More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_3299 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_3299  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 201 aa  394  1e-109  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000002111  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  40.32 
 
 		 310 aa  62  0.000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1697  hypothetical protein  37.18 
 
 		 199 aa  60.1  0.00000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.280342 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5567  TetR family transcriptional regulator  43.37 
 
 		 290 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5288  TetR family transcriptional regulator  43.37 
 
 		 290 aa  60.5  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5113  TetR family transcriptional regulator  43.37 
 
 		 290 aa  60.5  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5130  TetR family transcriptional regulator  43.37 
 
 		 290 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5529  transcriptional regulator, TetR family  43.37 
 
 		 290 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5685  TetR family transcriptional regulator  43.37 
 
 		 290 aa  60.5  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5615  transcriptional regulator, TetR family  43.37 
 
 		 291 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 307 aa  59.3  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0177  TetR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 190 aa  59.3  0.00000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0507  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.982351 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5228  TetR family transcriptional regulator  42.17 
 
 		 290 aa  58.2  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5559  transcriptional regulator, TetR family  42.17 
 
 		 289 aa  58.2  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3952  TetR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 291 aa  58.2  0.00000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5390  transcriptional regulator, TetR family  42.17 
 
 		 291 aa  58.2  0.00000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.787919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2499  transcriptional regulator, TetR family  40.51 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3991  regulatory protein TetR  32.38 
 
 		 197 aa  55.8  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1218  TetR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 206 aa  55.5  0.0000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2502  transcriptional regulator, TetR family  28.67 
 
 		 291 aa  55.1  0.0000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0750  transcriptional regulator, TetR family  45.28 
 
 		 236 aa  54.7  0.0000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0322855 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3540  TetR family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 250 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2358  transcriptional regulator, TetR family  31.13 
 
 		 216 aa  54.7  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0281012 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2740  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 230 aa  54.7  0.0000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0291953  hitchhiker  0.000390237 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  41.56 
 
 		 207 aa  53.9  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0056  transcriptional regulator, TetR family  36.78 
 
 		 198 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1600  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 288 aa  53.9  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4596  TetR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 204 aa  54.3  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0949  transcriptional regulator, TetR family  43.86 
 
 		 286 aa  54.3  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8100  transcriptional regulator, TetR family  28.44 
 
 		 218 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.978856  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19820  transcriptional regulator  30.77 
 
 		 260 aa  54.3  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1965  TetR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 206 aa  53.5  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0526053  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2510  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 209 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00262483  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0503  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 376 aa  53.1  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4242  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 200 aa  53.5  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2558  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 190 aa  53.9  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6485  regulatory protein, TetR  25 
 
 		 278 aa  53.5  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.521213  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4216  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 215 aa  53.5  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0612  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 202 aa  53.9  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136679  normal  0.487596 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1924  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 210 aa  53.1  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.343626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0358  regulatory protein, TetR  34.43 
 
 		 240 aa  53.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000667156 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5732  TetR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 228 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5353  TetR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 228 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1028  transcriptional regulator, TetR family  28.1 
 
 		 200 aa  53.1  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0479484  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5442  TetR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 228 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.385516 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0170  TetR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 192 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.652591  normal  0.659974 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4792  TetR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 184 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.165855  normal  0.419651 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3554  transcriptional regulator, TetR family  36.17 
 
 		 219 aa  53.1  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.725934  normal  0.0606309 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5636  transcriptional regulator, TetR family  34.72 
 
 		 202 aa  52.8  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.500793 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3533  TetR family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 237 aa  53.1  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0909277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2800  TetR family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 224 aa  52.8  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.697977  decreased coverage  0.000162176 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2883  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 211 aa  52.8  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13590  TetR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 200 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.332381  normal  0.0844747 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2636  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 198 aa  53.1  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4378  transcriptional regulator, TetR family  32.58 
 
 		 200 aa  52.8  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 211 aa  52.4  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0268  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 202 aa  52.4  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.329049 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0227  transcriptional regulator, TetR family  35.82 
 
 		 247 aa  52.8  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.543112  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3953  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 232 aa  52.4  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396138  normal  0.024229 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1372  transcriptional regulator, TetR family  26.95 
 
 		 210 aa  52.8  0.000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.487007  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2367  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 202 aa  52.4  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.445055  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0231  transcriptional regulator, TetR family  38.6 
 
 		 200 aa  52.4  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.336394 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2332  transcriptional regulator, TetR family  38.64 
 
 		 193 aa  52.4  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.950158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 291 aa  52.4  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 211 aa  52  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 211 aa  52  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 211 aa  52  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2500  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 211 aa  52  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0432  TetR family transcriptional regulator  24.81 
 
 		 237 aa  52  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 211 aa  52  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0172  TetR family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 208 aa  52  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1118  transcriptional regulator, TetR family  47.06 
 
 		 201 aa  52  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00548751  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2815  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 242 aa  52  0.000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.623336 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2312  transcriptional regulator, TetR family  43.86 
 
 		 196 aa  51.6  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000153851  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2229  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 196 aa  52  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00028806  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2601  regulatory protein, TetR  28.68 
 
 		 224 aa  51.6  0.000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.354794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1468  transcriptional regulator, TetR family  42.37 
 
 		 190 aa  51.6  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1986  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 196 aa  51.6  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000218655  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1968  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 196 aa  51.6  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0105465  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 211 aa  52  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1535  transcriptional regulator, TetR family  39.29 
 
 		 204 aa  52  0.000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2004  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 196 aa  51.6  0.000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00390576  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1844  transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 		 214 aa  51.6  0.000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2014  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 196 aa  51.6  0.000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0449612  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2169  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 196 aa  51.6  0.000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000817381  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1582  transcriptional regulator, TetR family  36.62 
 
 		 194 aa  51.6  0.000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000313158  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3090  TetR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 218 aa  51.6  0.000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.595832  hitchhiker  0.000923351 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4802  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 199 aa  51.6  0.000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.386552  normal  0.120275 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  35.06 
 
 		 204 aa  51.2  0.000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4290  transcriptional regulator, TetR family  29.73 
 
 		 226 aa  51.2  0.000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000567463  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 226 aa  50.8  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3576  TetR-like virulence regulator  32.93 
 
 		 207 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4360  regulatory protein TetR  34.48 
 
 		 200 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3293  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 200 aa  51.2  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000151669  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3095  transcriptional regulator, TetR family  47.83 
 
 		 192 aa  50.8  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000942813  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 332 aa  51.2  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1034  TetR family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 204 aa  50.8  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1103  transcriptional regulator, TetR family  23.44 
 
 		 248 aa  51.2  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.575371  normal  0.523139 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4072  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 204 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.404237  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>