More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_1526 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013522  Taci_1526  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 189 aa  372  1e-102  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000234923  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3413  transcriptional regulator, TetR family  43.75 
 
 		 246 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1794  TetR family transcriptional regulator  23.93 
 
 		 218 aa  64.3  0.0000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 190 aa  63.2  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 196 aa  62  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2592  transcriptional regulator, TetR family  36.23 
 
 		 205 aa  61.6  0.000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000712719  hitchhiker  0.00165626 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1697  hypothetical protein  50.94 
 
 		 199 aa  60.8  0.00000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.280342 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2948  TetR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 191 aa  60.1  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0455  TetR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 224 aa  60.1  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  0.106872 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2755  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1941  transcriptional regulator, TetR family  48.28 
 
 		 189 aa  60.1  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.842083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1955  transcriptional regulator, TetR family  50.75 
 
 		 202 aa  59.3  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4543  putative transcriptional regulator, TetR family  49.09 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0569885  normal  0.220748 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1936  transcriptional regulator, TetR family  43.55 
 
 		 193 aa  58.9  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 190 aa  58.9  0.00000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0361  TetR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.23201  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  30.7 
 
 		 221 aa  57  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3096  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0203472  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1515  putative transcriptional regulator, TetR family  37.33 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254086  hitchhiker  0.00363064 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1535  transcriptional regulator, TetR family  23.88 
 
 		 204 aa  57.4  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1805  transcriptional regulator UidR  40.85 
 
 		 196 aa  57  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.947665  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01587  DNA-binding transcriptional repressor  37.8 
 
 		 196 aa  57  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2024  transcriptional regulator, TetR family  37.8 
 
 		 192 aa  57  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.180766  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1826  transcriptional regulator UidR  40.85 
 
 		 196 aa  57  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4587  transcriptional regulator, TetR family  41.82 
 
 		 199 aa  57  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.358268  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6562  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.67895  normal  0.0476005 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2330  transcriptional regulator UidR  37.8 
 
 		 195 aa  57  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0955  TetR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1581  transcriptional regulator UidR  37.8 
 
 		 192 aa  57  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2294  TetR family regulatory protein  28.47 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1693  transcriptional regulator UidR  37.8 
 
 		 196 aa  57  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  27.06 
 
 		 213 aa  56.6  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1979  TetR family transcriptional regulator  39.77 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24090  transcriptional regulator  43.33 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01577  hypothetical protein  37.8 
 
 		 196 aa  57  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.98021  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3711  TetR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 420 aa  56.6  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0336995  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2796  TetR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 231 aa  56.6  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.252593 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1128  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  26.46 
 
 		 227 aa  57  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000181094 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2102  TetR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.526616  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2161  TetR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.720901  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2012  TetR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 196 aa  57  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.952906  normal  0.615913 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  34.38 
 
 		 194 aa  56.2  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5710  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.572132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4222  TetR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.42669  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4288  TetR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.458199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4600  TetR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0411306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  32.95 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5693  transcriptional regulator, TetR family  34.58 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0563608  normal  0.866587 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3482  TetR family transcriptional regulator  50.94 
 
 		 248 aa  55.8  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0660414  normal  0.032442 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3352  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6189  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304814  normal  0.805788 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1381  transcriptional regulator, TetR family  43.55 
 
 		 184 aa  55.5  0.0000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.419771  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2067  TetR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 216 aa  55.5  0.0000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28270  transcriptional regulator  31.03 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.188874 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1569  putative transcriptional regulator  40 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18080  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6768  transcriptional regulator, TetR family  43.08 
 
 		 221 aa  55.1  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1428  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 204 aa  54.7  0.0000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.530378  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0919  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 215 aa  54.7  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3219  transcriptional regulator, TetR family  35.86 
 
 		 215 aa  54.7  0.0000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  43.86 
 
 		 237 aa  54.7  0.0000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1204  transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 		 206 aa  54.3  0.0000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260768  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3140  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 212 aa  54.3  0.0000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 213 aa  53.9  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3312  transcriptional regulator UidR  35.62 
 
 		 198 aa  53.9  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0828  TetR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 225 aa  53.9  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1594  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 210 aa  53.9  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000148614  unclonable  0.000000209189 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3407  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 218 aa  53.9  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0155576  normal  0.84746 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4359  regulatory protein, TetR  34.95 
 
 		 196 aa  53.9  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00193568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2636  transcriptional regulator, TetR family  26.09 
 
 		 198 aa  53.9  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1811  TetR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 209 aa  54.3  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2996  TetR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 237 aa  53.9  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1473  TetR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 195 aa  54.3  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 206 aa  54.3  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6328  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 199 aa  53.9  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00138827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0652  Transcriptional regulator protein  41.1 
 
 		 196 aa  53.1  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  41.98 
 
 		 226 aa  53.1  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 206 aa  53.1  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3038  transcriptional regulator  32.73 
 
 		 230 aa  53.1  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0114  transcriptional regulator, TetR family  34.88 
 
 		 197 aa  53.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.13405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6341  TetR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 206 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0497044  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1751  TetR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 206 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0034  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 189 aa  53.1  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.345685  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0034  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 189 aa  53.1  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0064  TetR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 210 aa  53.1  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 234 aa  53.5  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47520  putative transcriptional regulator  40.3 
 
 		 197 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1738  TetR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 206 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 206 aa  53.5  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1287  regulatory protein, TetR  48.21 
 
 		 234 aa  53.1  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3004  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 186 aa  53.5  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.519568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 224 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0390  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 230 aa  53.1  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3742  transcriptional regulator, TetR family  34.38 
 
 		 192 aa  53.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3376  TetR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 197 aa  53.1  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.423093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1218  TetR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 206 aa  52.8  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3714  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 212 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0050  TetR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 210 aa  52.8  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0730  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 214 aa  52.8  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5390  transcriptional regulator, TetR family  44 
 
 		 291 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.787919  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>