  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000772402  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0162  transcription regulator protein  38.18 
 
 		 233 aa  47.4  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.1146  normal  0.445023 
 
 
-
 
NC_003296  RS01891  transcription regulator protein  26.42 
 
 		 219 aa  47  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0139537  normal  0.638618 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0604  TetR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 205 aa  46.6  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229279 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1164  TetR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 184 aa  47  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000872016  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 193 aa  46.6  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3046  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  30.43 
 
 		 216 aa  47.4  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.303422  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 231 aa  47  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3575  TetR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 200 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4681  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 283 aa  47  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.433841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4429  TetR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 192 aa  47.4  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.247191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3149  TetR family transcriptional regulator  24.31 
 
 		 205 aa  47.4  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3932  putative transcriptional regulator, TetR family  42.31 
 
 		 228 aa  47.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199219  normal  0.0173794 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001979  transcriptional regulator TetR family  28.4 
 
 		 193 aa  46.6  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.507988  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7073  transcriptional regulator, TetR family  41.38 
 
 		 248 aa  47  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.672487  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4043  transcriptional regulator, TetR family  26.9 
 
 		 222 aa  47  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0265  TetR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 194 aa  46.6  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.250901  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1071  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  27.17 
 
 		 213 aa  47  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0117133  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4158  TetR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 205 aa  47  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.000188504  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5083  regulatory protein TetR  33.64 
 
 		 184 aa  47  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.749425  normal  0.163121 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5345  TetR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 198 aa  47.4  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.922777  normal  0.179588 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05370  transcriptional regulator, TetR family  32.2 
 
 		 205 aa  47  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000643211  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0944  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  30.43 
 
 		 217 aa  47  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0030  TetR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 193 aa  46.6  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.19641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0543  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 203 aa  46.2  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.889127 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1173  TetR family transcriptional regulator  21.59 
 
 		 189 aa  46.2  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0184  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 335 aa  46.6  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000505732  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3313  transcriptional regulator, TetR family  28.32 
 
 		 209 aa  46.2  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0137945 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22630  transcriptional regulator  32.65 
 
 		 202 aa  46.6  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2233  TetR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 187 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.749736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3637  TetR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 207 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.262942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2679  TetR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 233 aa  46.6  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.196743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0119  TetR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 201 aa  46.2  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.00000000566826  decreased coverage  0.00000000000241144 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1244  TetR family transcriptional regulator  25.61 
 
 		 206 aa  46.2  0.0003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2366  TetR family transcriptional regulator  21.26 
 
 		 217 aa  45.8  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.711286  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4378  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 200 aa  45.8  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2543  TetR family transcriptional regulator  21.26 
 
 		 217 aa  45.8  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2248  TetR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 222 aa  45.8  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0660336  normal  0.0152181 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3632  TetR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 207 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1586  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 197 aa  46.2  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.66794  normal  0.155541 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3489  transcriptional regulator, TetR family  24.12 
 
 		 200 aa  45.8  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0571  TetR family transcriptional regulator  23.12 
 
 		 200 aa  45.8  0.0004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.530829  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>