More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_3299 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 307 aa  627  1e-178  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  51.63 
 
 		 310 aa  337  9.999999999999999e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2502  transcriptional regulator, TetR family  35.19 
 
 		 291 aa  180  2e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0949  transcriptional regulator, TetR family  36.82 
 
 		 286 aa  168  1e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5567  TetR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 290 aa  150  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5615  transcriptional regulator, TetR family  35.06 
 
 		 291 aa  150  3e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5288  TetR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 290 aa  149  5e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5130  TetR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 290 aa  149  5e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5685  TetR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 290 aa  149  5e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5529  transcriptional regulator, TetR family  35.06 
 
 		 290 aa  149  5e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5559  transcriptional regulator, TetR family  34.69 
 
 		 289 aa  149  7e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5113  TetR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 290 aa  149  7e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3952  TetR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 291 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5228  TetR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 290 aa  147  3e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5390  transcriptional regulator, TetR family  33.95 
 
 		 291 aa  145  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.787919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0750  transcriptional regulator, TetR family  41.27 
 
 		 236 aa  68.2  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0322855 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2765  regulatory protein, TetR  33.01 
 
 		 210 aa  67  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267077  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2155  TetR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 195 aa  66.2  0.0000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  45.16 
 
 		 223 aa  65.9  0.0000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3170  transcriptional regulator, TetR family  48.44 
 
 		 216 aa  65.1  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0564  transcriptional regulator, TetR family  34.23 
 
 		 203 aa  65.5  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1380  transcriptional regulator, TetR family  47.54 
 
 		 214 aa  64.7  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000685689  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0971  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 200 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.325702 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 217 aa  63.9  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 222 aa  63.9  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2426  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 205 aa  63.9  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1473  TetR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 195 aa  63.9  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1933  AcrR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 243 aa  63.9  0.000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.189914  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1372  transcriptional regulator, TetR family  30.25 
 
 		 210 aa  63.2  0.000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.487007  n/a   
 
 
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NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  32.76 
 
 		 221 aa  63.5  0.000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  32.76 
 
 		 206 aa  63.2  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  33.04 
 
 		 237 aa  62.8  0.000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4734  TetR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 242 aa  62.4  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1751  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 206 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0231  transcriptional regulator, TetR family  40.58 
 
 		 200 aa  62.4  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.336394 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1719  transcriptional regulator, TetR family  38.96 
 
 		 196 aa  61.6  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6341  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 206 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0497044  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2734  transcriptional regulator, TetR family  39.29 
 
 		 225 aa  62  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  31.2 
 
 		 207 aa  62.4  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1738  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 206 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3524  TetR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 187 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 212 aa  62.4  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0067  TetR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 212 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000826521  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2755  TetR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 200 aa  61.2  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6268  TetR family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 182 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.700387  normal  0.409486 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 212 aa  61.2  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
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NC_013411  GYMC61_1804  transcriptional regulator, TetR family  47.17 
 
 		 189 aa  61.2  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_009972  Haur_0972  TetR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 233 aa  60.8  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.93446  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0919  TetR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3910  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 242 aa  61.2  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.104674 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35210  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 196 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3689  TetR family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 213 aa  60.8  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  39.44 
 
 		 220 aa  61.2  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2800  TetR family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 224 aa  60.8  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.697977  decreased coverage  0.000162176 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  53.7 
 
 		 212 aa  61.2  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2692  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 195 aa  61.6  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.728372  normal  1 
 
 
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NC_011831  Cagg_0421  transcriptional regulator, TetR family  26.73 
 
 		 198 aa  61.2  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4729  TetR family transcriptional regulator  50.94 
 
 		 240 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 291 aa  60.8  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1381  transcriptional regulator, TetR family  41.94 
 
 		 184 aa  60.8  0.00000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.419771  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9073  putative transcriptional regulator, TetR family  32.4 
 
 		 193 aa  60.8  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0312  TetR family transcriptional regulator  51.79 
 
 		 182 aa  60.1  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2248  TetR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 222 aa  60.5  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0660336  normal  0.0152181 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1965  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0526053  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0130  TetR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  45.71 
 
 		 194 aa  60.1  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2482  transcriptional regulator, TetR family  29.32 
 
 		 196 aa  60.1  0.00000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007958  RPD_0043  regulatory protein, TetR  44.26 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0068  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 185 aa  60.1  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.139926 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 224 aa  60.1  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0030  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 193 aa  60.1  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.19641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 224 aa  60.1  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  33.71 
 
 		 204 aa  60.1  0.00000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 224 aa  60.1  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2970  putative transcriptional regulator  37.33 
 
 		 196 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0889426  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 332 aa  59.7  0.00000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0110  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 225 aa  59.7  0.00000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3299  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 201 aa  59.7  0.00000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000002111  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3750  TetR family transcriptional regulator  50.94 
 
 		 230 aa  59.7  0.00000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0293  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 230 aa  59.7  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 224 aa  59.7  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0403  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.101074  normal  0.152412 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1372  TetR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027491 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1778  transcriptional regulator, TetR family  50.94 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  46 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  46 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  42.59 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  46 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1986  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 218 aa  59.3  0.00000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0191052  n/a   
 
 
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NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  46 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
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NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  46 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
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NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  50.94 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012791  Vapar_3938  transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 231 aa  59.3  0.00000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00284915  n/a   
 
 
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NC_011883  Ddes_1550  transcriptional regulator, TetR family  40.32 
 
 		 201 aa  58.9  0.00000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011773  BCAH820_2500  transcriptional regulator, TetR family  46 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_010681  Bphyt_2291  transcriptional regulator, TetR family  34.02 
 
 		 205 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.857741  normal  1 
 
 
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NC_008148  Rxyl_2996  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 237 aa  58.5  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012793  GWCH70_0868  transcriptional regulator, TetR family  29.7 
 
 		 222 aa  58.5  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000486929  n/a   
 
 
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NC_013093  Amir_4395  transcriptional regulator, TetR family  43.55 
 
 		 196 aa  58.9  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.724029  n/a   
 
 
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